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2012 年度 実施状況報告書

双生児の検査成績に基づく臨床検査値への環境因子寄与率の解明

研究課題

研究課題/領域番号 24590695
研究種目

基盤研究(C)

研究機関大阪大学

研究代表者

渡邉 幹夫  大阪大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (50294088)

研究期間 (年度) 2012-04-01 – 2015-03-31
キーワードエピゲノム / 双生児 / 遺伝因子 / 環境因子 / メチル化
研究概要

大阪大学大学院医学系研究科附属ツインリサーチセンターのサンプリングプロジェクトとの共同で、平成24年度末現在、120組240名の双生児のゲノムおよび血清等サンプリングが完了している。また、これらのサンプルについて、代表的な臨床検査項目の測定が完了しており、基本的な解析対象データは蓄積されている。また、生体検査として身長や体重などの基本的なデータと、検尿や骨密度、頸動脈エコー等を行った。
あわせて、被験者の病歴や治療歴、あるいは食事栄養調査や生活習慣調査などの疫学的データも蓄積されている。さらに、気分調査や性格調査などのメンタルな部分の調査データの蓄積も試みている。
現在、これらのデータを体系的に整理し、臨床検査項目に及ぼす遺伝因子寄与率と環境因子寄与率を解析するためのプレリミナリーな検討を行っており、ACEモデリングによる解析が可能なデータ体系であることを確認しているが、ACE解析に必要な二卵性双生児の比率が必ずしも多くないために、信頼性のおけるACEモデリング解析を行うにはさらにサンプル数の蓄積が必要と判断された。
あわせて、ゲノムサンプルよりCpGのメチル化状態を解析したデータの提供をうけ、双生児ペア間でのメチル化率の相違を解析できるよう準備をしている。具体的には、約46万か所のCpG部位のメチル化率について、CpGアイランド領域、プロモータ領域などのアノテーションごとのグループにわけ、グループ内でのメチル化率を解析できるように再構成を行っている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

サンプルは120組240名であり、順調に収集できている。
しかしながら、ACEモデリング解析を行うためには一卵性双生児と二卵性双生児がどちらもある程度のサンプル数必要であるのに対し、二卵性双生児のサンプル数が低く、信頼性のおけるACE解析を行うためにはさらに二卵性双生児サンプルの割合を増やす必要がある。

今後の研究の推進方策

二卵性双生児サンプルをさらに積極的に収集する。また収集したサンプルについて得られた臨床検査値、あるいは疫学データを体系的に整理したうえで、Discordantなペアについてペアのふたりの間にどのような疫学的な差異が存在するかを解明し、ゲノムのエピジェネティックな変化についても同様にペアのふたりの間で差がないかを解析する。最終的には。生活習慣や環境がゲノムのエピジェネティックな変化にどのように影響しているかを解明し、環境因子が身体に与える影響を定量的に計測できるようにする。

次年度の研究費の使用計画

研究を進めていく上で必要に応じて研究費を執行したため当初の見込み額と執行額は異なったが、研究計画に変更はなく、前年度の研究費も含め、当初予定通りの計画を進めていく。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2013 2012

すべて 雑誌論文 (5件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (2件)

  • [雑誌論文] Genes that characterize T3-predominant Graves' thyroid tissues2013

    • 著者名/発表者名
      Matsumoto, C., Ito, M., Yamada, H., Yamakawa, N., Yoshida, H., Date, A., Watanabe, M., Hidaka, Y., Iwatani, Y.
    • 雑誌名

      Europian Journal of Endocrinology

      巻: 168(2) ページ: 137-144

    • DOI

      doi: 10.1530/EJE-12-0507

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The association between a functional polymorphism in the CD24 gene and the development of autoimmune thyroid diseases2013

    • 著者名/発表者名
      Inoue, N., Watanabe, M., Hayashi F., Hidaka, Y., Iwatani, Y.
    • 雑誌名

      Tissue Antigen

      巻: in press ページ: in press

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Functional polymorphisms in TBX21 and HLX are associated with development and prognosis of Graves' disease2012

    • 著者名/発表者名
      Morita, M., Watanabe, M., Inoue, N., Inaoka, C., Akamizu, T., Tatsumi, K., Hidaka, Y., Iwatani, Y.
    • 雑誌名

      Autoimmunity

      巻: 45(2) ページ: 129-136

    • DOI

      doi: 10.3109/08916934.2011.622013

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Associations between autoimmune thyroid disease prognosis and functional polymorphisms of susceptibility genes, CTLA4, PTPN22, CD40, FCRL3, and ZFAT, previously revealed in Genome-wide association studies2012

    • 著者名/発表者名
      Inoue, N. Watanabe, M., Yamada, H., Takemura, K., Hayashi, F., Yamakawa, N., Akahane, M., Shimizuishi, Y., Hidaka, Y., Iwatani, Y.
    • 雑誌名

      Journal of Clinical Immunology

      巻: 32(6) ページ: 1243-1252

    • DOI

      doi: 10.1007/s10875-012-9721-0

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Association ofpolymorphisms in DNMT1, DNMT3A, DNMT3B, MTHFR, and MTRR genes with global DNA methylation levels and prognosis of autoimmune thyroid disease2012

    • 著者名/発表者名
      Arakawa,Y., Watanabe, M., Inoue, N., Sarumaru, M., Hidaka, Y., Iwatani, Y.
    • 雑誌名

      Clinical and Experimental Immunology

      巻: 70(2) ページ: 194-201

    • DOI

      doi: 10.1111/j.1365-2249.2012.04646.x

    • 査読あり
  • [学会発表] 自己免疫性甲状腺疾患の病態予後と全ゲノム関連解析による疾患関連遺伝子であるCTLA4, PTPN22, CD40, FCRL3, ZFAT遺伝子の機能的多型との関係2012

    • 著者名/発表者名
      渡邉幹夫、井上直哉、山田宏哉、武村和哉、林文明、山川法子、赤羽舞子、清水石裕、日高洋、岩谷良則
    • 学会等名
      第19回日本遺伝子診療学会大会
    • 発表場所
      三井ガーデンホテル千葉(千葉)
    • 年月日
      20120728-20120728
  • [学会発表] Functional polymorphisms in TBX21 and HLX are associated with development and prognosis of Graves' disease2012

    • 著者名/発表者名
      Watanabe, M., Morita, M., Inoue, N., Inaoka, C., Akamizu, T., Tatsumi, K., Hidaka, Y., Iwatani, Y.
    • 学会等名
      AACC Annual Meeting & Clinical Lab Expo 2012
    • 発表場所
      Los Angeres(アメリカ)
    • 年月日
      20120718-20120718

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公開日: 2014-07-24  

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