多次元プロテオミクスによる細胞内パスウェイ構造決定法の確立

2015 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 25290078
• 研究機関: 九州大学
• 研究代表者: 松本 雅記 九州大学, 生体防御医学研究所, 准教授 (60380531)
• 研究期間 (年度): 2013-04-01 – 2016-03-31
• キーワード: プロテオミクス / シグナル伝達

研究実績の概要

本研究の目的は、われわれが最近開発した画期的な次世代定量プロテオミクス技術を用いたタンパク質絶対量計測法（従来のウェスタンブロット法と比して1万倍の効率を誇る）を駆使して生命システムを構成するパスウェイ構造を決定することである。近年、膨大な生命科学研究の知見を元に各パスウェイのモデル化がなされているが、これは異なる条件下の知見を統合したものであり、必ずしも現実の状態を反映しているわけではない。本研究では、パスウェイ・モデルを実体化するために、タンパク質絶対量計測によるパスウェイ構造の決定と、様々な条件下でのパスウェイ構成成分間の相互作用やリン酸化の定量的解析によるモデルの拡充と検証を行う。
H27年度は様々な細胞株を対象にリン酸化プロテオーム情報の取得を実施し、データベース化し、前年度までに構築したタンパク質の絶対定量法と組み合わせることでパスウェイ構造決定の技術基盤を完成させた。さらに、これを各種細胞株に適用することで、細胞内に存在するシグナル伝達経路の定量的なパスウェイ構造情報を取得することに成功した。

現在までの達成度 (段落)

27年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

27年度が最終年度であるため、記入しない。

次年度使用額が生じた理由

27年度が最終年度であるため、記入しない。

次年度使用額の使用計画

27年度が最終年度であるため、記入しない。

研究成果

• [雑誌論文] Akt1-mediated Gata3 phosphorylation controls the repression of IFNγ in memory-type Th2 cells. (2016)
  • 著者名/発表者名: Hosokawa H, Tanaka T, Endo Y, Kato M, Shinoda K, Suzuki A, Motohashi S, Matsumoto M, Nakayama KI, Nakayama T.
  • 雑誌名: Nat Commun. 巻: 7 ページ: 11289
  • DOI: DOI: 10.1038/ncomms11289
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Identification of low-abundance proteins in serum via the isolation of HSP72 complexes. (2016)
  • 著者名/発表者名: Tanaka M, Shiota M, Nakao T, Uemura R, Nishi S, Ohkawa Y, Matsumoto M, Yamaguchi M, Osada-Oka M, Inagaki A, Takahashi K, Nakayama KI, Gi M, Izumi Y, Miura K, Iwao H.
  • 雑誌名: J Proteomics. 巻: 136 ページ: 214-221
  • DOI: 10.1016/j.jprot.2016.01.008.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Truncation mutants of ASXL1 observed in myeloid malignancies are expressed at detectable protein levels. (2016)
  • 著者名/発表者名: Inoue D, Matsumoto M, Nagase R, Saika M, Fujino T, Nakayama KI, Kitamura T.
  • 雑誌名: Exp Hematol. 巻: 44 ページ: 172-176.e1
  • DOI: 10.1016/j.exphem.2015.11.011.
  • 査読あり
• [雑誌論文] UV Damage-Induced Phosphorylation of HBO1 Triggers CRL4DDB2-Mediated Degradation To Regulate Cell Proliferation. (2015)
  • 著者名/発表者名: Matsunuma R, Niida H, Ohhata T, Kitagawa K, Sakai S, Uchida C, Shiotani B, Matsumoto M, Nakayama KI, Ogura H, Shiiya N, Kitagawa M.
  • 雑誌名: Mol Cell Biol. 巻: 36 ページ: 394-406
  • DOI: 10.1128/MCB.00809-15.
  • 査読あり
• [雑誌論文] Tissue-specific expression of histone H3 variants diversified after species separation. (2015)
  • 著者名/発表者名: Maehara K, Harada A, Sato Y, Matsumoto M, Nakayama KI, Kimura H, Ohkawa Y.
  • 雑誌名: Epigenetics Chromatin. 巻: 8 ページ: 35
  • DOI: 10.1186/s13072-015-0027-3
  • 査読あり
• [学会発表] 大規模定量プロテオミクスで挑むがん代謝の実体解明 (2015)
  • 著者名/発表者名: 松本 雅記、中山 敬一
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会/第88回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2015-12-01 – 2015-12-04
• [学会発表] ハイスループットかつ精密な定量プロテオームのための試料調整法開発 (2015)
  • 著者名/発表者名: 松本 雅記
  • 学会等名: 日本プロテオーム学会年会
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2015-07-23 – 2015-07-24