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2019 Fiscal Year Annual Research Report

International Activities Supporting Group for Nascent Chain Biology

International

Project AreaNascent-chain Biology
Project/Area Number 15K21743
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

田口 英樹  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 教授 (40272710)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 稲田 利文  東北大学, 薬学研究科, 教授 (40242812)
田中 元雅  国立研究開発法人理化学研究所, 脳神経科学研究センター, チームリーダー (40321781)
河野 憲二  奈良先端科学技術大学院大学, 研究推進機構, 特任教授 (50142005)
藤木 幸夫  九州大学, 生体防御医学研究所, 特任教授 (70261237)
Project Period (FY) 2015-11-06 – 2020-03-31
Keywords新生鎖 / フォールディング / リボソーム / シャペロン / 翻訳
Outline of Annual Research Achievements

【田口】新生ポリペプチド鎖(新生鎖)が細胞内で合成されてくるようすを直接可視化する新規の手法(NCT)についてコロラド州立大学と共同研究を実施した。このNCT法を用いることで、神経変性疾患に関わる非典型的な翻訳現象であるリピート関連非AUG翻訳の生細胞での可視化に一部成功した。
【河野】XBP1uがリボソームトンネル内で翻訳アレストを起こした時の立体構造をミュンヘン大学との共同研究でクライオ電子顕微鏡を用いて解析した。この結果、一時的な翻訳アレストにおけるリボソームトンネルと新生鎖の相互作用が明らかとなった。
【田中】複雑な複数のヘアピン構造を含むmRNAを光ピンセットで引っ張った結果、予想通りにヘアピン構造が壊れるシグナルがきれいに見られ、実験系を確立させた。また、ヒト翻訳システムを使い、光ピンセットによって1分子の新生ポリペプチド鎖を引っ張ることに成功した。
【稲田】ミュンヘン大学との共同研究により、品質管理RQCによって認識される異常翻訳の実体を解明した(EMBO J, 2019)。さらに新規品質管理因子RQT1が、特異的な翻訳停止状態のリボソームを認識しユビキチン化する反応を試験管内で再現した(NSMB, 2020)。
【藤木】ペルオキシソーム局在性カタラーゼのサイトゾルへの局在化による酸化ストレス応答機構を発見(Stanford大学:Cell Reports 2019)。b)プラスマローゲン合成障害マウスの小脳では、ペルオキシソーム局在性TAのFar1の増加とともに、ミエリン形成が障害される病態発症機構を解明(Wien医科大学:J. Biochem. 2019)。c) TAタンパク質Pex26pのF51P変異によるペルオキシソームタンパク質の輸送低下が聴覚低下・損失の病因となることを見出した(Columbia大学: Cold Spring Harb. Mol. Case Stud. 2019)。

Research Products

(14 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research Journal Article Presentation

  • [Int'l Joint Research] Ludwig-Maximilians-Universitat Munchen(ドイツ)

    • Country Name
      ドイツ
    • Counterpart Institution
      Ludwig-Maximilians-Universitat Munchen
  • [Int'l Joint Research] Colorado State University/Stanford University/Columbia University(米国)

    • Country Name
      米国
    • Counterpart Institution
      Colorado State University/Stanford University/Columbia University
  • [Int'l Joint Research] Utrecht University(オランダ)

    • Country Name
      オランダ
    • Counterpart Institution
      Utrecht University
  • [Int'l Joint Research] ウイーン医科大学(オーストリア)

    • Country Name
      オーストリア
    • Counterpart Institution
      ウイーン医科大学
  • [Journal Article] Systematic Identification of Regulators of Oxidative Stress Reveals Non-canonical Roles for Peroxisomal Import and the Pentose Phosphate Pathway2020

    • Author(s)
      Dubreuil Michael M.、Morgens David W.、Okumoto Kanji、Honsho Masanori、Contrepois Kevin、Lee-McMullen Brittany、Traber Gavin McAllister、Sood Ria S.、Dixon Scott J.、Snyder Michael P.、Fujiki Yukio、Bassik Michael C.
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 30 Pages: 1417~1433.e7

    • DOI

      doi: 10.1016/j.celrep.2020.01.013

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structure and function of Vms1 and Arb1 in RQC and mitochondrial proteome homeostasis2019

    • Author(s)
      Su Ting、Izawa Toshiaki、Thoms Matthias、Yamashita Yui、Cheng Jingdong、Berninghausen Otto、Hartl F. Ulrich、Inada Toshifumi、Neupert Walter、Beckmann Roland
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 570 Pages: 538~542

    • DOI

      doi: 10.1038/s41586-019-1307-z

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Collided ribosomes form a unique structural interface to induce Hel2‐driven quality control pathways2019

    • Author(s)
      Ikeuchi Ken、Tesina Petr、Matsuo Yoshitaka、Sugiyama Takato、Cheng Jingdong、Saeki Yasushi、Tanaka Keiji、Becker Thomas、Beckmann Roland、Inada Toshifumi
    • Journal Title

      The EMBO Journal

      Volume: 38 Pages: e100276

    • DOI

      doi: 10.15252/embj.2018100276

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural and mutational analysis of the ribosome-arresting human XBP1u2019

    • Author(s)
      Shanmuganathan Vivekanandan、Schiller Nina、Magoulopoulou Anastasia、Cheng Jingdong、Braunger Katharina、Cymer Florian、Berninghausen Otto、Beatrix Birgitta、Kohno Kenji、von Heijne Gunnar、Beckmann Roland
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 8 Pages: e46267

    • DOI

      10.7554/eLife.46267

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Impaired plasmalogen synthesis dysregulates liver X receptor-dependent transcription in cerebellum2019

    • Author(s)
      Honsho Masanori、Dorninger Fabian、Abe Yuichi、Setoyama Daiki、Ohgi Ryohei、Uchiumi Takeshi、Kang Dongchon、Berger Johannes、Fujiki Yukio
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 166 Pages: 353~361

    • DOI

      doi: 10.1093/jb/mvz043

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Large-scale analysis of diffusional dynamics of proteins in living yeast cells using fluorescence correlation spectroscopy2019

    • Author(s)
      Fukuda Takafumi、Kawai-Noma Shigeko、Pack Chan-Gi、Taguchi Hideki
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 520 Pages: 237~242

    • DOI

      doi: 10.1016/j.bbrc.2019.09.066

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] XBP1u translational pausing requires the interaction between own nascent chain and uL42019

    • Author(s)
      大古殿 美加
    • Organizer
      第71回日本細胞生物学会
  • [Presentation] 重複機能ドメインの解析から得られたXBP1遺伝子の起源と進化2019

    • Author(s)
      小池 雅昭
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] XBP1u翻訳休止におけるリボソームタンパク質uL4の関与2019

    • Author(s)
      大古殿 美加
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] ヒト細胞小胞体機能の低下を鋭敏に検出するレポーターの開発と応用2019

    • Author(s)
      八巻 聡
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会

URL: 

Published: 2021-01-27  

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