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2016 Fiscal Year Annual Research Report

感覚入力特異的なスクラップ&ビルドによる大脳皮質内の多細胞ネットワーク形成機構

Planned Research

Project AreaDynamic regulation of brain function by Scrap & Build system
Project/Area Number 16H06460
Research InstitutionNational Institute for Physiological Sciences

Principal Investigator

吉村 由美子  生理学研究所, 基盤神経科学研究領域, 教授 (10291907)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山本 亘彦  大阪大学, 生命機能研究科, 教授 (00191429)
Project Period (FY) 2016-06-30 – 2021-03-31
Keywords大脳皮質視覚野 / 方位選択性 / 発達 / 神経活動依存的マーカー / RNAシークエンス
Outline of Annual Research Achievements

大脳皮質視覚野では、生まれ育った環境に適した視覚機能を獲得するために、発達早期に一旦形成されたネットワークが、発達後期の視覚体験に基づいたシナプスのスクラップ&ビルドにより再編される。その過程で生じる機能と神経回路再編の分子機構を明らかにするために、平成28年度は方位選択性形成の分子機構に着目した。これまでの生理学的な研究から、個々の視覚野ニューロンの方位選択性は視覚体験以前から存在するが(遺伝的メカニズム)、視覚体験によって変化し得る(後天的メカニズム)ことが明らかになっている。本研究では、最初にこの遺伝的メカニズムの分子機構を解明し、次にそれが環境刺激、自発的神経活動によって修飾される機構の解明を目指すことにした。
遺伝的メカニズム解明のために、予めArc-Venusを視覚野に遺伝子導入したラットに縦縞の視覚刺激を加えることにより、縦縞に反応する視覚野ニューロンをin vivoで標識した後、視覚野脳切片上でVenus陽性の細胞と陰性の細胞をパッチピペットにより集め、それらからRNAを抽出し、それぞれをRNA-seq解析にかけて遺伝子発現を調べた。最初にパッチピペットで細胞を吸引し、そこからRNA抽出、引き続くcDNA合成・増幅、次世代シーケンサによる解析の実験的手法の確立を目指した。まず、数個の細胞を吸引し、それらからまとめて処理して、その達成度を確かめた。その結果、パッチピペットの口径を通常の電気生理学的な実験に用いるものより広く設定させることにより、標識された細胞だけを効率的にピペット内に吸引する条件が決定された。それに基づいて、数個の細胞だけからRNA-seq解析ができる技術が確立された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

特定の方位選択性を有する視覚野を蛍光タンパク質で標識する技法、ならびに少数の標識細胞を採取しその遺伝子発現を調べる方法論が確立し、概ね予定通りの進捗状況である。

Strategy for Future Research Activity

少数の視覚野細胞からの遺伝子発現の解析手法を確立できたが、実験の本質的な精度をあげるためにシングルセルRNA-seqを行うことを目指す。

  • Research Products

    (12 results)

All 2017 2016

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Activity-dependent dynamics of the transcription factor CREB in cortical neurons revealed by single-molecule imaging2017

    • Author(s)
      Kitagawa H, Sugo N, Morimatsu M, Arai Y, Yanagida T, Yamamoto N
    • Journal Title

      J Neurosci

      Volume: 37 Pages: 1-10

    • DOI

      https://doi.org/10.1523/JNEUROSCI.0943-16.2016

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Establishment of high reciprocal connectivity between clonal cortical neurons is regulated by the Dnmt3b DNA methyltransferase and clustered protocadherins2016

    • Author(s)
      Tarusawa Etsuko、Sanbo Makoto、Okayama Atsushi、Miyashita Toshio、Kitsukawa Takashi、Hirayama Teruyoshi、Hirabayashi Takahiro、Hasegawa Sonoko、Kaneko Ryosuke、Toyoda Shunsuke、Kobayashi Toshihiro、Kato-Itoh Megumi、Nakauchi Hiromitsu、Hirabayashi Masumi、Yagi Takeshi、Yoshimura Yumiko
    • Journal Title

      BMC Biology

      Volume: 14 Pages: 103

    • DOI

      10.1186/s12915-016-0326-6

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Visualization of HDAC9 Spatiotemporal Subcellular Localization in Primary Neuron Cultures2016

    • Author(s)
      Sugo Noriyuki、Yamamoto Nobuhiko
    • Journal Title

      Methods Mol Biol

      Volume: 1436 Pages: 119~127

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-3667-0_9

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] High reciprocal connectivity between clonal cortical neurons is established under the guidance of epigenetic regulation2016

    • Author(s)
      Tarusawa E, Sanbo M, Okayama A, Miyashita T, Kitsukawa T, Hirayama T, Hirabayashi T, Hasegawa S, Hirabayashi M, Yagi T, Yoshimura Y
    • Organizer
      Society of Neuroscience 2016
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Experience-dependent maturation of neural circuits and functions in the secondary visual cortex of rats2016

    • Author(s)
      Yoshimura Y
    • Organizer
      The 39th Annual Meeting of the Japan Neuroscience Society
    • Invited
  • [Presentation] Experience-dependent development of fine-scale networks and feature-selective synchronization in the visual cortex2016

    • Author(s)
      Yoshimura Y
    • Organizer
      International Symposium 2016 ‘Circuit Construction in the Mammalian Brain’
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Visual experience-dependent and independent development of visually-evoked synchronized firing in rat visual cortex2016

    • Author(s)
      Ishikawa AW, Komatsu Y, Yoshimura Y
    • Organizer
      The 39th Annual Meeting of the Japan Neuroscience Society
  • [Presentation] Synaptic connections are preferentially formed between cortical pyramidal neurons with similar orientation preference in both layers 2/3 and 5.2016

    • Author(s)
      Karaki T, Kim R, Bito H, Yoshimura Y
    • Organizer
      The 39th Annual Meeting of the Japan Neuroscience Society
  • [Presentation] Positive and negative regulation of activity-dependent axon branching in the developing cortex2016

    • Author(s)
      Yamamoto N
    • Organizer
      The 39th Annual Meeting of the Japan Neuroscience society
    • Invited
  • [Presentation] Positive and negative regulators for activity-dependent thalamocortical axon branching2016

    • Author(s)
      Yamamoto N
    • Organizer
      International Symposium 2016 ‘Circuit Construction in the Mammalian Brain’
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Positive and negative mechanisms of activity-dependent circuit formation in the developing cortex2016

    • Author(s)
      Yamamoto N
    • Organizer
      Molecular Neurobiology Program Seminar in New York University
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] DNA polymerase β function in neural progenitors is required for postmitotic neuronal survival and differentiation in the developing cortex2016

    • Author(s)
      Ohnishi, K., Sugo, N., Toyoda, S., Hirayama, T., Yagi, T., Yamamoto, N.
    • Organizer
      The 39th Annual Meeting of the Japan Neuroscience Society

URL: 

Published: 2018-12-17  

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