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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Feedback regulation of photosynthetic electron transfer by promo motive force

Planned Research

Project AreaNew Photosynthesis : Reoptimization of the solar energy conversion system
Project/Area Number 16H06554
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

高橋 裕一郎  岡山大学, 異分野基礎科学研究所, 教授 (50183447)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 坂本 亘  岡山大学, 資源植物科学研究所, 教授 (20222002)
田中 亮一  北海道大学, 低温科学研究所, 准教授 (20311516)
伊福 健太郎  京都大学, 生命科学研究科, 助教 (50359783)
Project Period (FY) 2016-06-30 – 2021-03-31
Keywords光合成電子伝達系 / プロトン駆動力 / 光化学系複合体 / 光阻害 / 光損傷修復 / フィードバック制御 / シトクロムb6f複合体 / プロトンチャネル
Outline of Annual Research Achievements

光合成電子伝達系の活性のプロトン駆動力によるフィードバック制御の分子機構を解明するため、光化学系IIの酸素発生系から発生するプロトンの排出チャネルの同定、チラコイド膜ルーメンの酸性化によりシトクロムb6f複合体と光化学系IIの電子伝達活性の制御に関与するアミノ酸残基の同定、および電子伝達系の成分の光損傷と修復の機構に関与する因子の同定を進めるための形質転換ベクターと抗体の作成、光化学系II酸素発生系の表在性タンパク質の再構成系の構築などを進めた。
光化学系II複合体の結晶構造から推定された葉緑体遺伝子にコードされるPsbA、PsbB、PsbC、PsbDと核にコードされるPsbO、PsbP、PsbQのプロトン排出チャネルに関与するアミノ酸残基を特異的に置換した形質転換ベクターを開発し、すでに幾つかの形質転換体を緑藻クラミドモナスで作出した。シトクロムb6f複合体の結晶構造から推定された葉緑体遺伝子にコードされるPetA、PetB、PetDと核遺伝子にコードされるPetCを形質転換するベクターを開発した。幾つかの形質転換体は作出中である。
光損傷を受けた光化学系II複合体の修復に必須なFtsHプロテアーゼのリン酸化による活性調節機構を解明するため、リン酸化された部位の同定を質量分析機(LC-MS/MS)で進めた。さらに、損傷修復の過程で必須なクロロフィルを結合するタンパク質の置き換えを促進する因子の同定を免疫沈降法などの手法を用いて進めた。
光化学系I複合体の生合成の分子機構の解析を進めた。葉緑体遺伝子にコードされる光化学系I複合体の生合成に必須な因子Ycf3とYcf4に着目して、Ycf3およびYcf4にタグを融合した形質転換体から光化学系I複合体の分子集合成装置の単離を進めた。さらにFe-Sクラスターの合成にSufBCDタンパク質が重要であることを明らかにした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

光化学系IIとシトクロムb6f複合体のプロトンチャネルやルーメンの酸性化により制御を受けるアミノ酸を置換するための形質転換ベクターの作成に成功している。また、これまでに解明が遅れていた光化学系I複合体の分子集合装置と考えられるYcf3とYcf4 を含む標品のアフィニティ精製に成功し、分子集合装置の解明の突破口を開いた。
光化学系Iの構築に必須であるFe-Sクラスターの合成について研究をすすめ、SufBCDタンパク質が葉緑体のFe-S合成のscaffoldであるという仮説を裏付けるデータをRNAi植物の研究によって得ることができた。また、光化学系IIの構築や修復にLIL6やHCF173タンパク質が必須であるというデータを得ることができた。
光化学系IIの光阻害と修復に関わる素因としてチラコイド膜タンパク質リン酸化に着目し、Phos-tagを用いたリン酸化検出システムを確立した。加えて、D1タンパク質分解の主要因子であるFtsHがリン酸化されることを明らかにした。
大腸菌で発現精製した組換えPsbPと、ホウレンソウ由来の光化学系II (PSII) 膜を用いたin vitro再構成実験により、酸素発生反応中心からのプロトン輸送経路近傍のアミノ酸残基の役割を解析した。また、クラミドモナスPsbP欠損株へのpsbP遺伝子の形質転換により、PSIIの機能相補に成功し、変異PsbPのin vivo機能解析を行うとともに、導入したPsbP-Hisを利用してPSII-LHCII超複合体をアフィニティ精製できた。

Strategy for Future Research Activity

(1)光化学系IIの葉緑体遺伝子にコードされるPsbA、PsbB、PsbC、PsbDと核にコードされるPsbO、PsbP、PsbQのアミノ酸残基を特異的に置換できる形質転換ベクターを用いて、プロトンチャネルやルーメンの酸性化による電子伝達活性を制御するアミノ酸残基を置換した形質転換体を網羅的に作出する。(2)シトクロムb6f複合体の葉緑体遺伝子にコードされるPetA、PetB、PetDと核遺伝子にコードされるPetCを形質転換するベクターを用いて、プロトンチャネルやルーメンの酸性化による電子伝達活性を制御するアミノ酸残基を置換した形質転換体を網羅的に作出する。(3)Phos-tag法によるリン酸化タンパク質の網羅的解析をグラナ空間別に解析し、リン酸化と光阻害の新たな側面を明らかにする。さらに、FtsHのリン酸化部位を決定して変異を導入し、PSII修復とD1分解への影響を今後詳しく調べる。(4)すでに単離したYcf3およびYcf4を主にに含む光化学系I複合体の分子集合装置の詳細な解析を進める。(5)光化学系IIの構築に必要なタンパク質の同定をさらに進めるとともに、RNAiを用いてこれらのタンパク質の機能解析をさらに進める。また、光化学系の構築におけるクロロフィル合成酵素の役割に関する研究をRNAiやPull Down法を用いてさらに進めていく。(6)in vitro再構成実験とクラミドモナス形質転換系を併用して、膜表在性タンパク質とPSIIの相互作用が水分解ー酸素発生反応に及ぼす影響を継続して解析する。加えて、PsbPとPsbQについては、分子進化の観点から緑色植物で独自に発達したホモログの機能解明も行う。

  • Research Products

    (34 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Acknowledgement Compliant: 6 results,  Open Access: 2 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 3 results) Book (2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Muenster(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      University of Muenster
  • [Int'l Joint Research] Institute de Biologie Physico-Chimique(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      Institute de Biologie Physico-Chimique
  • [Int'l Joint Research] University of Hyderabad(インド)

    • Country Name
      INDIA
    • Counterpart Institution
      University of Hyderabad
  • [Int'l Joint Research] コーネル大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      コーネル大学
  • [Int'l Joint Research] Shanghai Center for Plant Stress Biology(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      Shanghai Center for Plant Stress Biology
  • [Int'l Joint Research]

    • # of Other Countries
      1
  • [Journal Article] The functional accumulation of antenna proteins in chlorophyll b-less mutants of Chlamydomonas2017

    • Author(s)
      S. Bujaldon, N. Kodama, F. Rappaport, R. Subramanyam, C. de Vitry, Y. Takahashi and F.-A. Wollman
    • Journal Title

      Molecular Plant

      Volume: 10 Pages: 115-130

    • DOI

      10.1016/j.molp.2016.10.001

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Essentials of proteolytic machineries in chloroplasts.2017

    • Author(s)
      Nishimura, K., Kato, Y., and Sakamoto, W.
    • Journal Title

      Molecular Plant

      Volume: 10 Pages: 4-19

    • DOI

      doi: 10.1016/j.molp.2016.08.005

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The non-Mendelian green cotyledon gene in soybean encodes a small subunit of Photosystem II.2017

    • Author(s)
      Kohzuma, K., Sato, Y., Ito, H., Okuzaki, A., Masuda, Y., Watanabe, M., Fukuoka, H., Yamatani, H., Kanazawa, A., Tabei, Y., Ikeuchi, M., Sakamoto, W., Tanaka, A., and Kusaba, M.
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 173 Pages: 2138-2147

    • DOI

      10.1104/pp.16.01589

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The iron-sulfur cluster biosynthesis protein SUFB is required for chlorophyll synthesis, but not phytochrome signaling.2017

    • Author(s)
      Hu X, Page MT, Sumida A, Tanaka A, Terry MJ and Tanaka R
    • Journal Title

      Plant journal

      Volume: 89 Pages: 1184-1194

    • DOI

      10.1111/tpj.13455

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The SUFBC2D Complex is Required for the Biogenesis of All Major Classes of Plastid Fe-S Proteins2017

    • Author(s)
      Hu X, Kato Y, Sumida A, Tanaka A and Tanaka R
    • Journal Title

      Plant journal

      Volume: 90 Pages: 235-248

    • DOI

      10.1111/tpj.13483

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Diversity in photosynthetic electron transport under CO2-limitation: the cyanobacterium Synechococcus sp. PCC7002 and green alga Chlamydomonas reinhardtii drive an O2-dependent alternative electron flow and non-photochemical quenching of chlorophyll fluorescence during CO2-limited photosynthesis2016

    • Author(s)
      G. Shimakawa, S. Akimoto, Y. Ueno, A. Wada, K. Shaku, Y. Takahashi, and C. Miyake
    • Journal Title

      Photosynthesis Res.

      Volume: 130 Pages: 1-13

    • DOI

      10.1007/s11120-016-0253-y

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chloroplast-mediated regulation of CO2-concentrating mechanism by Ca2+-binding protein CAS in the green alga Chlamydomonas reinhardtii2016

    • Author(s)
      L. Wang, T. Yamano, S. Takane, Y. Niikawa, C. Toyokawa, S. Ozawa, R. Tokutsu, Y. Takahashi, J. Minagawa, Y. Kanesaki, H. Yoshikawa, and H. Fukuzawa
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      Volume: 113 Pages: 12586-12591

    • DOI

      10. 1073/pnas.1606519113/-/DCSupplemental

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Grana-localized proteins, RIQ1 and RIQ2, affect the organization of light-harvesting vomplex II and grana stacking in Arabidopsis.2016

    • Author(s)
      Ryo Yokoyama, Hiroshi Yamamotoa, Maki Kondo, Satomi Takeda, Kentaro Ifuku, Yoichiro Fukao, Yasuhiro Kamei, Mikio Nishimura,Toshiharu Shikanai
    • Journal Title

      Plant Cell

      Volume: 28 Pages: 2261-2275

    • DOI

      http://dx.doi.org/10.1105/tpc.16.00296

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] VIPP1 has a disordered C-terminal tail necessary for protecting photosynthetic membranes against stress.2016

    • Author(s)
      Zhang, L., Kondo, H., Kamikubo, H., Kataoka, M., and Sakamoto, W.
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 171 Pages: 1983-1995

    • DOI

      doi: 10.1104/pp.16.00532

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Allocation of Heme Is Differentially Regulated by Ferrochelatase Isoforms in Arabidopsis Cells.2016

    • Author(s)
      Espinas, N. A., Kobayashi, K., Sato, Y., Mochizuki, N., Takahashi, K., Tanaka, R., & Masuda, T.
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 7 Pages: e0144

    • DOI

      https://doi.org/10.3389/fpls.2016.01326

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Functional analysis of the mutated PsbP in photosystem II using Chlamydomonas mutant complemented with exogenous PsbP protein2017

    • Author(s)
      西村太志、佐藤文彦、伊福健太郎
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学、鹿児島
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] 葉の老化及び栄養飢餓応答におけるオルガネラヌクレアーゼDPD1によるオルガネラDNA分解の生理学的意義2017

    • Author(s)
      高見常明・大西紀和・栗田悠子・岩村青子・三村徹郎・坂本亘
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] 在来たかきび由来のRIl集団を用いたステイグリーンQTLの解析2017

    • Author(s)
      ワシラフィオナ・大西紀和・小童谷利恵・鐘ケ江弘美・高梨秀樹・藤本優・石森元幸・岩田洋佳・草場信・堤伸浩・坂本亘
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] C4種Flaveria bidentisにおけるRETICULATA-RELATED3の局在解析2017

    • Author(s)
      花田裕昭・谷口(山本)幸美・西村健司・坂本亘・古本強・宗景(中島)ゆり
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] リン酸化による葉緑体プロテアーゼFtsH機能調節の可能性2017

    • Author(s)
      加藤裕介・坂本亘
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] 光化学系IIアセンブリー因子HCF173およびLIL6は光化学系IIの修復に関与するか?2017

    • Author(s)
      坂田啓、秋山雄希、高林厚史、明賀史純、篠崎一雄、田中歩、田中 亮一
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会大会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] シロイヌナズナにおける ELIPの機能解析2017

    • Author(s)
      秋山雄希、横野牧生、秋本誠志、田中歩、田中亮一
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会大会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Year and Date
      2017-03-16 – 2017-03-18
  • [Presentation] 合成の水分解-酸素発生反応の制御機構 ~植物が進化の過程で得たもの~2016

    • Author(s)
      伊福健太郎
    • Organizer
      2016年度 33rd O-say Open Seminar
    • Place of Presentation
      中部大学, 愛知
    • Year and Date
      2016-09-26 – 2016-09-26
    • Invited
  • [Presentation] ソルガムのRIL系統を用いたステイグリーン形質のQTL解析.2016

    • Author(s)
      Fiona Wahinya・小童谷利恵・鐘ケ江弘美・高梨秀樹・藤本 優・石森元幸・小林正明・矢野健太郎・大西紀和・岩田洋佳・草場 信・堤 伸浩・坂本 亘.
    • Organizer
      第130回日本育種学会年会
    • Place of Presentation
      鳥取
    • Year and Date
      2016-09-23 – 2016-09-24
  • [Presentation] Chlorophyll metabolism: a crossroad of photosynthesis and plant defense against insect herbivores2016

    • Author(s)
      Ryouichi Tanaka
    • Organizer
      Finnish-Japanese symposium 2016
    • Place of Presentation
      Saariselk, Finland
    • Year and Date
      2016-09-05 – 2016-09-10
    • Invited
  • [Presentation] Functional complementation and purification of photosystem II with His-tagged PsbP protein in Chlamydomonas reinhardtii2016

    • Author(s)
      Taishi Nishimura, Fumihiko Sato, Kentaro Ifuku
    • Organizer
      The 17th Congress on Photosynthesis Research
    • Place of Presentation
      Maastricht, The Netherlands
    • Year and Date
      2016-08-07 – 2016-08-12
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Multiple interactions of the PsbP protein regulate the electron transfer within photosystem II2016

    • Author(s)
      Kentaro Ifuku, Taishi Nishimura, Ryo Nagao, Jon Nield, Kunio Ido, Takumi Noguchi, Fumihiko Sato
    • Organizer
      The 17th Congress on Photosynthesis Research
    • Place of Presentation
      Maastricht, The Netherlands
    • Year and Date
      2016-08-07 – 2016-08-12
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Functional analysis of PsbQ-Like protein 3 (PQL3) in the chloroplast NAD(P)H dehydrogenase-like complex in Arabidopsis2016

    • Author(s)
      Yuki Yokoe, Wataru Nakamura, Shinya Yabuta, Fumihiko Sato, Kentaro Ifuku
    • Organizer
      The 17th Congress on Photosynthesis Research
    • Place of Presentation
      Maastricht, The Netherlands
    • Year and Date
      2016-08-07 – 2016-08-12
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structure of extrinsic subunit PsbP of photosystem II investigated by PELDOR2016

    • Author(s)
      Hiroyuki Mino, Mizue Asada, Taishi Nishimura, Fumihiko Sato, Kentaro Ifuku
    • Organizer
      The 17th Congress on Photosynthesis Research
    • Place of Presentation
      Maastricht, The Netherlands
    • Year and Date
      2016-08-07 – 2016-08-12
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Functional analysis of OHP1 and LIL8 (PSB33): Two LIL proteins involved in the assembly of photosystem II and in the connectivity of LHCs to the core complexes.2016

    • Author(s)
      Ryouichi Tanaka
    • Organizer
      17th International Congress on Photosynthesis Research
    • Place of Presentation
      Maastricht, The Netherlands
    • Year and Date
      2016-08-07 – 2016-08-12
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 高等植物型の光化学系IIの立体構造~膜表在性タンパク質の配置と機能~2016

    • Author(s)
      伊福健太郎
    • Organizer
      第31回OCARINAセミナー
    • Place of Presentation
      大阪市立大学 複合先端研究機構, 大阪
    • Year and Date
      2016-08-01 – 2016-08-01
    • Invited
  • [Book] In Solar to Chemical Energy Conversion; Theory and Application, Recent Understanding on Photosystem I,2016

    • Author(s)
      Y. Takahashi
    • Total Pages
      488
    • Publisher
      Springer International Publishing
  • [Book] 光と生命の事典2016

    • Author(s)
      高橋裕一郎
    • Total Pages
      422
    • Publisher
      朝倉書店

URL: 

Published: 2018-01-16   Modified: 2022-02-01  

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