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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of the singularity cells controlling the pattern formation of multicellular system

Planned Research

Project AreaSingularity biology
Project/Area Number 18H05415
Research InstitutionThe University of Tokushima

Principal Investigator

堀川 一樹  徳島大学, 先端研究推進センター, 教授 (70420247)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 竹本 龍也  徳島大学, 先端酵素学研究所, 教授 (30443899)
Project Period (FY) 2018-06-29 – 2023-03-31
Keywords自己組織化 / 生物物理 / cAMP / ゲノム編集
Outline of Annual Research Achievements

これまでに1万細胞中10細胞ほどのリーダー細胞が信号伝達の起点として機能すること、これらは観察開始後4-6時間の間に出現することを見出している。これら少数個の細胞をイメージングにより同定するためのツールとして、超高親和性カルシウム指示薬のカラーバリアントの開発を試みた。具体的には、令和元年度に開発した緑色高感度カルシウムプローブ作成法を応用し、赤色並びに青色のカルシウムプローブであるR-GECOとB-GECOの改変を試みた。既存手法であるアミノ酸変異導入に加え、新たに分子全体の円順列変異体化を検討したところ、長鎖フレキシブルリンカーを用いた円順列変異体化により、従来は200 nM以上だった解離定数を30 nMまで向上させた超高親和性変異体を作成することに成功した。これら新規プローブを用いることで、従来は困難であった100 nM以下の細胞内Ca2+濃度変化を多色ライブイメージングできることに加え、cAMPやcGMPなど他のセカンドメッセンジャーとの同時多機能イメージングが可能になることを実証した。本技術を用いることで、1万細胞中10細胞ほどのリーダー細胞並びにフォロワー細胞を検出できるようになり、これらが信号伝達の起点として機能することを実証した。
また、細胞分裂回数カウンティングシステム開発のため、細胞周期特異的に発現変動する遺伝子と連動してゲノム編集機能が再構成されるシステムの構築を試みた。G1期特異的に加え、S/G2/M期それぞれで特異的に発現する分割Cas9系を構築することができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

超高親和性カルシウムプローブや細胞分裂回数のメモリーモジュールはともにシンギュラリティ研究の推進に必須の技術である。さらにこれらの新規技術は、がん発生や神経変性の初期動態など、これまでは研究が困難だった未踏分野に対しても応用することが期待されることから、「順調に進捗している」と判断できる。

Strategy for Future Research Activity

これまで通り、総括班並びに各計画班と強固に連携し計画研究を遂行する。特に、総括班、A01-3班と共同でcAMATERASへの1細胞ピックアップ装置の実装を進め、リーダー細胞の分取と遺伝子解析を行う。取得されるscRNAseqデータをA02各班と共同で解析する。1細胞トラッキングの自動化を可能にするため、公募班との連携も進める。

  • Research Products

    (12 results)

All 2022 2021

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 7 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] C-type Natriuretic Peptide?induced PKA Activation Promotes Endochondral Bone Formation in Hypertrophic Chondrocytes2022

    • Author(s)
      Hirota Keisho、Hirashima Tsuyoshi、Horikawa Kazuki、Yasoda Akihiro、Matsuda Michiyuki
    • Journal Title

      Endocrinology

      Volume: 163 Pages: -

    • DOI

      10.1210/endocr/bqac005

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Development of a screening system for agents that modulate taste receptor expression with the CRISPR-Cas9 system in medaka2022

    • Author(s)
      Beppu Kana、Tsutsumi Rie、Ansai Satoshi、Ochiai Nana、Terakawa Mai、Mori Marie、Kuroda Masashi、Horikawa Kazuki、Tomoi Takumi、Sakamoto Joe、Kamei Yasuhiro、Naruse Kiyoshi、Sakaue Hiroshi
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 601 Pages: 65~72

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.02.082

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] PD-1 agonism by anti-CD80 inhibits T cell activation and alleviates autoimmunity2022

    • Author(s)
      Sugiura Daisuke、Okazaki Il-mi、Maeda Takeo K.、Maruhashi Takumi、Shimizu Kenji、Arakaki Rieko、Takemoto Tatsuya、Ishimaru Naozumi、Okazaki Taku
    • Journal Title

      Nature Immunology

      Volume: 23 Pages: 399~410

    • DOI

      10.1038/s41590-021-01125-7

  • [Journal Article] JRAB/MICAL-L2 undergoes liquid-liquid phase separation to form tubular recycling endosomes2021

    • Author(s)
      Sakane Ayuko、Yano Taka-aki、Uchihashi Takayuki、Horikawa Kazuki、Hara Yusuke、Imoto Issei、Kurisu Shusaku、Yamada Hiroshi、Takei Kohji、Sasaki Takuya
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 4 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s42003-021-02080-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] FRET-Based Detection and Quantification of HIV-1 Virion Maturation2021

    • Author(s)
      Sarca Anamaria D.、Sardo Luca、Fukuda Hirofumi、Matsui Hiroyuki、Shirakawa Kotaro、Horikawa Kazuki、Takaori-Kondo Akifumi、Izumi Taisuke
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 12 Pages: -

    • DOI

      10.3389/fmicb.2021.647452

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Design and synthesis of gene-directed caged cyclic nucleotides exhibiting cell type selectivity2021

    • Author(s)
      Suzuki Akinobu Z.、Sakano Taichi、Sasaki Hirona、Watahiki Rei、Sone Masaki、Horikawa Kazuki、Furuta Toshiaki
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 57 Pages: 5630~5633

    • DOI

      10.1039/d1cc01405f

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Exploring rare cellular activity in more than one million cells by a transscale scope2021

    • Author(s)
      Ichimura T.、Kakizuka T.、Horikawa K.、Seiriki K.、Kasai A.、Hashimoto H.、Fujita K.、Watanabe T. M.、Nagai T.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 11 Pages: -

    • DOI

      10.1038/s41598-021-95930-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Programmed death (PD)‐1/PD‐ligand 1 blockade mediates antiangiogenic effects by tumor‐derived CXCL10/11 as a potential predictive biomarker2021

    • Author(s)
      Mitsuhashi Atsushi、Kondoh Kensuke、Horikawa Kazuki、Koyama Kazuya、Nguyen Na Thi、Afroj Tania、Yoneda Hiroto、Otsuka Kenji、Ogino Hirokazu、Nokihara Hiroshi、Shinohara Tsutomu、Nishioka Yasuhiko
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 112 Pages: 4853~4866

    • DOI

      10.1111/cas.15161

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] PD-1 preferentially inhibits the activation of low-affinity T cells2021

    • Author(s)
      Shimizu Kenji、Sugiura Daisuke、Okazaki Il-mi、Maruhashi Takumi、Takemoto Tatsuya、Okazaki Taku
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 118 Pages: e2107141118

    • DOI

      10.1073/pnas.2107141118

    • Open Access
  • [Journal Article] The nephric mesenchyme lineage of intermediate mesoderm is derived from Tbx6-expressing derivatives of neuro-mesodermal progenitors via BMP-dependent Osr1 function2021

    • Author(s)
      Hayashi Shinichi、Suzuki Hitomi、Takemoto Tatsuya
    • Journal Title

      Developmental Biology

      Volume: 478 Pages: 155~162

    • DOI

      10.1016/j.ydbio.2021.07.006

  • [Presentation] 興奮性多細胞システムのトランススケールイメージングで明らかになったらせん状信号波の形成機構2021

    • Author(s)
      堀川一樹
    • Organizer
      第60回日本生体医工学会・第36回日本生体磁気学会 合同大会
    • Invited
  • [Presentation] Onset of the signaling wave at 10,000 cell population2021

    • Author(s)
      Kazuki Horikawa
    • Organizer
      PacifiChem2021
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2022-12-28  

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