• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2020 Fiscal Year Annual Research Report

アルゴリズム基礎理論の追究・発展

Planned Research

Project AreaCreation and Organization of Innovative Algorithmic Foundations for Leading Social Innovations
Project/Area Number 20H05967
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

牧野 和久  京都大学, 数理解析研究所, 教授 (60294162)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小野 廣隆  名古屋大学, 情報学研究科, 教授 (00346826)
定兼 邦彦  東京大学, 大学院情報理工学系研究科, 教授 (20323090)
河村 彰星  京都大学, 数理解析研究所, 准教授 (20600117)
玉置 卓  兵庫県立大学, 社会情報科学部, 准教授 (40432413)
瀧本 英二  九州大学, システム情報科学研究院, 教授 (50236395)
渋谷 哲朗  東京大学, 医科学研究所, 教授 (60396893)
Project Period (FY) 2020-11-19 – 2025-03-31
Keywordsアルゴリズム論 / データ構造
Outline of Annual Research Achievements

本研究課題を大きく1.アルゴリズム研究,2.データ構造研究に分ける形で取り組み,チームとして得られた研究成果を以下では1,2の各テーマで得られた結果を概観する.
1.[最適化アルゴリズム] 牧野は離散最適化で重要な役割を果たすマトロイドに関連する分割問題に対する計算量解析,高性能なアルゴリズム開発に成功した.小野はグラフ最適化問題の観点から,グラフ上での組合せゲームに対するターン数に関する現時点で最速のFPTアルゴリズムを与えるとともに高速化限界を示した.[論理学的アルゴリズム]牧野は,論理式の各節が満たされるかどうかの可能なパターンをすべて列挙する問題に対するアルゴリズム開発を行った. 特に重要な未解決問題であったk-CNFに対して逐次多項式時間アルゴリズムの構築に成功した.玉置は,量子回路の出力分布をサンプリングする問題が, ある計算論的仮説の下で古典計算では近似することさえ指数時間必要であることを示した. [学習論的アルゴリズム]瀧本はエキスパート統合問題に対し,エキスパートの成績を表す損失行列が低ランク行列で近似できるときよりタイトなリグレット上界を持つアルゴリズムを設計した.またオンライン行列補完問題に対し妥当な仮定の下で誤り回数のタイトな上界を導出することに成功した.
2.[圧縮データ構造] 定兼はグラフのパラメタの1つであるクリーク幅が小さいグラフに対し,初めての簡潔表現(情報理論的に最小なサイズでの表現)を与えた.[計算生物学におけるデータ構造] 渋谷は次世代シークエンサーなどの解析において重要な超大規模なk-mer集合のグラフ理論に基づいた圧縮手法の開発に成功した.また大規模ゲノム解析において重要なプライバシー保護に関し,差分プライバシーの観点からのゲノムワイド相関解析データ公開におけるプライバシー保護手法の開発に成功した.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

概要に概観したようにほとんどの研究テーマにおいて,数件以上の新成果が得られ,それらは査読付き論文誌・国際学会会議録として採択に至っている.採択された論文誌・国際会議の多くはハイレベルあるいは定評のあるものがほとんどであり,メンバーがそれぞれ自分の強みを生かしながら活躍していると言える.またそれらの中にはメンバーの指導する学生が国際学会においてBest Student Paper Awardを受賞したもの[Yoshiwatari+, 2022],国内学会等で論文賞・発表賞を受賞したものなども含まれており,本研究課題推進は若手研究者育成にも強く関与している.
さらに,研究分担者の定兼・渋谷が「大規模メタゲノム解析の基盤技術の研究」に関して文部科学大臣表彰科学技術賞を受賞するなど(本研究課題に深く関連する)研究活動が高く評価されている.

Strategy for Future Research Activity

次年度(2023年に研究実施)以降は,過去3年抑制されてきた対面でのミーティング・セミナー等が開催しやすくなると考えられる.このため積極的なメンバー同士の交流を促し,あるいは機会を設定することにより,アルゴリズム論に関する新たなアイデアの融合・創出の可能性を高める.そのような融合における核となりうる研究テーマ例の一部を以下に挙げる:
[最適化アルゴリズム] 小野はPSPACEなどNP完全よりもより高い階層に位置する最適化問題に対するアルゴリズム設計に取り組む.[論理的アルゴリズム]玉置は,論理的アルゴリズム設計の観点から, 論理回路の充足可能性問題に対するアルゴリズムとその応用, 量子版の制約充足問題である局所ハミルトニアン問題に対するアルゴリズムの研究に取り組む予定である. [学習論的アルゴリズム]瀧本は,計算学習理論やオンライン意思決定の理論およびその応用に関する研究に取り組む予定である.
[圧縮データ構造] 定兼は様々なグラフクラスに対する簡潔表現の研究を行う.また,大量の文字列集合を圧縮して保存し,そこから高速に検索するための索引構造についての研究も行う.[計算生物学におけるデータ構造] 渋谷は,生物情報学・医療情報学などで重要とされる問題についてアルゴリズム設計理論の応用を探りながら,より大きなインパクトのある研究をめざし研究を続けていく.

  • Research Products

    (27 results)

All 2022 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (5 results) Journal Article (17 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 17 results,  Open Access: 5 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] ラトガース大学/Drexel 大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      ラトガース大学/Drexel 大学
  • [Int'l Joint Research] Chungbuk国立大学/ソウル国立大学(韓国)

    • Country Name
      KOREA (REP. OF KOREA)
    • Counterpart Institution
      Chungbuk国立大学/ソウル国立大学
  • [Int'l Joint Research] チャールズ大学(チェコ)

    • Country Name
      CZECH
    • Counterpart Institution
      チャールズ大学
  • [Int'l Joint Research] エトヴェシュ・ロラーンド大学(ハンガリー)

    • Country Name
      HUNGARY
    • Counterpart Institution
      エトヴェシュ・ロラーンド大学
  • [Int'l Joint Research] NTNU(ノルウェー)

    • Country Name
      NORWAY
    • Counterpart Institution
      NTNU
  • [Journal Article] Efficient Differentially Private Methods for a Transmission Disequilibrium Test in Genome Wide Association Studies2022

    • Author(s)
      Akito Yamamoto, Tetsuo Shibuya
    • Journal Title

      Pacific Symposium on Biocomputing 2022

      Volume: 2022 Pages: 85-96

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Succinct navigational oracles for families of intersection graphs on a circle2022

    • Author(s)
      Huseyin Acan, Sankardeep Chakraborty, Seungbum Jo, Kei Nakashima, Kunihiko Sadakane, Srinivasa Rao Satti
    • Journal Title

      Theoretical Computer Science

      Volume: 928 Pages: 151-166

    • DOI

      10.1016/j.tcs.2022.06.022

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Winner Determination Algorithms for Graph Games with Matching Structures2022

    • Author(s)
      Kanae Yoshiwatari, Hironori Kiya, Tesshu Hanaka, Hirotaka Ono
    • Journal Title

      Combinatorial Algorithms - 33rd International Workshop, (IWOCA 2022), Lecture Notes in Computer Science

      Volume: 13270 Pages: 509-522

    • DOI

      10.1007/978-3-031-06678-8\_37

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Parameterized Complexity of (A, l)-Path Packing2022

    • Author(s)
      Remy Belmonte, Tesshu Hanaka, Masaaki Kanzaki, Masashi Kiyomi, Yasuaki Kobayashi, Yusuke Kobayashi, Michael Lampis, Hirotaka Ono, Yota Otachi
    • Journal Title

      Algorithmica

      Volume: 84(4) Pages: 871--895

    • DOI

      10.1007/s00453-021-00875-y

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Optimal Matroid Partitioning Problems2021

    • Author(s)
      Yasushi Kawase, Kei Kimura, Kazuhisa Makino, Hanna Sumita
    • Journal Title

      Algorithmica

      Volume: 83(6) Pages: 1653-1676

    • DOI

      10.1007/s00453-021-00797-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Generating clause sequences of a CNF formula2021

    • Author(s)
      Kristof Berczi, Endre Boros, Ondrej Cepek, Khaled M. Elbassioni, Petr Kucera, Kazuhisa Makino
    • Journal Title

      Theoretical Computer Science

      Volume: 856 Pages: 68-74

    • DOI

      10.1016/j.tcs.2020.12.021

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] More practical differentially private publication of key statistics in GWAS2021

    • Author(s)
      Akito Yamamoto, Tetsuo Shibuya
    • Journal Title

      Bioinformatics Advances

      Volume: 1(1) Pages: vbab004

    • DOI

      10.1093/bioadv/vbab004

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Compression of Multiple k-mer Sets by Iterative SPSS Decomposition2021

    • Author(s)
      Kazushi Kitaya, Tetsuo Shibuya
    • Journal Title

      WABI 2021, LIPIcs

      Volume: 201 (12) Pages: 1--12

    • DOI

      10.4230/LIPIcs.WABI.2021.12

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Solving teleportation mazes with limited visibility2021

    • Author(s)
      Robert Barish,Tetsuo Shibuya
    • Journal Title

      The 23rd Thailand-Japan Conference on Discrete and Computational Geometry, Graphs, and Games

      Volume: 2021 Pages: 110-111

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Succinct Data Structures for Small Clique-Width Graphs2021

    • Author(s)
      Sankardeep Chakraborty, Seungbum Jo, Kunihiko Sadakane, Srinivasa Rao Satti
    • Journal Title

      IEEE Data Compression Conference (DCC) 2021

      Volume: 2021 Pages: 133-142

    • DOI

      10.1109/DCC50243.2021.00021

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Improved Algorithms for Online Load Balancing2021

    • Author(s)
      Yaxiong Liu, Kohei Hatano, Eiji Takimoto
    • Journal Title

      47th International Conference on Current Trends in Theory and Practice of Computer Science (SOFSEM 2021), Lecture Notes in Computer Science

      Volume: 12607 Pages: 203-217

    • DOI

      10.1007/978-3-030-67731-2_15

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Expert Advice Problem with Noisy Low Rank Loss2021

    • Author(s)
      Yaxiong Liu, Xuanke Jiang, Kohei Hatano, Eiji Takimoto
    • Journal Title

      13th Asian Conference on Machine Learning (ACML 2021)

      Volume: 2021 Pages: 1097-1112

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] An Online Semi-definite Programming with a Generalised Log-determinant Regularizer and Its Applications2021

    • Author(s)
      Yaxiong Liu, Ken-ichiro Moridomi, Kohei Hatano, Eiji Takimoto
    • Journal Title

      13th Asian Conference on Machine Learning (ACML 2021)

      Volume: 2021 Pages: 1113-1128

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Graph Orientation with Edge Modifications2021

    • Author(s)
      Yuichi Asahiro, Jesper Jansson, Eiji Miyano, Hirotaka Ono
    • Journal Title

      International Journal of Foundations of Computer Science

      Volume: 32(2) Pages: 209-233

    • DOI

      10.1142/S012905412150012X

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Computing L(p, 1)-Labeling with Combined Parameters2021

    • Author(s)
      Tesshu Hanaka, Kazuma Kawai, Hirotaka Ono
    • Journal Title

      WALCOM: Algorithms and Computation - 15th International Conference and Workshops, WALCOM 2021, Lecture Notes in Computer Science

      Volume: 12635 Pages: 208-220

    • DOI

      10.1007/978-3-030-68211-8\_17

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Multi-Player Open-Hand Babanuki2021

    • Author(s)
      Hironori Kiya and Hirotaka Ono
    • Journal Title

      The 23rd Thailand-Japan Conference on Discrete and Computational Geometry, Graphs, and Games

      Volume: 23 Pages: 56-57

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Additive-error fine-grained quantum supremacy2020

    • Author(s)
      Tomoyuki Morimae and Suguru Tamaki
    • Journal Title

      Quantum

      Volume: 4(329) Pages: 1--12

    • DOI

      10.22331/q-2020-09-24-329

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Privacy-Preserving Statistical Analysis of Genomic Data using Compressive Mechanism with Haar Wavelet Transform2022

    • Author(s)
      Akito Yamamoto, Tetsuo Shibuya
    • Organizer
      RECOMB Privacy and Security Workshop, 2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Counting on a rainbow connection2022

    • Author(s)
      Robert Barish, Tetsuo Shibuya
    • Organizer
      Italian Conference on Theoretical Computer Science
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Differentially Private Methods in Bioinformatics2022

    • Author(s)
      Tetsuo Shibuya
    • Organizer
      Combinatorial Problems of Strings and Graphs and Their Applications in Bioinformatics, Part 2
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] SATの解空間連結性判定問題の計算複雑性について2021

    • Author(s)
      玉置 卓
    • Organizer
      組合せ遷移第12回セミナー・勉強会
    • Invited
  • [Presentation] 制約充足問題の研究: アルゴリズムと計算複雑性2021

    • Author(s)
      玉置 卓
    • Organizer
      第39回STクラブ

URL: 

Published: 2023-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi