• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2010 Fiscal Year Annual Research Report

二次代謝産物生合成マシナリー構築用モデル宿主の開発

Planned Research

Project AreaBiosynthetic machinery: Deciphering and regulating the system for bioactive metabolite diversification
Project/Area Number 22108006
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Research InstitutionKitasato University

Principal Investigator

池田 治生  北里大学, 大学院・感染制御科学府, 教授 (90159632)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小松 護  北里大学, 大学院・感染制御科学府, 助教 (40414057)
Keywords生合成マシナリー / ゲノム / 二次代謝産物 / 抗生物質 / 放線菌
Research Abstract

2003年に我々によってゲノムが解読された産業利用放線菌Streptomyces avermitilisをモデルに、その染色体上の物質生産に最適化された遺伝子(群)に影響を与えない大規模欠失組み換え体を作製し、異種二次代謝産物生産並びにそれらの遺伝子発現の評価を行えるための汎用宿主の開発を目指す。既に染色体を80%程度までに欠失させたSUKA株に関し、すべての2次代謝産物の生成を検討可能にするため、さらに欠失に伴う耐性遺伝子挿入を回避するための欠失体SUKA17株を作製した。一方、本菌の線状プラスミドを疑似染色体化するため、染色体上のファージとの部位特異的組換え配列領域を欠失させるとともに、さらに線状プラスミドSAP1の左末端側に上記の部位特異的組換え配列を導入することができた。これら新たな組み換え体は次年度に各種の異種生合成遺伝子群断片を部位特異的な組換えで導入することによって評価を行うとともに線状プラスミド由来の疑似染色体ベクターとしての有効性を検討する。異種2次代謝産物生合成遺伝子群の導入による物質生産過程では生合成遺伝子群の発現を調節する制御遺伝子の発現が重要であることは理解されているが、その制御遺伝子の発現をさらに上位で制御する機構については、数例のみの解析にとどまっている。上位の制御系の問題解決あるいは微量にのみ生成が認められる状態で転写を変化させる試みを行った。転写酵素であるRNAポリメラーゼのβサブユニット(RpoB)の変異はリファンピシン耐性を引き起こすとともに他の遺伝子発現の劇的な変化を生じることが観察されている。本年度rpoB遺伝子のいくつかの変異遺伝子を作製し、いくつかの異種生合成遺伝子群の発現を検討した結果、野生型rpoBを保有する菌株と比べ生成量が1.5~3倍程度に上昇する変異を見出すことができた。

  • Research Products

    (13 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Genome mining in Streptomyces. Discovery of an unprecedented P450-catalyzed oxidative rearrangement that is the final step in the biosynthesis of pentalenolactone.2011

    • Author(s)
      Zhu, D., et al.
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc.

      Volume: (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of a silent sesquiterpenoid biosynthetic pathway in Streptomyces avermitilis controlling epi-isozizaene and albaflavenone biosynthesis and isolation of a new oxidized epi-isozizaene metabolite.2011

    • Author(s)
      Takamatsu, S., et al.
    • Journal Title

      Microl.Biotechnol.

      Volume: 4 Pages: 184-191

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biosynthesis of 2-methylisoborneol in Cyanobacteria.2011

    • Author(s)
      Giglio, S., et al.
    • Journal Title

      Environ.Sci.Technol.

      Volume: 45 Pages: 992-998

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pentalenic acid is a shunt metabolite in the biosynthesis of the pentale nolactone family of metabolites : Hydroxylation of 1-deoxypentalenic acid mediated by CYP105D7 (SAV_7469) of Streptomyces avermitilis.2011

    • Author(s)
      Takamatsu, S., et al.
    • Journal Title

      J.Antibiot.

      Volume: 64 Pages: 65-71

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome sequence of Kitasatospora setae NBRC 14216^T : An evolutionary snapshot of the family Streptomycetaceae.2010

    • Author(s)
      Ichikawa, N.., et al.
    • Journal Title

      DNA Res.

      Volume: 17 Pages: 393-406

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regio- and stereospecificity of filipin hydroxylation sites revealed by crystal structure of cytochrome P450 105P1 and 105D6 from Streptomyces avermitilis.2010

    • Author(s)
      Lin, X., et al.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem.

      Volume: 285 Pages: 16844-16853

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome mining in Streptomyces avermitilis : Cloning and characterization of SAV_76, the synthase for a new sesquiterpene. avermitilol.2010

    • Author(s)
      Chou, W.K.W., et al.
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc.

      Volume: 132 Pages: 8850-8851

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-minimized Streptomyces host for the heterologous expression of secondary metabolism.2010

    • Author(s)
      Komatsu, M., et al.
    • Journal Title

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA

      Volume: 107 Pages: 2646-2651

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Exploring the bacterial terpenome2010

    • Author(s)
      Ikeda, H.
    • Organizer
      RIKEN Chemical Biology International Symposium
    • Place of Presentation
      Wako, Japan(Invited Symposium)
    • Year and Date
      2010-10-26
  • [Presentation] Discovery of new sesquiterpenoid compounds, "Avermitilol" and "Avermitilone" by genome mining of Streptomyces avermitilis2010

    • Author(s)
      Ikeda, H.
    • Organizer
      2010 KSBB Fall Meeting & International Symposium.
    • Place of Presentation
      Incheon, Korea(Invited Symposium)
    • Year and Date
      2010-10-08
  • [Presentation] Characterization of relA mutant of industrial microorganism Streptomyces avermitilis2010

    • Author(s)
      Komatsu, M.Tanaka, Y.Ochi, K.Ikeda, H.
    • Organizer
      11^<th> International Symposium on the Genetics of Industrial Microorganisms
    • Place of Presentation
      Melbourne, Australia
    • Year and Date
      2010-06-30
  • [Presentation] Optimized Streptomyces host for the heterologous expression of secondary metabolism.2010

    • Author(s)
      Ikeda, H.Komatsu, M.Uchiyama, T.
    • Organizer
      11^<th> International Symposium on the Genetics of Industrial Microorganisms
    • Place of Presentation
      Melbourne, Australia(Invited Symposium)
    • Year and Date
      2010-06-29
  • [Remarks]

    • URL

      http://avermitilis.1s.kitasato-u.ac.jp/

URL: 

Published: 2012-07-19  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi