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2011 Fiscal Year Annual Research Report

回路活動データの解析法と局所神経回路のモデリング

Planned Research

Project AreaMesoscopic neurocircuitry: towards understanding of the functional and structural basis of brain information processing
Project/Area Number 22115013
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

深井 朋樹  独立行政法人理化学研究所, 脳回路機能理論研究チーム, チームリーダー (40218871)

Keywordsスパイクソーティング / 変分ベイズ / 大規模シミュレーション / 大脳皮質局所回路 / スパイク時間依存のシナプス可塑性 / 入力相関検出 / 視覚的注意 / 海馬神経回路
Research Abstract

多電極記録は、神経細胞集団の活動をミリ秒レベルの時間精度で測定可能な唯一の実験手法であるが、計算速度と精度の高いスパイク分離法が必要になる。以前、報告した変分ベイズ法による多細胞スパイク分離法の特長検出とスパイク構造化にさらに改良を加え、多様な発火パターンが混在する場合にも有効な手法を開発した。この方法の実用的意義は大きい。解剖及び電気生理実験のデータを用いて、層構造をもつ大脳皮質視覚野局所回路の大規模シミュレーションモデルを構築し、モデルを用いてトップダウンの注意信号による、視覚野神経細胞の刺激応答の調節と神経メカニズムを調べた。その結果から、応答の調節パターンは層依存的であることを、初めて理論的に予言した。池谷らの計測データに基づいて、海馬CA3とCA1を含むメゾ回路構造をモデル化し、実験で観察される演算機能を生み出す神経回路の学習メカニズムを同定した。近年、シナプスコンダクタンス(EPSP)の分布は、正規分布ではなく、長いテールを有する対数正規分布に従うことが明らかになっている。しかしそのような分布を生み出すメカニズムはよくわかっていない。そこで、シナプス強度の分布を自己組織化するシナプス可塑性ルールを理論的に導出した。また他のモデルに比較して、スパイク入力のわずかな同期レベルの違いの検出や、外部入力の相関構造の変化を追従できる柔軟性などにおいて、機能的に優位であることをモデルの解析のよって示した。パーキンソン病に見られるような大脳基底核の異常な同期振動活動の発生メカニズムを、回路モデルを構築して解析した。さらに大脳基底核神経回路による行動選択のモデルを例に取り、数十万個程度のニューロンで構成される局所回路の振る舞いを、リアルタイムにシミュレーションする技術を開発した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

多細胞スパイク列の分離手法の開発では、新しい数学的手法を取り入れることで、予想以上に良い精度と計算速度を達成することが可能になった。また視覚野局所回路のシミュレーションは、局所回路内でのボトムアップの視覚刺激とトップダウンの注意信号の相互作用を記述し、大脳皮質の各層の機能分担について探る足がかりを与えた、世界で初めての大規模シミュレーションによる試みである。

Strategy for Future Research Activity

多細胞スパイク列の時空間構造の検出について、大筋の見通しがたったので、本年度中に細部を詰めてまとめる。また近年、光イメージング法の発展によって、非常に大規模なニューロン集団の活動を同時記録することが可能になりつつある。それにあわせて、イメージングデータから神経細胞の検出を自動化するアルゴリズムや、検出された解析手法のより一層の高精度・高速化が望まれており、そのような手法の開発に力を入れる。その際鍵になるのは、データの大規模化に伴って増大する計算コストを、以下に低く押さえることができるかであるが、そのためには、あらたな機械学習の方法論の開発などが必要になる可能性が高い。次に、新しく見出したシナプス可塑性規則の情報理論的な機能や、大脳新皮質や海馬の神経回路による記憶や時系列情報処理上の意義について、さらに理論的な解析を進めたい。それにより、大脳皮質局所回路による感覚および運動情報処理の基本原理について、実験で検証可能な仮説を導きだすことを目指す。とくにそのようなシナプス可塑性が、ワーキングメモリ回路や、感覚・運動情報処理のためのベイズ推定回路の刺激依存の自発的的生成の基盤になっているという仮説を検証する。

  • Research Products

    (37 results)

All 2012 2011

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (29 results)

  • [Journal Article] Power-law inter-spike interval distributions infer a conditional maximization of entropy in cortical neurons2012

    • Author(s)
      Tsubo Yasuhiro, Isomura Yoshikazu, Fukai Tomoki
    • Journal Title

      PLoS Computational Biology

      Volume: (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spike sorting of heterogeneous neuron types by multimodality-weighted PCA and explicit robust variational Bayes2012

    • Author(s)
      Takekawa Takashi, Isomura Yoshikazu, Fukai Tomoki
    • Journal Title

      Frontiers in Neuroinformatics

      Volume: (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Neural correlate of the processing of multi-second time intervals in primate prefrontal cortex2011

    • Author(s)
      Yumoto Naosugi, Lu Xiaofeng, Henry Thomas, Miyachi Shigehiro, Nambu Atsushi, Fukai Tomoki, Takada Masahiko
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 6 Pages: e19168-1-e19168-7

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0019168

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Layer-dependent attentional processing by top-down signals in a visual cortical microcircuit model2011

    • Author(s)
      Wagatsuma Nobuhiko, Potjans Tobias, Diesmann Markus, Fukai Tomoki
    • Journal Title

      Frontiers in Computational Neuroscience

      Volume: 5 Pages: 31-1-31-15

    • DOI

      10.3389/fncom.2011.00031

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Stability versus neuronal specialization for STDP : long-tail weight distri butions solve the dilemma2011

    • Author(s)
      Gilson Matthieu, Fukai Tomoki
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 6 Pages: e25339-1-e25339-18

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0025339

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hippocampal polysynaptic computation2011

    • Author(s)
      Kimura Rie, Kang Siu, Takahashi Naoya, Usami Atsushi, Matsuki Norio, Fukai Tomoki, Ikegaya Yuji
    • Journal Title

      The Journal of Neuroscience

      Volume: 31 Pages: 13168-13179

    • DOI

      10.1523/JNEUROSCI.1920-11.2011

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Real-time simulation of a spiking neural network model of the basal ganglia circuitry using general purpose computing on graphics processing units2011

    • Author(s)
      Igarashi Jun, Shouno Osamu, Fukai Tomoki, Tsujino Hiroshi
    • Journal Title

      Neural Networks

      Volume: 24 Pages: 950-960

    • DOI

      10.1016/j.neunet.2011.06.008

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Influences of membrane properties on phase response curve and synchronization stability in a model globus pallidus neuron2011

    • Author(s)
      Fujita Tomohiro, Fukai Tomoki, Kitano Katsunori
    • Journal Title

      Journal of Computational Neuroscience

      Volume: 31 Pages: 1-16

    • DOI

      10.1007/s10827-011-0368-2

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 行動決定時のラット前頭前野の錐体細胞と介在細胞は異なる応答特性を示す2012

    • Author(s)
      半田高史, 竹川高志, 春国梨恵, 礒村宜和, 深井朋樹
    • Organizer
      第89回日本生理学会大会
    • Place of Presentation
      松本日本
    • Year and Date
      2012-03-31
  • [Presentation] 振動子ネットワークの位相秩序変数の揺らぎとラプラス行列の関係2012

    • Author(s)
      坪泰宏, 深井朋樹
    • Organizer
      日本物理学会第67回年次大会
    • Place of Presentation
      西宮日本
    • Year and Date
      2012-03-25
  • [Presentation] 対数正規シナプス重みを持つ連想記憶モデル2012

    • Author(s)
      平谷直輝, 寺前順之介, 深井朋樹
    • Organizer
      日本物理学会第67回年次大会
    • Place of Presentation
      西宮日本
    • Year and Date
      2012-03-25
  • [Presentation] 皮質自発活動に潜む二つの対数正規分布則の双対性2012

    • Author(s)
      寺前順之介, 深井朋樹
    • Organizer
      日本物理学会第67回年次大会
    • Place of Presentation
      西宮日本
    • Year and Date
      2012-03-24
  • [Presentation] A bistable model of logarithmic STDP underlies working memory2012

    • Author(s)
      Fukai Tomoki
    • Organizer
      Japan-France Joint Symposium on Neural Dynamics and Plasticity : from Synapse to Network
    • Place of Presentation
      Kyoto Japan(招待講演)
    • Year and Date
      2012-01-12
  • [Presentation] Non-Gaussian fluctuation of macroscopic observable infers network topology of oscillators2011

    • Author(s)
      Tsubo Yasuhiro, Fukai Tomoki
    • Organizer
      The 21^<st>annual conference of the Japanese neural network society
    • Place of Presentation
      Okinawa Japan
    • Year and Date
      2011-12-16
  • [Presentation] Information coding in motor cortical circuits2011

    • Author(s)
      Fukai Tomoki
    • Organizer
      Cape Town School of Advanced Theoretical and Computational Neurosciences
    • Place of Presentation
      Cape Town South Africa(招待講演)
    • Year and Date
      2011-12-13
  • [Presentation] Spatial and feature-based attention in a visual cortical layered microcircuit model2011

    • Author(s)
      Wagatsuma Nobuhiko, Potjans Tobias, Diesmann Markus, Sakai Ko, Fukai Tomoki
    • Organizer
      41st Annual Meeting of the Society for Neuroscience (Neuroscience 2011)
    • Place of Presentation
      Washington DC USA
    • Year and Date
      2011-11-16
  • [Presentation] Neural mechanism for psychological timing of multi-alternative decision2011

    • Author(s)
      Okamoto Hiroshi, Fukai Tomoki
    • Organizer
      41st Annual Meeting of the Society for Neuroscience (Neuroscience 2011)
    • Place of Presentation
      Washington DC USA
    • Year and Date
      2011-11-16
  • [Presentation] Organization of activity in M1 during voluntary movement in rat2011

    • Author(s)
      Arai Kensuke, Takekawa Takashi, Isomura Yoshikazu, Fukai Tomoki
    • Organizer
      41st Annual Meeting of the Society for Neuroscience (Neuroscience 2011)
    • Place of Presentation
      Washington DC USA
    • Year and Date
      2011-11-13
  • [Presentation] 回路活動データの解析法と局所神経回路のモデリング2011

    • Author(s)
      五十嵐潤, 深井朋樹
    • Organizer
      新学術領域研究「メゾスコピック神経回路から探る脳の情報処理基盤」平成23年度第2回領域班会議
    • Place of Presentation
      熱海日本
    • Year and Date
      2011-10-26
  • [Presentation] スーパコンピュータで探る脳の作動原理2011

    • Author(s)
      深井朋樹
    • Organizer
      バイオスーパーコンピューティング研究会第三回総会・講演会
    • Place of Presentation
      和光市日本(招待講演)
    • Year and Date
      2011-10-18
  • [Presentation] シナプス結合の対数正規分布則は最適なノイズを生成し皮質の信号伝達を最適化する2011

    • Author(s)
      寺前順之介, 坪泰宏, 深井朋樹
    • Organizer
      第34回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      横浜日本
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] 行動決定時におけるラット前頭前野内側部の錐体細胞と介在細胞の調和的活動2011

    • Author(s)
      半田高史, 竹川高志, 春国梨恵, 礒村宜和, 深井朋樹
    • Organizer
      第34回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      横浜日本
    • Year and Date
      2011-09-16
  • [Presentation] 発火時系列に対する情報量解析を用いた神経細胞とネットワークの情報表現様式の解析2011

    • Author(s)
      竹川高志, 礒村宜和, 深井朋樹
    • Organizer
      第34回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      横浜日本
    • Year and Date
      2011-09-16
  • [Presentation] ラット運動野神経活動から示唆される運動タイミングに関連したバランスシナプス入力2011

    • Author(s)
      坪泰宏, 礒村宜和, 深井朋樹
    • Organizer
      第34回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      横浜日本
    • Year and Date
      2011-09-16
  • [Presentation] Influence of synaptic delays in a neuronal map emerging from STDP2011

    • Author(s)
      GILSON Matthieu, 深井朋樹
    • Organizer
      第34回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      横浜日本
    • Year and Date
      2011-09-16
  • [Presentation] 多者択一における意思決定タイミング:モデル構築・解析に基づく神経機構の解明2011

    • Author(s)
      岡本洋, 深井朋樹
    • Organizer
      第34回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      横浜日本
    • Year and Date
      2011-09-16
  • [Presentation] 視覚野局所回路モデルにおける空間的注意と特徴的注意2011

    • Author(s)
      我妻伸彦, POTJANS Tobias, DIESMANN Markus, 酒井宏, 深井朋樹
    • Organizer
      第34回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      横浜日本
    • Year and Date
      2011-09-15
  • [Presentation] 大脳皮質自発発火活動の起源と機能:EPSPの対数正規分布と情報伝達の最適化2011

    • Author(s)
      寺前順之介, 坪泰宏, 深井朋樹
    • Organizer
      包括型脳科学研究推進支援ネットワーク「夏のワークショップ」
    • Place of Presentation
      神戸日本
    • Year and Date
      2011-08-23
  • [Presentation] Putative pyramidal neurons differentially respond to novel and familiar stimuli in lateral region of rodent prefrontal cortex in making action decision2011

    • Author(s)
      半田高史, 竹川高志, 春国梨恵, 礒村宜和, 深井朋樹
    • Organizer
      包括型脳科学研究推進支援ネットワーク「夏のワークショップ」
    • Place of Presentation
      神戸日本
    • Year and Date
      2011-08-23
  • [Presentation] Interplay between dendritic non-linearities and STDP2011

    • Author(s)
      Gilson Matthieu, Fukai Tomoki, Toyoizumi Taro
    • Organizer
      20th Annual Computational Neuroscience Meeting (CNS 2011)
    • Place of Presentation
      Stockholm Sweden
    • Year and Date
      2011-07-26
  • [Presentation] 大脳皮質のノイズ情報処理-自発ノイズの起源と機能2011

    • Author(s)
      寺前順之介, 深井朋樹
    • Organizer
      ニューロコンピューティング研究会(NC)
    • Place of Presentation
      神戸日本
    • Year and Date
      2011-07-26
  • [Presentation] Degree of locking to network activity of neurons with similar movement tuning in the motor cortex of awake, behaving rats differs by layer2011

    • Author(s)
      Arai Kensuke, Takakuda Emi, Takekawa Takashi, Isomura Yoshikazu, Fukai Tomoki
    • Organizer
      20th Annual Computational Neuroscience Meeting (CNS 2011)
    • Place of Presentation
      Stockholm Sweden
    • Year and Date
      2011-07-25
  • [Presentation] Layer dependent neural modulation of a realistic layered-microcircuit model in visual cortex based on bottom-up and top-down signals2011

    • Author(s)
      Wagatsuma Nobuhiko, Potjans Tobias, Diesmann Markus, Fukai Tomoki
    • Organizer
      20th Annual Computational Neuroscience Meeting (CNS 2011)
    • Place of Presentation
      Stockholm Sweden
    • Year and Date
      2011-07-24
  • [Presentation] 神経細胞および神経細胞集団の発火時系列に対する情報量解析2011

    • Author(s)
      竹川高志, 礒村宜和, 深井朋樹
    • Organizer
      ニューロコンピューティング研究会(NC)・情報処理学会バイオ情報学研究会(IPSJ-BIO)
    • Place of Presentation
      那覇日本
    • Year and Date
      2011-06-23
  • [Presentation] Long-tailed statistics of corticocortical EPSPs : Origin and computational role of noise in cortical circuits2011

    • Author(s)
      Teramae Junnosuke, Tsubo Yasuhiro, Fukai Tomoki
    • Organizer
      3rd International Conference on Cognitive Neurodynamics (ICCN 2011)
    • Place of Presentation
      Niseko Japan
    • Year and Date
      2011-06-12
  • [Presentation] Lognormal-like distributions of synaptic weights and STDP in recurrent neuronal networks2011

    • Author(s)
      Gilson Matthieu, Fukai Tomoki
    • Organizer
      3rd International Conference on Cognitive Neurodynamics (ICCN 2011)
    • Place of Presentation
      Niseko Japan
    • Year and Date
      2011-06-12
  • [Presentation] ヒックの法則の神経基盤2011

    • Author(s)
      岡本洋, 深井朋樹
    • Organizer
      2011年度人工知能学会全国大会(第25回)
    • Place of Presentation
      盛岡日本
    • Year and Date
      2011-06-02

URL: 

Published: 2013-06-26  

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