• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2011 Fiscal Year Annual Research Report

体色の多様化が生む脳遺伝子の発現変化と性行動不適合性の解析

Planned Research

Project AreaCorrelative gene system: establishing next-generation genetics
Project/Area Number 23113008
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

高橋 文  国立遺伝学研究所, 集団遺伝研究系, 助教 (90370121)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 長田 直樹  国立遺伝学研究所, 集団遺伝研究系, 助教 (70416270)
Keywords体色変異 / ドーパミン / 性行動 / RNAseq / 生殖的隔離 / 次世代シークエンサー / ebony / ショウジョウバエ
Research Abstract

本研究では、ショウジョウバエの体色と行動の両方に関与するドーパミン生合成系の遺伝子群をモデルケースとして、環境適応の副次的な影響として起こる性行動の不適合性により新規生殖隔離が生じる分子機構を解明することを目的とする。また、より広範な視点からゲノムワイドなトランスクリプトームの遺伝子ネットワークにおける「ゲノム・遺伝子相関」の全体像を把握し、その重要性について定量的な議論を展開することを目標としている。
H23年度は、ショウジョウバエの性行動を制御するドーパミン生合成系脳遺伝子を解明するため、性行動をビデオ撮影するための高速ビデオカメラを設置し、予備的な動画撮影を行った。また、定量PCR装置を購入しドーパミン生合成系の遺伝子についてプライマーのテストを行った。今後は、性行動の微細な行動要素の種内変異、定量PCRによる種内変異の解析を行う。また、性行動の不適合性を生む多面発現遺伝子のゲノム進化過程の解明するため、上記により明らかになった性行動を制御する脳遺伝子について、発現制御領域のDNA塩基配列を決定し、その配列情報の解析を行う計画である。
次世代シークエンサーを用いたシス制御領域の転写制御の「ゲノム・遺伝子相関」解析については、対立遺伝子を区別したトランスクリプトーム定量データを得るために、18系統の雌雄から頭部と体のRNAを抽出し、Illumina HiSeq2000によるRNAseqデータを取得した。今後は、このデータについてシス制御領域による組織間発現制御の相関解析を行い、「ゲノム・遺伝子相関」が、遺伝子発現ネットワークを介してどのように集団内ゲノムの不適合性を引き起こしているかについて明らかにしていく計画である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

分子実験、行動実験のための設備のセットアップを終えることができた。また、ゲノムワイドな発現解析のための第一段階のデータ取得が完了しているため。

Strategy for Future Research Activity

研究代表者の所属機関が変更したため、設備の設置位置の調整や計画の微調整が必要となるが、研究計画に大きな変更はない。本科研費により購入した備品は、全て新たな所属機関へ貸与という形で移動させ、使用可能な状況である。研究分担者とは、今後とも密な連絡を取るとともに、打ち合わせのための会議も定期的に行う計画である。また、本年度より、PDを雇用し、より本格的な実験の遂行を予定している。

  • Research Products

    (21 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (11 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Cuticular hydrocarbon content that affects male mate preference of Drosophila melanogaster from West Africa2012

    • Author(s)
      Takahashi, A., et al
    • Journal Title

      Int.J.Evol.Biol.

      Volume: 2012 Pages: 278903

    • DOI

      10.1155/2012/278903

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evolutionary rates of commonly used nuclear and organelle markers of Arabidopsis relatives (Brassicaceae)2012

    • Author(s)
      Huan C.-C., et al
    • Journal Title

      Gene

      Volume: 499 Pages: 194-201

    • DOI

      10.1016/j.gene.2012.02.037

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Footprints of natural and artificial selection for photoperiod pathway genes in Oryza2012

    • Author(s)
      Huang, C.-L., et al
    • Journal Title

      Plant J.

      Volume: (in press)

    • DOI

      10.1111/j.1365-313X.2012.04915.x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Divergent enhancer haplotype of ebony on inversion In(3R)Payne associated with pigmentation variation in a tropical population of Drosophila melanogaster2011

    • Author(s)
      Takahashi, A., Takano-Shimizu, T.
    • Journal Title

      Mol.Ecol.

      Volume: 20 Pages: 4277-87

    • DOI

      10.1111/j.1365-294X.2011.05260.x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mitochondrial-nuclear interactions and accelerated compensatory evolution : Evidence from the primate cytochrome c oxidase complex2011

    • Author(s)
      Osada, N., Akashi, H.
    • Journal Title

      Mol.Biol.Evol.

      Volume: 29 Pages: 337-346

    • DOI

      10.1093/molbev/msr211

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] CpG site degeneration triggered by the loss of functional constraint created a highly polymorphic macaque drug-metabolizing gene, CYP1A22011

    • Author(s)
      Uno, Y., Osada, N.
    • Journal Title

      BMC Evol.Biol.

      Volume: 11 Pages: 283

    • DOI

      10.1186/1471-2148-11-283

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phylogenetic inconsistency caused by ancient sex-biased migration2011

    • Author(s)
      Osada, N.
    • Journal Title

      PloS ONE

      Volume: 6 Pages: e25549

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0025549

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Association between Color and Behavior due to Expression Variants of a Pleiotropic Gene, ebony, in Drosophila2012

    • Author(s)
      Takahashi, A.
    • Organizer
      The 8^<th> Okazaki Biological Conference
    • Place of Presentation
      基礎生物学研究所(岡崎市)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-03-21
  • [Presentation] Compensatory Evolution between Mitochondrial and Nuclear Genomes2012

    • Author(s)
      Osada, N.
    • Organizer
      The 8^<th> Okazaki Biological Conference
    • Place of Presentation
      基礎生物学研究所(岡崎市)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-03-20
  • [Presentation] 多座位データを用いたゲノムヒストリーの推定2011

    • Author(s)
      長田直樹
    • Organizer
      統計数理研究所共同利用研究集会
    • Place of Presentation
      統計数理研究所(立川市)
    • Year and Date
      2011-12-19
  • [Presentation] Inference of population history using a single genome data2011

    • Author(s)
      Osada, N.
    • Organizer
      日本分子生物学会,第34回大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2011-12-14
  • [Presentation] Genetic diversity and population history of macaque monkeys2011

    • Author(s)
      Osada, N.
    • Organizer
      Genomic Conservation and Diversity of Organisms : Beyond the NGS time of Life Science
    • Place of Presentation
      Tainan, Taiwan
    • Year and Date
      2011-12-09
  • [Presentation] メタゲノム解析とその応用2011

    • Author(s)
      長田直樹
    • Organizer
      メタゲノム解析を利用した下水道情報網基盤構築に関する研究集会
    • Place of Presentation
      諏訪市
    • Year and Date
      2011-11-27
  • [Presentation] 機能喪失とCpGサイトの崩壊による旧世界ザルCYP1A2遺伝子の高い遺伝的多様性2011

    • Author(s)
      長田直樹, 宇野泰広
    • Organizer
      日本遺伝学会,第83回大会
    • Place of Presentation
      京都大学(京都市)
    • Year and Date
      2011-09-22
  • [Presentation] ショウジョウバエ脳におけるebony発現量変異と性行動の日周活動性について2011

    • Author(s)
      高橋文
    • Organizer
      日本遺伝学会,第83回大会
    • Place of Presentation
      京都大学(京都市)
    • Year and Date
      2011-09-20
  • [Presentation] Association between Color and Behavior in Drosophila2011

    • Author(s)
      Takahashi, A.
    • Organizer
      SMBE2011
    • Place of Presentation
      京都大学(京都市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-07-27
  • [Presentation] Compensatory evolution between mitochondrial and nuclear genomes : evidence from primate respiratory chain complex genes2011

    • Author(s)
      Osada, N., Akashi, H.
    • Organizer
      SMBE2011
    • Place of Presentation
      京都大学(京都市)
    • Year and Date
      2011-07-27
  • [Presentation] 霊長類の中のヒト:ゲノム多様性の種間比較2011

    • Author(s)
      長田直樹
    • Organizer
      遺伝研共同研究集会:ヒト形質のゲノム発掘による新しい進化人類学の創成
    • Place of Presentation
      国立遺伝学研究所(三島市)
    • Year and Date
      2011-07-01
  • [Book] An overview of transcriptome studies in nonhuman primates. In : Post genome Biology of primates (Primatology monographs)2012

    • Author(s)
      Osada N.
    • Total Pages
      9-22
    • Publisher
      Springer-Verlag
  • [Book] Bucentaur (Bent) Gene Family : Gene Duplication and Retrotransposon Insertion In Gene Duplication2011

    • Author(s)
      Iwashita, S., Osada, N.
    • Total Pages
      383-400
    • Publisher
      InTech
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.ige.tohoku.ac.jp/prg/genetics/study07.html

URL: 

Published: 2013-06-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi