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2014 Fiscal Year Annual Research Report

クロマチン変換による代謝リプログラミングの分子基盤

Planned Research

Project AreaCrosstalk of transcriptional control and energy pathways by hub metabolites
Project/Area Number 23116009
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

中尾 光善  熊本大学, 発生医学研究所, 教授 (00217663)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2016-03-31
Keywords代謝調節 / クロマチン / 遺伝子発現 / リジン脱メチル化 / フラビン / 脂肪細胞 / 肝癌細胞
Outline of Annual Research Achievements

エピジェネティクス機構は、刺激の受容で行われる短期応答、そして、刺激が消失した後にも刺激を受容した記憶を維持する長期応答を通して、遺伝子制御に働いている。他方、転写不活性なクロマチンに位置する遺伝子は、刺激に対して不応になり得る。この転写環境としてのエピゲノム制御には、DNAメチル化とクロマチンの形成が関わり、代謝恒常性の維持と破綻に重要な役割を果たしている。本研究では、生命素子と転写環境の観点から、DNAおよびリジン残基のメチル化・脱メチル化によるクロマチン変換に着目した研究を行い、代謝のリプログラミングの分子基盤を解明することを目的とする。LSD1ファミリーは、ヒストンH3の4番目リジン残基の脱メチル化酵素であり、生命素子のひとつであるフラビン(FAD)がその酵素活性に不可欠である。本研究の前半に、LSD1が脂肪細胞でエネルギー消費を抑制し、脂肪蓄積を促進する新規の機序を明らかにした。この成果に基づいて、肝癌細胞においてLSD1が好気的解糖と低酸素誘導性の転写因子HIFの安定化を維持していることが分かった。LSD1阻害によって、好気的解糖からミトコンドリア呼吸にシフトすることを見出した。また、もうひとつのファミリー分子であるLSD2が、肝癌細胞で脂肪代謝に重要な役割を果たすことが判明した。エピジェネティクス機構の観点から、代謝リプログラミングと病態における新しい知見を提示し、その作動原理と生命活動における意義について解明を進めた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

リジン脱メチル化酵素LSD1ファミリーによるエネルギー代謝の制御について、数多くの新知見を得て、最先端の研究成果が出ているため。

Strategy for Future Research Activity

本研究は、当初の計画以上に進展しているため、研究計画の変更なしに推進する。最終年度として研究のとりまとめを行う。

  • Research Products

    (15 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 6 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 5 results) Book (3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Lysine demethylase LSD1 coordinates glycolytic and mitochondrial metabolism in hepatocellular carcinoma cells2015

    • Author(s)
      A. Sakamoto, S. Hino, K. Nagaoka, K. Anan, R. Takase, H. Matsumori, H. Ojima, Y. Kanai, K. Arita, and M. Nakao.
    • Journal Title

      Cancer Res.

      Volume: 75 Pages: 1445-1456

    • DOI

      10.1158/0008-5472.CAN-14-1560

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Lysine-specific demethylase LSD2 suppresses lipid influx and metabolism in hepatic cells2015

    • Author(s)
      K. Nagaoka, S. Hino, A. Sakamoto, K. Anan, R. Takase, T. Umehara, S. Yokoyama, Y. Sasaki, and M. Nakao.
    • Journal Title

      Mol. Cell. Biol.

      Volume: 35 Pages: 1068-1080

    • DOI

      10.1128/MCB.01404-14

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Glycolytic genes as the targets of a nuclear receptor Ad4BP/SF-12014

    • Author(s)
      T. Baba, H. Otake, T. Sato, K. Miyabayashi, Y. Shishido, C-Y. Wang, Y. Shima, H. Kimura, M. Yagi, Y. Ishihara, S. Hino, H. Ogawa, M. Nakao, T. Yamazaki, D. Kang, Y. Ohkawa, M. Suyama, B-C. Chung, and K. Morohashi.
    • Journal Title

      Nat. Commun.

      Volume: 5 Pages: 3634

    • DOI

      10.1038/ncomms4634

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] IGF2 DMR0 methylation, loss of imprinting, and patient prognosis inesophageal squamous cell carcinoma2014

    • Author(s)
      A. Murata, Y. Baba, M. Watanabe, H. Shigaki, K. Miyake, T. Ishimoto, M. Iwatsuki, S. Iwagami, N. Yoshida, E. Oki, M. Morita, M. Nakao, and H. Baba.
    • Journal Title

      Ann. Surg. Oncol.

      Volume: 21 Pages: 1166-1174

    • DOI

      10.1245/s10434-013-3414-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Computational image analysis of colony and nuclear morphology to evaluate human induced pluripotent stem cells2014

    • Author(s)
      K. Tokunaga, N. Saitoh, I.G. Goldberg, C. Sakamoto, Y. Yasuda, Y. Yoshida, S. Yamanaka, and M. Nakao.
    • Journal Title

      Sci. Rep.

      Volume: 4 Pages: 6996

    • DOI

      10.1038/srep06996

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Sall1 maintains nephron progenitors and nascent nephrons by acting as both an activator and a repressor2014

    • Author(s)
      S. Kanda, T. Ohmori, A. Taguchi, K. Kudo, T. Horiuchi, Y. Sato, S. Hino, Y. Suzuki, M. Sander, S. Sugano, M. Nakao, and R. Nishinakamura.
    • Journal Title

      J. Am. Soc. Nephrol.

      Volume: 25 Pages: 2584-2595

    • DOI

      10.1681/ASN.2013080896

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 癌細胞内代謝の細胞外微小環境への適応におけるヒストン脱メチル化酵素LSD1の役割2014

    • Author(s)
      坂元顕久、日野信次朗、長岡克弥、阿南浩太郎、高瀬隆太、中尾光善
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜市
    • Year and Date
      2014-11-26 – 2014-11-26
    • Invited
  • [Presentation] Histone demethylase LSD1 regulates metabolism in skeletal muscle cells2014

    • Author(s)
      K. Anan, S. Hino, A. Sakamoto, K. Nagaoka, R. Takase, and M. Nakao
    • Organizer
      第37回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜市
    • Year and Date
      2014-11-25 – 2014-11-25
    • Invited
  • [Presentation] エピジェネティクス:現代人の生命のプログラム2014

    • Author(s)
      中尾光善
    • Organizer
      日本老年医学会北陸地方会
    • Place of Presentation
      金沢医科大学、金沢市
    • Year and Date
      2014-10-25 – 2014-10-25
    • Invited
  • [Presentation] Epigenetic cell regulation in energy metabolism and cancer2014

    • Author(s)
      M. Nakao
    • Organizer
      第87回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館、京都市
    • Year and Date
      2014-10-18 – 2014-10-18
    • Invited
  • [Presentation] Epigenetic cell regulation in energy metabolism and cancer2014

    • Author(s)
      M. Nakao
    • Organizer
      9th Asian Epigenomics Meeting
    • Place of Presentation
      シンガポール国立大学、シンガポール
    • Year and Date
      2014-08-26 – 2014-08-26
    • Invited
  • [Book] 驚異のエピジェネティクス-遺伝子がすべてではない!? 生命のプログラムの秘密2014

    • Author(s)
      中尾光善
    • Total Pages
      214
    • Publisher
      羊土社
  • [Book] エピジェネティクスの産業応用(分担執筆)2014

    • Author(s)
      高瀬隆太、日野信次朗、中尾光善.
    • Total Pages
      393
    • Publisher
      シーエムシー出版
  • [Book] バイオ画像解析 手とり足とりガイド(分担執筆)2014

    • Author(s)
      斉藤典子、坂本智代美、松森はるか、中尾光善、Ilya G. Goldberg
    • Total Pages
      221
    • Publisher
      羊土社
  • [Remarks] 熊本大学発生医学研究所

    • URL

      http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp

URL: 

Published: 2016-06-01  

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