2002 Fiscal Year Annual Research Report

一方向のプロトン輸送をもたらすバクテリオロドプシン内の疎水結合と水素結合

Research Project

Project/Area Number	14045238
Research Institution	Nagoya Institute of Technology
Principal Investigator	神取秀樹名古屋工業大学, 工学部, 助教授 (70202033)
Keywords	レチナール / 疎水結合 / プロトン移動 / 赤外分光法 / 光反応中間体 / 水素結合ネットワーク / 内部結合水 / 同位体効果
Research Abstract	バクテリオロドプシンは光エネルギーを用いたプロトンの能動輸送によってエントロピーの減少をもたらす。光反応サイクルによるリサイクル性も併せ、理想的なソフトマテリアルである。本研究ではこれまでブラックボックスであった能動輸送の方向性を、プロトン取込側での疎水的領域の構造解析を中心として明らかにすることを目指している。平成14年度は、低温偏光赤外分光などを用いた実験的研究により、以下のような研究成果が得られた。バクテリオロドプシンのレチナールシッフ塩基は、異性化反応においても、プロトン移動反応においても重要な役割を演じる。このN-H基がどのような配向をしているかを低温偏光赤外分光法により調べたところ、異性化によって膜に平行に配向することがわかった。シッフ塩基領域にねじれをもった初期中間体の生成は、光エネルギーの取込やその後のプロトン移動過程に重要な役割を演じるものと考えられる。光をエネルギーに変換するバクテリオロドプシンに対して、同じ古細菌ロドプシンでありながらフォボロドプシンは伝達蛋白質を活性化することによって光を情報へと変換する。そして伝達蛋白質が存在しないとプロトンをポンプすることが知られている。そこで、バクテリオロドプシンを対照としたフォボロドプシンの低温赤外分光による構造変化の解析を行った。その結果、異性化による構造変化が拡大していることやN中間体の蛋白質構造をもたないことなどを明らかにした。

Research Products

(16 results)

All Other

All Publications (16 results)

[Publications] T.Nagata et al.: "Isomer-Specific Interaction of the Retinal Chromophorewith Threonine-118 in Rhodopsin"J.Phys.Chem.A. 106. 1969-1975 (2002)
[Publications] H.Kandori et al.: "Excited-State Dynamics of pharaonis Phoborhodopsin Probed by Femtosecond Fluorescence Spectroscopy"J.Phys.Chem.A. 106. 2091-2095 (2002)
[Publications] H.Kandori et al.: "Photoisomerization of the Rhodopsin Chromophore in Clay Interlayers at 77K"Chem.Phys.Lett.. 354. 251-255 (2002)
[Publications] H.Kandori et al.: "Interaction of Asn105 with the Retinal Chromophore During Photoisomerization of pharaonis Phoborhodopsin"Biochemistry. 41. 4554-4559 (2002)
[Publications] H.Kandori et al.: "Vibrational Frequency and Dipolar Orientation of the Protonated Schiff Base in Bacteriorhodopsin before and after Photoisomerization"Biochemistry. 41. 6026-6031 (2002)
[Publications] K.Shimono et al.: "A pharaonis Phoborhodopsin Mutant with the Same Retinal Binding Site Residues as in Bacteriorhodopsin"Biochemistry. 41. 6504-6509 (2002)
[Publications] M.Iwamoto et al.: "Role of Asp193 in Chromophore-Protein Interaction of pharaonis Phoborhodopsin (Sensory Rhodopsin II)"Biophys.J.. 83. 1130-1135 (2002)
[Publications] T.Iwata et al.: "Photoreaction of the Cysteine S-H Group in the LOV2 Domain of Adiantum Phytochrome3"J.Am.Chem Soc.. 124. 11840-11841 (2002)
[Publications] Y.Furutani et al.: "FTIR Spectroscopy of the M Photointermediate in pharaonis Phoborhodopsin"Biophys.J.. 83. 3482-3489 (2002)
[Publications] Y.Furutani, H.Kandori: "Internal Water Molecules of Archaeal Rhodopsins"Mol.Membr.Biol.. 19. 257-265 (2002)
[Publications] 神取秀樹: "バクテリオロドプシンのプロトンポンプ機構"酵素工学ニュース. 47. 17-22 (2002)
[Publications] 神取秀樹, 加茂直樹: "フォボロドプシンの結晶構造と波長制御・光情報伝達機構"蛋白質核酸酵素. 47. 620-625 (2002)
[Publications] 神取秀樹: "光駆動プロトンポンプの方向性を決める反応"化学. 57. 58-59 (2002)
[Publications] T.Tanimoto et al.: "Structural Changes of Water in the Schiff Base Region of Bacteriorhodopsin : Proposal of a Hydration Switch Model"Biochemistry. 42. 2300-2306 (2003)
[Publications] H.Kandori et al.: "Photoisomerization of the Rhodopsin Chromophore in Clay Interlayers at 77K"Biochemistry. 42. 2790-2796 (2003)
[Publications] 神取秀樹: "視覚野初期過程における光化学反応"レーザー研究. (印刷中). (2003)

2002 Fiscal Year Annual Research Report

一方向のプロトン輸送をもたらすバクテリオロドプシン内の疎水結合と水素結合

Principal Investigator

神取 秀樹 名古屋工業大学, 工学部, 助教授 (70202033)

Research Products

[Publications] T.Nagata et al.: "Isomer-Specific Interaction of the Retinal Chromophorewith Threonine-118 in Rhodopsin"J.Phys.Chem.A. 106. 1969-1975 (2002)

[Publications] H.Kandori et al.: "Excited-State Dynamics of pharaonis Phoborhodopsin Probed by Femtosecond Fluorescence Spectroscopy"J.Phys.Chem.A. 106. 2091-2095 (2002)

[Publications] H.Kandori et al.: "Photoisomerization of the Rhodopsin Chromophore in Clay Interlayers at 77K"Chem.Phys.Lett.. 354. 251-255 (2002)

[Publications] H.Kandori et al.: "Interaction of Asn105 with the Retinal Chromophore During Photoisomerization of pharaonis Phoborhodopsin"Biochemistry. 41. 4554-4559 (2002)

[Publications] H.Kandori et al.: "Vibrational Frequency and Dipolar Orientation of the Protonated Schiff Base in Bacteriorhodopsin before and after Photoisomerization"Biochemistry. 41. 6026-6031 (2002)

[Publications] K.Shimono et al.: "A pharaonis Phoborhodopsin Mutant with the Same Retinal Binding Site Residues as in Bacteriorhodopsin"Biochemistry. 41. 6504-6509 (2002)

[Publications] M.Iwamoto et al.: "Role of Asp193 in Chromophore-Protein Interaction of pharaonis Phoborhodopsin (Sensory Rhodopsin II)"Biophys.J.. 83. 1130-1135 (2002)

[Publications] T.Iwata et al.: "Photoreaction of the Cysteine S-H Group in the LOV2 Domain of Adiantum Phytochrome3"J.Am.Chem Soc.. 124. 11840-11841 (2002)

[Publications] Y.Furutani et al.: "FTIR Spectroscopy of the M Photointermediate in pharaonis Phoborhodopsin"Biophys.J.. 83. 3482-3489 (2002)

[Publications] Y.Furutani, H.Kandori: "Internal Water Molecules of Archaeal Rhodopsins"Mol.Membr.Biol.. 19. 257-265 (2002)

[Publications] 神取秀樹: "バクテリオロドプシンのプロトンポンプ機構"酵素工学ニュース. 47. 17-22 (2002)

[Publications] 神取秀樹, 加茂直樹: "フォボロドプシンの結晶構造と波長制御・光情報伝達機構"蛋白質核酸酵素. 47. 620-625 (2002)

[Publications] 神取秀樹: "光駆動プロトンポンプの方向性を決める反応"化学. 57. 58-59 (2002)

[Publications] T.Tanimoto et al.: "Structural Changes of Water in the Schiff Base Region of Bacteriorhodopsin : Proposal of a Hydration Switch Model"Biochemistry. 42. 2300-2306 (2003)

[Publications] H.Kandori et al.: "Photoisomerization of the Rhodopsin Chromophore in Clay Interlayers at 77K"Biochemistry. 42. 2790-2796 (2003)

[Publications] 神取秀樹: "視覚野初期過程における光化学反応"レーザー研究. (印刷中). (2003)

神取秀樹名古屋工業大学, 工学部, 助教授 (70202033)