SNPを用いた顎変形症における遺伝要因のゲノム解析

2002 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 14657521
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: 飯塚 忠彦 京都大学, 医学研究科, 教授 (80026921)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 菅井 学 京都大学, 遺伝子実験施設, 助手 (90303891) ; 高橋 克 京都大学, 医学研究科, 助手 (90314202) ; 清水 章 京都大学, 医学研究科, 教授 (00162694)
• Keywords: 顎変形症 / ゲノム / 遺伝要因

Research Abstract

顎変形症のゲノム解析については、本学の医の倫理委員会にて審査の績果、承認を受けた。
1、顎変形症患者の血液サンブルの収集
平成14年度内に京都大学医学部附属病院口腔外科において、顎矯正外科手術を受ける予定の前後的、垂直的な顎間関係に大きなバリエーションのある顎変形症患者を対象として、十分なインフォームドコンセントを行った後、同意を得られた患者より、10mlの採血を行った。各サンプルを匿名化後、5mlは冷凍保存し、5mlよりgenomic DNAを抽出している。現在までのところ、10例ほどのサンプルを冷凍保存およびgenomic DNAを抽出した。
2,候補遺伝子の探索
上記のgenomic DNAを用いて、顎変形や奇形を伴う症候群、疾患の原因遺伝子である鎖骨頭蓋異形成症におけるcbfa1、Treacher-Collins syndromeにおけるtreacleなどについて、各エクソンごとにgenomic PCRを行った。各エクソンについて、エクソン-イントロンの境界部及びエクソンの翻訳領域、調節領域に関して、センスストランドとアンチセンスストランド両方向について、ダイレクトシークエンスを行った。現在までのところ、塩基配列の挿入や欠失および、ノンセンス変異やミスセンス変異を引き起こすようなSNPなどの塩基置換は見い出されていない。今後更に症例数を増やして、現在検討しているところである。

Research Products

• [Publications] Sugai M et al.: "Essential role of Id2 in negative regulation of IgE class switching"Nat. Immunol.. 4(1). 25-30 (2003)
• [Publications] Katakai T., Sugai M.et al.: "Chemokine-independent preference of T-helper-1 cells in trans-endothelial migration"J. Biol Chem.. 277(52). 50948-50958 (2002)
• [Publications] Kusunoki T., Sugai M et al.: "Th_2 dominance and defective development of a CD8+ dendric cell subset in Id2-deficent mice"J Allergy Clin. Immunol. 111(1). 136-142 (2003)
• [Publications] Okamoto H.Kosugi S et al.: "A novel six-nucleotide insertion in exon 4 of the MEN1 gene, 878ins CTGCAG, in three patients with familial insulinoma and primary hyperparathyroidism"Jpn J Clin Oncol. 32(9). 368-370 (2002)