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2019 Fiscal Year Annual Research Report

転写因子によるRNAポリメラーゼの構造変化と転写制御のメカニズム

Research Project

Project/Area Number 15H04344
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

関根 俊一  国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, チームリーダー (50321774)

Project Period (FY) 2015-04-01 – 2020-03-31
KeywordsRNAポリメラーゼ / 転写 / 転写因子 / ヌクレオソーム / クライオ電子顕微鏡 / X線結晶構造解析 / 転写伸長 / 転写終結
Outline of Annual Research Achievements

遺伝子の転写は、転写開始・伸長・終結からなる多段階の複雑なプロセスである。RNAポリメラーゼ (RNAP) は、それ単独では遺伝子の転写を遂行することはできず、多くの転写因子がRNAPと複合体を形成してその機能を補助することで転写は達成される。転写を担うRNAP複合体の構造および転写因子等による制御のメカニズムを解明するために、本年度は以下のように研究を進めた。
これまでに、RNAポリメラーゼII (RNAP II) にヌクレオソームDNAを転写させて得られた反応産物をクライオ電子顕微鏡をもちいて解析することで、RNAP IIが如何にしてヌクレオソーム構造をとったDNAを転写するのかを明らかにした。また、転写伸長因子の存在下で得られた複合体のクライオ電子顕微鏡解析により、これらの因子がどのようRNAP IIを助け、スムーズなヌクレオソームDNAの転写を実現しているのかを明らかにした。本年度は引き続き、さらに多くの因子を用い、真核生物の核内で起こっているDNAの転写の本質を明らかにすべく研究を進めた。
細菌では、RNAPによるDNAの転写はリボソームによるmRNAの翻訳と密に連携している。細菌のRNAPとリボソームが組み合わさって形成される転写・翻訳共役複合体を試験管内で再構成し、クライオ電子顕微鏡解析を行なった。特に、転写と連携した翻訳開始に着目し、RNAP転写伸長複合体にリボソーム30Sサブユニットが結合した複合体の構造解析を推進した。また、転写の最終段階では、転写終結因子RhoがRNAPにアクセスし、DNA/RNAの解離を促して転写を終結に導く。Rhoによる転写終結のメカニズムを明らかにするために、Rho-RNAP複合体の構造機能解析を進めた。

Research Progress Status

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和元年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (7 results)

All 2020 2019 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Overview of the “1SBA: integrative approaches towards understanding of gene expression” session at the 57th BSJ meeting2020

    • Author(s)
      Mori Takaharu、Sekine Shun-ichi
    • Journal Title

      Biophysical Reviews

      Volume: 12 Pages: 253~254

    • DOI

      10.1007/s12551-020-00644-1

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structural basis of nucleosome transcription by RNA polymerase II2019

    • Author(s)
      関根俊一
    • Organizer
      日本生物物理学会 第57回年会
  • [Presentation] Structural basis of the RNA polymerase II elongation complex with basal factors2019

    • Author(s)
      関根俊一
    • Organizer
      CSHL Meeting Mechanisms of Eukaryotic Transcription
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] RNA ポリメラーゼ II によるクロマチン転写の構造基盤2019

    • Author(s)
      関根俊一
    • Organizer
      日本植物学会第83回大会
    • Invited
  • [Presentation] Structural basis of cellular transcription by RNA polymerase II2019

    • Author(s)
      関根俊一
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会年会 合同年次大会
    • Invited
  • [Presentation] Structural basis of chromatin transcription by RNA polymerase II2019

    • Author(s)
      関根俊一
    • Organizer
      Gordon Research Conference Mechanisms of Microbial Transcription
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 研究室ホームページ

    • URL

      http://www.clst.riken.jp/activity/structuralbiology_group1_team2.html

URL: 

Published: 2021-01-27  

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