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2008 Fiscal Year Annual Research Report

生理活性発現分子機構に基づく生物活性物質の創製

Research Project

Project/Area Number 16002007
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

磯部 稔  Nagoya University, 大学院・生命農学研究科, 名誉教授 (00023466)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 安立 昌篤  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 助教 (80432251)
久世 雅樹  名古屋大学, 物質科学国際研究センター, 助教 (40335013)
Keywords構造認識機構 / タンパク質脱リン酸酵素阻害剤 / 時間読みタンパク質 / テトロドトキシン / シガトキシン
Research Abstract

生理活性天然有機化合物について構造決定・全合成・類縁活性体の化学合成に次いで、作用発現の分子機構解明という総合的研究分野が形成された。最近では生物有機化学を基礎としてこれら生理活性天然有機化合物の生物機能を、分子レベルで水素原子の位置までを特定してタンパク質分子との相互作用研究が超微量で実行可能となってきた。生理活性天然有機低分子と生体高分子の構造を相互に識別し合う分子間相互作用の基本原理を解明することは急務であり、かつ実現も夢ではなく目的とすることができるようになった。ChemicalBiologyという領域名称は生物から化学まで広域にわたっているが、生物現象の多くは化学物質により情報伝達されることでうまく機能しており、その機能分子に重心を置いた生物分子科学と定義できよう。分子情報伝達は、生理活性物質とその標的タンパク質分子との複合体形成を鍵段階として引き起こされる。活性発現の場では、構造認識機構によって分子情報が伝達され、活性発現のカスケード機構が働いており、その分子(あるいは標識物質)を直接・間接に観察する方法論確立を目標とする。すでに研究代表者磯部は、未来開拓研究事業のプロジェクトリーダー(H8-12年度)及び、更に新領域として文科省科研費特別推進研究(H16-20年度)として、分子情報伝達のもとになる生理活性天然有機化合物がタンパク質巨大分子の中で果たす分子構造相互認識機構の役割と原理を解明する手法を確立した。この手法をさらに発展させ、有機合成をあわせて駆使して、活性の著しい天然有機化合物とタンパク質を模範とする分子間相互作用を解明し、究極的にはそこで明らかになった分子情報伝達の原理を創薬化学に利用する道を開拓することを目的とする

  • Research Products

    (22 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (16 results) (of which Peer Reviewed: 16 results) Presentation (3 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Syntheses of N-Acylisoxazolidine Derivatives, related to a partial structure found in Zetekitoxin AB, a golden frog poison2009

    • Author(s)
      Nishikawa, T. ; Urabe, D. ; Isobe, M
    • Journal Title

      Heterocycles 79

      Pages: 379-385

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Differentiation of Coelenteramide Sulfates from Phosphates by means of Hydrogen/Deuterium Exchange with Ion Trap Mass Spectrometry2009

    • Author(s)
      Doi, I. ; Kuse, M. ; Nakashima, Y. ; Tani, N. ; Isobe, M.
    • Journal Title

      JMSS (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Total Synthesis of Ciguatoxin2009

    • Author(s)
      Hamaiima, A. ; Isobe, M.
    • Journal Title

      Angew. Chem. Mt. Ed. 48

      Pages: 2941-2945

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Higher Structure of Cereulide, an emetic toxin from Bacillus cereus, with special comparison with Valinomycin, an antibiotic from Streptomyces fulvissimus2009

    • Author(s)
      Makarasen, A. ; Yoza, K. ; Isobe, M.
    • Journal Title

      Chem. Asian J. 4

      Pages: 688-698

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Novel Stereocontrolled Synthesis of Highly-functionalized Cyclobutanes by Epoxide Opening through a Carbanion Intermediate in Heteroconiugate Addition2009

    • Author(s)
      Adachi, M. ; Yamauchi, E. ; Komada, T. ; Isobe, M
    • Journal Title

      Synlett

      Pages: 1157-1161

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular Heterogeneity of TIME-EA 4, a Timer Protein in Silkworm Diapause Eggs. Suthasinee Pitchayawasin-Thapphasaraphong2009

    • Author(s)
      Tani N., Isobe, M., Kai, H., Kurahashi, T., Kato,J., Trisunan. S.
    • Journal Title

      Biochem. Biosciences and Biotechnology (Accepted for publication)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of four Lysine-linked cereulide analogs showing K^+ ionophoric activity as lead compounds for emetic toxin-detection by immunoassays2009

    • Author(s)
      Makarasen, A. ; Nishikawa, T. ; Isobe. M
    • Journal Title

      Synthesis (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ^1 H NMR Aided Elucidation of Products Derived from Photodegradation of Ethyl 3-azido-4,6-difluorobenzoate in 2, 2, 2-Trifluoroethanol2009

    • Author(s)
      Sydnes, M. O. ; Kuse, M. ; Doi, I. ; Isobe, M.
    • Journal Title

      Tetrahedron 65

      Pages: 3863-3870

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Selective protein modification by the hydroperoxide intermediate in a photoprotein, aequorin2009

    • Author(s)
      Doi, I, Kuse, M., Nishikawa. T., Isobe, M.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. 17

      Pages: 3399-3404

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Substituent effect of imino-O-arenesulfonates, a coupling partner in Suzuki-Miyaura Reaction for substitution of the Pyrazine Ring : A Study for the Synthes is of Coelenterazine Analogs2009

    • Author(s)
      Makarasen, A. ; Kuse,_M. ; Nishikawa, T. ; Isobe, M.
    • Journal Title

      Bulletin of Chemical Society of Japan (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A relaxin-like peptide purified from radial nerves induces oocyte maturation and ovulation in starfish, Asterina pectinifera2009

    • Author(s)
      Mita, M. ; Yoshikuni, M. ; Ohno, K.;Shibata, Y. ; Bindhu Paul-Pr asanth ; Suthasinee Pitchayawasin ; Isobe, M. ; Nagahama, Y.
    • Journal Title

      Proc. National Academy of Sciences (published on-line)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Protein Phosphatase Inhibitory Activity of Tautomycin Photoaffinity Probes Evaluated at Femto-molar Level2008

    • Author(s)
      Sydnes, M.O., Kuse,M., Kurono, M., Shimomura, A., Ohinata, H., Takai. A Isobe, M.
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. 16

      Pages: 1747-1755

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of N-Hydroxyenamide, a potential precursor of chartelline2008

    • Author(s)
      Kajii, S. ; Nishikawa, T. ; Isobe, M.
    • Journal Title

      Tetrahedron Lett. 49

      Pages: 594-597

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] One-Pot Reductive Monoalkylation of Nitro Aryls with Hydrogen over Pd/C2008

    • Author(s)
      Sydnes, M. O. ; Isobe, M.
    • Journal Title

      Tetrahedron Lett. 7

      Pages: 1199-1202

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cysteine 390 is the binding site of luminous substance with symplectin, a photoprotein of Okinawan squid, Symplectoteuthis oualaniensis2008

    • Author(s)
      Isobe, M. ; Kuse, M. ; Tani N. ; Fujii, T. ; Matsuda, T.
    • Journal Title

      Proc. Jpn. Acad., Ser. B. 84

      Pages: 386-392

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regioselectivity of Larock indol synthesis using functionalized alkynes2008

    • Author(s)
      Sugino, K. ; Yoshimura, H. ; Nishikawa, T. ; Isobe, M.
    • Journal Title

      Biosci. Biotech. Biochem. 72

      Pages: 2092-2102

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Total Synthesis of Natural Products and Chemical Biology2008

    • Author(s)
      M. ISOBE
    • Organizer
      3^<rd> International Conference on Cutting-Edge Organic Chemistry in Asia, Plenary Lecture
    • Place of Presentation
      Liu Ying Hotel, Hangzhou, China
    • Year and Date
      20081019-23
  • [Presentation] 15^<th> ISBC 2008 (International Symposium on Bioluminescence and Chemiluminescence", Plenary Lecture2008

    • Author(s)
      M. ISOBE
    • Organizer
      15^<th> ISBC 2008 (International Symposium on Bioluminescence and Chemiluminescence", Plenary Lecture
    • Place of Presentation
      Shanghai, China
    • Year and Date
      20080513-17
  • [Presentation] Stanford-Roche Lecture2008

    • Author(s)
      M. ISOBE
    • Organizer
      Stanford University
    • Place of Presentation
      Stanford University, U. S. A
    • Year and Date
      2008-04-23
  • [Book] 「天然物化学・生物有機化学I-天然物化学-」朝倉化学大系13巻2008

    • Author(s)
      北川勲・磯部稔
    • Total Pages
      369
    • Publisher
      朝倉書店
  • [Book] 「天然物化学・生物有機化学II-全合成・生物有機化学-」朝倉化学大系14巻2008

    • Author(s)
      北川勲・磯部稔
    • Total Pages
      278
    • Publisher
      朝倉書店
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.agr.nagoya-u.ac.jp/~organic/index2.html

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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