多種情報源からのデータマイニング手法による肝炎知識の発見

2005 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 16300043
• Research Institution: Japan Advanced Institute of Science and Technology
• Principal Investigator: TU BAO HO 北陸先端科学技術大学院大学, 知識科学研究科, 教授 (60301199)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 高林 克日己 千葉大学, 医学部付属病院, 教授 (90188079) ; 河崎 さおり 北陸先端科学技術大学院大学, 知識科学研究科, 助手 (40377437) ; TUAN Nam Tran 北陸先端科学技術大学院大学, 知識科学研究科, 助手 (60362018)
• Keywords: hepatitis / temporal abstraction / text mining / expert evaluation

Research Abstract

平成17年度の主な成果は下記3点である.
1.時系列抽象化における新たな手法の開発.
ウイルス性肝炎に関して血液検査等における事象間の時系列パターンあるいは「ZTTおよびTTTの検査値において高値をベースに突出値が発生する前にALP値が正常値から高い異常値へと変化する」などの時区間関係の検出・探索を行う時区間関係抽出法を開発した.この手法により,元の慢性肝炎患者の検査履歴データから問題発見につながる重要なデータセットを生成し,多様なデータマイニング手法を適用し新規で有用な知識を発見することが可能となる.
2.肝炎に関するMEDLINEの論文アブストラクトに対するマイニング手法の開発.
背景知識を獲得し,他の発見に活用するための手法であり,肝炎に関する7万件の論文アブストラクトを検討し,その結果を他の研究手法との関連付けることで他の手法による発見成果の解釈や他の手法における探索空間の絞込みなどに役立てることができる.
3.医療専門家の発見の評価.
医療専門家との継続的な議論を通して,彼らから上記手法等による発見の評価を受け,手法や発見の限界や今後の展開について明確にする.最終的には肝炎研究の先端に貢献するよりよい成果を得ることを目指し,上記3点を組合わせる研究活動を行ってきた.

Research Products

• [Journal Article] Exploiting Temporal Relations in Mining Hepatitis Data (2006)
  • Author(s): Ho, T.B., Nguyen, C.H., Kawasaki, S., Le, S.Q., Takabayashi, K.
  • Journal Title: Journal of New Generation Computing (in press)
• [Journal Article] Knowledge Visualization in Hepatitis Study (2006)
  • Author(s): Nguyen, D.D., Ho, T.B., Kawasaki, S.
  • Journal Title: Asia Pacific Symposium on Information Visualization APVIS 2006 Pages: 59-62
• [Journal Article] Qualitatively Predicting Acetylation and Methylation Areas in DNA Sequences (2005)
  • Author(s): Pham, T.H., Tran, D.H., Ho, T.B., Satou, K., Valiente, G.
  • Journal Title: Genome Informatics Vol.16,No.2 Pages: 3-11
• [Journal Article] Extracting background knowledge from medical literature (2005)
  • Author(s): Kawasaki, S., Ho, T.B
  • Journal Title: First World Congress of the International Federation for Systems Research(IFSR'05), Symposium on Data/Text Mining from Large Databases Pages: 280-287
• [Journal Article] An Association-based Dissimilarity Measure for Categorical Data (2005)
  • Author(s): Le, S.Q., Ho, T.B
  • Journal Title: Pattern Recognition Letters 26(16) Pages: 2549-2557
• [Journal Article] Temporal Relations in Mining Hepatitis Data (2005)
  • Author(s): Ho, T.B., Kawasaki, S., Le, S.Q., Nguyen, C.H., Takabayashi, K.
  • Journal Title: International workshop on Knowledge Discovery and Data Management in Biomedical Science
• [Book] Lecture Notes in Artificial Intelligence LNAI 3518(Advances in Knowledge Discovery and Data Mining(Eds.)) (2005)
  • Author(s): Ho, T.B., Cheung, D.Liu, H.
  • Publisher: Springer