2016 Fiscal Year Research-status Report
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16K15506
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| Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research |
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Principal Investigator |
伊川 友活 国立研究開発法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 上級研究員 (60450392)
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| Project Period (FY) |
2016-04-01 – 2018-03-31
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| Keywords | B細胞分化 / 1細胞発現解析 / 運命決定 / 転写因子 / 造血幹細胞 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
B細胞を含むすべての血液・免疫細胞は造血幹細胞から作られる。その過程で多能性の造血幹細胞は徐々に分化能が限定されていき、最終的にB細胞にしかなれない前駆細胞に運命決定される。この運命決定は様々な転写因子やエピジェネティック因子によって制御されているが、詳細は明らかでない。特に、個々の細胞レベルの遺伝子発現調節機構は不明である。申請者らは最近B細胞への運命決定における分子機構を調べることの出来る新しい分化誘導系を開発した（Ikawa et al. Stem Cell Reports,2015）。そこで本研究ではこの培養系を用いて、経時的に個々の細胞のRNA発現解析を行い、多能前駆細胞からB細胞への運命決定を制御する転写ネットワークを１細胞レベルで明らかにすることを目的とする。
本年度は研究計画に従い、多能前駆（iLS）細胞の作成、B細胞への分化誘導、経時サンプルの採取、およびDrop-seq法を用いた1細胞レベルでのRNA発現解析を行った。クラスタリング解析を行ったところ、分化誘導前のサンプルは2つのクラスターに分けられるが、分化誘導後は1つのクラスターであることが示された。また、分化誘導前には多能性を示す様々な遺伝子発現が認められたが、分化誘導後にはほとんどの細胞においてこれらの遺伝子発現は消失し、代わりにB細胞特異的遺伝子の発現が認められた。このことから、iLS細胞の分化誘導系では、B細胞分化プログラムが個々の細胞において同調的に一斉に誘導されることが明らかとなった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
研究計画通り、iLS細胞のB細胞分化誘導系を用いて1細胞レベルでの遺伝子発現解析を行った。その結果、B細胞関連遺伝子プログラムが分化誘導後にほとんどの細胞において誘導されることが明らかとなった。
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| Strategy for Future Research Activity |
研究はほぼ計画通りに進んでいる。今後は生体内の細胞についても同様の解析を行い、論文にまとめることを目標に進めていきたい。
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[Journal Article] Conversion of T cells to B cells by inactivation of polycomb-mediated epigenetic suppression of the B-lineage program2016
Author(s)
Ikawa T, Masuda K, Endo TA, Endo M, Isono K, Koseki Y, Nakagawa R, Kometani K, Takano J, Agata Y, Katsura Y, Kurosaki T, Vidal M, Koseki H, Kawamoto H
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Journal Title
Genes & Development
Volume: 30
Pages: 2475-2485
Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Transient Tcf3 gene repression by TALE-tanscription factor targeting2016
Author(s)
Masuda J, Kawamoto H, Strober W, Takayama-E, Mizutani A, Murakami H, Ikawa T, Kitani A, Maeno N, Shigehiro T, Satoh A, Seno A, Arun V, Kasai T, Fuss IJ, Katsura Y, Seno M
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Journal Title
Appl Biochem Biotechnol
Volume: 180
Pages: 1559-1573
Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
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