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2017 Fiscal Year Annual Research Report

放線菌由来新規ニトロ化酵素の同定と芳香族ジアミン生産系の開発

Research Project

Project/Area Number 17J06071
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

冨田 宏矢  東京大学, 農学生命科学研究科, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2017-04-26 – 2020-03-31
Keywords放線菌 / 生合成 / Streptomyces / シトクロムP450 / 非リボソームペプチド / 二次代謝 / 天然物
Outline of Annual Research Achievements

これまでに放線菌Streptomyces atratusのドラフトゲノム解析を行い、rufomycin生合成を担うと予想される遺伝子クラスターを取得し、その中からチロシンのニトロ化酵素の候補遺伝子rufOを発見した。今年度はrufomycin生合成遺伝子クラスターの遺伝学的解析、RufOの酵素学的解析、RufOの結晶化条件の検討に関して研究を行った。
遺伝学的解析では、rufO遺伝子破壊株の作製を行い、そのrufomycin生産能を調べた。その結果、遺伝子破壊株はrufomycin生産能を失った一方で、その培地中にニトロチロシンを添加した場合、rufomycinの生産が回復することがわかった。このことから、RufOは予想通りチロシンのニトロ化酵素であり、そのニトロ化反応はrufomycinのペプチド骨格形成に先立って、遊離のチロシンを基質として行われることが強く示唆された。次に酵素学的解析では、RufO組換えタンパク質が確かにチロシンのニトロ化反応を触媒することを明らかにし、遺伝学的解析の結果が強く支持された。また基質特異性に関して検証を行った結果、RufOはチロシンに対して高い特異性を示すことを明らかにした。結晶化実験では、RufOの結晶化条件のスクリーニングを行い、再現性よく結晶化する条件を発見した。
以上の結果より、RufOが予想通りチロシンをニトロ化する酵素であることを明らかにし、酵素学的に重要な知見を得ることができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

研究計画に従い、rufomycin生合成についての知見を得ることができた。また目的のチロシンニトロ化酵素RufOの取得に成功した。この結果は酵素学的に大きな成果であると考えられ、シトクロムP450酵素の新たな能力を示すことができたとともに、今後さらなる研究への波及効果が期待できる。またRufOの結晶化条件を発見し、今後の研究推進への展望も拓けている。さらに芳香族ニトロ基に関する別のアプローチとして、芳香族アミノ基を酸化的にニトロ基へと変換する放線菌由来の酵素AurFに関しても検証を重ねた。以上より、当初の研究計画以上に進展していると考える。

Strategy for Future Research Activity

基本的には当初の研究計画に則って進める。結晶構造解析実験が難航した場合、RufOのホモログを用いた解析を行う必要が生じる可能性がある。

  • Research Products

    (4 results)

All 2018 2017 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Identification and characterization of a bacterial cytochrome P450 monooxygenase catalyzing the 3-nitration of tyrosine in rufomycin biosynthesis2017

    • Author(s)
      Hiroya Tomita, Yohei Katsuyama, Hiromichi Minami, and Yasuo Onishi
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 292 Pages: 15859-15869

    • DOI

      10.1074/jbc.M117.791269

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 芳香族アミノ基酸化酵素の位置選択性改変系の構築2018

    • Author(s)
      冨田宏矢、勝山陽平、大西康夫
    • Organizer
      日本農芸化学会 2018 年度大会
  • [Presentation] Identification and characterization of a novel cytochrome P450 catalyzing tyrosine nitration in rufomycin biosynthesis2017

    • Author(s)
      Hiroya Tomita, Yohei Katsuyama, and Yasuo Onishi
    • Organizer
      18th International Symposium on the Biology of Actinomycetes
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 放線菌が持つチロシンニトロ化酵素の発見

    • URL

      http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2017/20171211-1.html

URL: 

Published: 2018-12-17  

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