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2020 Fiscal Year Research-status Report

植物免疫を支える核膜孔を介した新しいクロマチン機能制御

Research Project

Project/Area Number 18K06283
Research InstitutionUniversity of Shizuoka

Principal Investigator

田村 謙太郎  静岡県立大学, 食品栄養科学部, 准教授 (40378609)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Keywordsシロイヌナズナ / 核膜 / 核膜孔 / 核ラミナ / 遺伝子発現制御 / 花粉
Outline of Annual Research Achievements

核膜は外膜・内膜・核膜孔・核ラミナから構成されている多機能バリアーである.細胞質と核内を結ぶ唯一の通り道である核膜孔は複数のヌクレオポリンタンパクからなる巨大な複合体である.核膜孔は物質の輸送制御だけでなく核内因子と相互作用することで機能発現することが明らかにされつつある.本研究では高等植物の核膜および核膜孔による生理機能および遺伝子制御機構の解明に焦点を絞った.
高等植物の核膜ラミナ様構造はKAKU4とCRWNによって担われている.両タンパク質を欠く変異体では細胞核の形状が異常になる.我々はKAKU4が花粉粒の栄養核膜に高蓄積していることを見いだした (Goto et al. 2020).花粉粒の栄養核の核膜は不定形をしているがその生理学的意義は不明だった.細胞生物学的解析により,KAKU4-CRWNタンパク質複合体が栄養核の核膜形態を維持し,花粉管伸長時の栄養核のポジショニングに関与することで,効率的な受精を担っていることを見いだした (Goto et al. 2020).一方,栄養器官においてCRWNは特定の遺伝子群と相互作用することで発現制御を行っていることを見いだした (Sakamoto et al. 2020). CRWNsは銅関連遺伝子群に相互作用することで環境からの銅への耐性に寄与していることがわかった.以上より,植物の核膜がもつ新しい生理機能と遺伝子発現制御機構を明らかにすることができた.これらの研究成果の一部を植物における核膜孔の遺伝子初制御に関する総説論文としてまとめた(Tamura 2020).

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

植物の重要な核膜構成成分であるKAKU4-CRWN複合体の新しい生理機能を明らかにすることにできた.

Strategy for Future Research Activity

核膜孔複合体の構成要素であるNup136と相互作用する遺伝子群の解析に焦点を絞り研究を進める.nup136変異体と野生型の比較トランスクリプトームのデータを参考にして,候補遺伝子群とNup136との相互作用を確認する.これと平行して,試験管内における核膜の試験管内再構成系の確立を行う.核膜および核膜孔の形成や核内因子(特異的な遺伝子領域)との相互作用を明らかにするうえで必要な実験系と考えている.

Causes of Carryover

(理由) 当該研究を進めるために立ち上げた試験管内による植物の核膜再構成系の確立に当初の予定より時間がかかったため.
(使用計画)引き続き,高等植物の核膜孔複合体による新しい遺伝子発現調節機構の解析の推進のために使用する.

  • Research Products

    (14 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 2 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] INRA/IJPB(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      INRA/IJPB
  • [Journal Article] Fluorescent protein-based imaging and tissue-specific RNA-seq analysis of Arabidopsis hydathodes2021

    • Author(s)
      Yagi Hiroki、Nagano Atsushi J、Kim Jaewook、Tamura Kentaro、Mochizuki Nobuyoshi、Nagatani Akira、Matsushita Tomonao、Shimada Tomoo
    • Journal Title

      Journal of Experimental Botany

      Volume: 72 Pages: 1260~1270

    • DOI

      10.1093/jxb/eraa519

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural and functional relationships between plasmodesmata and plant endoplasmic reticulum?plasma membrane contact sites consisting of three synaptotagmins2020

    • Author(s)
      Ishikawa Kazuya、Tamura Kentaro、Fukao Yoichiro、Shimada Tomoo
    • Journal Title

      New Phytologist

      Volume: 226 Pages: 798~808

    • DOI

      10.1111/nph.16391

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Nuclear pore complex-mediated gene expression in Arabidopsis thaliana2020

    • Author(s)
      Tamura Kentaro
    • Journal Title

      Journal of Plant Research

      Volume: 133 Pages: 449~455

    • DOI

      10.1007/s10265-020-01177-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The nuclear envelope protein KAKU4 determines the migration order of the vegetative nucleus and sperm cells in pollen tubes2020

    • Author(s)
      Goto Chieko、Tamura Kentaro、Nishimaki Satsuki、Maruyama Daisuke、Hara-Nishimura Ikuko
    • Journal Title

      Journal of Experimental Botany

      Volume: 71 Pages: 6273~6281

    • DOI

      10.1093/jxb/eraa367

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Subnuclear gene positioning through lamina association affects copper tolerance2020

    • Author(s)
      Sakamoto Yuki、Sato Mayuko、Sato Yoshikatsu、Harada Akihito、Suzuki Takamasa、Goto Chieko、Tamura Kentaro、Toyooka Kiminori、Kimura Hiroshi、Ohkawa Yasuyuki、Hara-Nishimura Ikuko、Takagi Shingo、Matsunaga Sachihiro
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Pages: 5914

    • DOI

      10.1038/s41467-020-19621-z

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] GFP蛍光を指標に単離したシロイヌナズナ排水組織マイクロサンプルのRNA-seq解析2021

    • Author(s)
      八木宏樹,永野惇,キム・ジュウ,田村謙太郎,望月伸悦,長谷あきら,松下智直,嶋田知生
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] MpBHLH35はゼニゴケ胞子体の蒴柄形成を制御する2021

    • Author(s)
      守屋健太,白川一,松田頼子,田村謙太郎,西浜竜一,岡義人,松下智直,西村いくこ,河内孝之,嶋田知生
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] 液胞輸送変異体kam2における発芽後の成長阻害の解析2021

    • Author(s)
      細川智佳,田村謙太郎,岡義人,松下智直,嶋田知生
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] unctional analysis of putative peptide-coding genes in Marchantia polymorpha2021

    • Author(s)
      Haruaki Kobayashi, Shigeo S. Sugano, Kentaro Tamura, Yoshito Oka, Tomonao Matsushita, Tomoo Shimada
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] 小胞体の構造と機能に関するSUNドメインタンパク質2020

    • Author(s)
      田村 謙太郎
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Emerging roles for nuclear membrane in signalling pathway in higher plants2020

    • Author(s)
      Kentaro Tamura
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会ワークショップ
    • Invited
  • [Presentation] The nuclear envelope protein KAKU4 affects the migration order of the vegetative nucleus and sperm cells in pollen tubes2020

    • Author(s)
      Chieko Goto, Kentaro Tamura, Hara-Nishimura
    • Organizer
      Plant Biology 2020 Worldwide Summit
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] シロイヌナズナのカハールボディの機能解析2020

    • Author(s)
      太田 翔平, 櫻井 貴之,深尾 陽一朗,嶋田 知生,田村 謙太郎
    • Organizer
      日本植物学会第84回大会

URL: 

Published: 2021-12-27  

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