• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2021 Fiscal Year Annual Research Report

Interaction between nuclear pore complex and chromatin in plants

Research Project

Project/Area Number 18K06283
Research InstitutionUniversity of Shizuoka

Principal Investigator

田村 謙太郎  静岡県立大学, 食品栄養科学部, 准教授 (40378609)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Keywordsシロイヌナズナ / 核膜 / 核膜孔 / ヌクレオポリン / クロマチン / 遺伝子発現制御
Outline of Annual Research Achievements

高等植物は独自の核膜構造と機能を獲得してきたことが知られている.核膜は遺伝情報の格納のためのバリアーとしてだけでなく,様々な細胞内イベントを支配する分子反応の場としても機能する.核膜孔複合体は進化的に保存されたチャネルで,核と細胞質間の輸送をコントロールしている.核膜孔複合体は約30種類のヌクレオポリンとよばれるタンパク質群によって形成されている.これらヌクレオポリンの一部は共通構造があるものの,多くは多様な独自の構造を持つタンパク質である.最近になって,個々のヌクレオポリンが特異的機能を持つことが明らかになってきた.本研究では,申請者は核膜孔複合体の新しい機能として,核内クロマチンとの相互作用および,生体防御に関与する遺伝子発現との関連についての解析を行った.今年度は,核膜孔複合体による遺伝子発現制御系のより詳細な機能を知るためのツールとして,試験管内における植物細胞核膜の再構成系を確立することとした.最初に密度勾配遠心法を用いてタバコ培養細胞から細胞核を精製する方法を確立した.単離核を界面活性剤を用いて脱膜することで,クロマチン画分を調整した.このクロマチンとGFP標識したマイクロソーム画分を一定条件間でインキュベートすることにより,核膜の再構成がおきることを確認した(Tamura et a., 2021).共焦点レーザー顕微鏡で3Dタイムラプス撮影することで,核膜の形成過程の立体形状を明らかにすることができた.再構成された核膜には核膜孔が形成されていることから,今後,一核レベルでの核膜孔―クロマチン相互作用解析に使えることが期待される.

  • Research Products

    (18 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 2 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 3 results)

  • [Int'l Joint Research] INRA/IBMP(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      INRA/IBMP
  • [Journal Article] Validation of nuclear pore complex protein-protein interactions by transient expression in plants2022

    • Author(s)
      Fumika Ikeda、Kentaro Tamura
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 2502 Pages: 235~243

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2337-4_15

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spatiotemporal relationship between auxin dynamics and hydathode development in Arabidopsis leaf teeth2021

    • Author(s)
      Yagi Hiroki、Tamura Kentaro、Matsushita Tomonao、Shimada Tomoo
    • Journal Title

      Plant Signaling & Behavior

      Volume: 16 Pages: 1989216

    • DOI

      10.1080/15592324.2021.1989216

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation and Physiological Significance of the Nuclear Shape in Plants2021

    • Author(s)
      Goto Chieko、Hara-Nishimura Ikuko、Tamura Kentaro
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 12 Pages: 67390

    • DOI

      10.3389/fpls.2021.673905

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] In vitro assembly of nuclear envelope in tobacco cultured cells2021

    • Author(s)
      Tamura Kentaro、Ueda Haruko、Hara-Nishimura Ikuko
    • Journal Title

      Nucleus

      Volume: 12 Pages: 82~89

    • DOI

      10.1080/19491034.2021.1930681

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Fluorescent protein-based imaging and tissue-specific RNA-seq analysis of Arabidopsis hydathodes2021

    • Author(s)
      Yagi Hiroki、Nagano Atsushi J、Kim Jaewook、Tamura Kentaro、Mochizuki Nobuyoshi、Nagatani Akira、Matsushita Tomonao、Shimada Tomoo
    • Journal Title

      Journal of Experimental Botany

      Volume: 72 Pages: 1260~1270

    • DOI

      10.1093/jxb/eraa519

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 膜を有さない核内構造体カハールボディはシロイヌナズナの高温への応答に関与している2022

    • Author(s)
      太田翔平,櫻井貴之,嶋田知生,田村謙太郎
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会
  • [Presentation] インポーチンα(IMPA)は植物の免疫応答を抑制する2022

    • Author(s)
      森愛理,Valerie Gaudin,田村謙太郎
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会
  • [Presentation] 気孔形成をかく乱する小分子化合物 Bubblin の標的因子の解析2022

    • Author(s)
      村上知暉,安西慎太郎,阪井裕美子,田村謙太郎,松田佳祐,今井敏郎,大越研人,佐藤安弘, 永野惇,岡義人,松下智直,嶋田知生
    • Organizer
      第63回日本植物生理学会
  • [Presentation] The physiological roles of nuclear envelope proteins in plant reproductive organs2021

    • Author(s)
      Kentaro Tamura
    • Organizer
      Society for Experimental Biology Annual Main Meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Functional and spatial coordination between cell and nuclear shape in plants2021

    • Author(s)
      Kentaro Tamura
    • Organizer
      Society for Experimental Biology Annual Main Meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 核膜孔が制御する植物の環境応答2021

    • Author(s)
      田村謙太郎
    • Organizer
      第73回日本細胞生物学会大会
    • Invited
  • [Presentation] Real time nucleus dynamics in the Arabidopsis single root hair2021

    • Author(s)
      Gaurav Singh, David Pereira, Tamsin A. Spelman, Stephanie Baudrey, Kentaro Tamura, Michael Ryckelynck, Henrik Jonsson, Atef Asnacios and Marie-Edith Chaboute
    • Organizer
      20th HFSP Awardees Meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Characterization of a Cajal body deficient mutant in Arabidopsis thaliana2021

    • Author(s)
      Shohei Ohta, Takayuki Sakurai, Tomoo Shimada, and Kentaro Tamura
    • Organizer
      Society for Experimental Biology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Interaction of the nuclear pore complex and the nucleoskeleton at the plant nuclear periphery2021

    • Author(s)
      Sarah Mermet, Tristan Dubos, Sylvie Tutois, Kentaro Tamura, Christophe Tatout, Emmanuel Vanrobays
    • Organizer
      Society for Experimental Biology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] シロイヌナズナにおける核輸送因子インポーチンαファミリーの解析2021

    • Author(s)
      森 愛理,Valerie Gaudin, 田村 謙太郎
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
  • [Presentation] 温度ストレス応答における核内小器官カハールボディの役割2021

    • Author(s)
      太田 翔平, 櫻井 貴之,嶋田 知生,田村 謙太郎
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
  • [Presentation] 出芽酵母のエネルギー代謝の改善2021

    • Author(s)
      大長 薫,弘埜 陽子,菊川 寛史,田村 謙太郎,原 清敬
    • Organizer
      第73回日本生物工学大会

URL: 

Published: 2022-12-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi