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2009 Fiscal Year Self-evaluation Report

Genome analyses of nucleus and mitochondria in the dinoflagellate Noctiluca scintillans

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 19580203
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field General fisheries
Research InstitutionKanazawa University

Principal Investigator

ENDOH Hiroshi  Kanazawa University, 自然システム学系, 准教授 (20272932)

Project Period (FY) 2007 – 2010
Keywords進化 / 原生生物 / 繊毛虫 / 渦鞭毛虫 / アルベオラータ / 核分化 / ミトコンドリア
Research Abstract

繊毛虫テトラヒメナとヒメゾウリムシのゲノムプロジェクトが終了した。それらの解析によれば、これまで同定された28,000遺伝子のうち他の生物の遺伝子との相同性が確認されたのはおよそ12,000遺伝子だけで、残りの16,000遺伝子はテトラヒメナだけが持つ特異的な遺伝子であることが判明した。これらのことはきわめて示唆的である。
ヤコウチュウは、渦鞭毛虫類の中でもっとも祖先的な系統的位置を占める古い系統のひとつである(Fukuda & Endoh, Eur.J.Protistology 44 : 27-33, 2008)。ヤコウチュウも繊毛虫類と同様に、赤潮生物を多く含む渦鞭毛虫類に特異的な遺伝子を多数持つことが予想される。アルベオラータに属す他の生物(いくつかの渦鞭毛藻類、マラリア原虫などのアピコンプレクサ類、テトラヒメナやゾウリムシなどの繊毛虫類)のゲノム解析との比較により、渦鞭毛虫類にのみ存在する遺伝子の同定を行う。このような遺伝子の存在は、他の生物に影響を及ぼすことなく、ヤコウチュウをふくめた渦鞭毛虫類の増殖を制御するための新たな方法の開発の可能性を追求するものである。
ヤコウチュウの先行的ゲノム研究の第一段階として、配偶子細胞をもとに核およびミトコンドリアゲノムの小規模ESTプロジェクトの遂行を目指す。

  • Research Products

    (5 results)

All 2010 2009 2008

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Role of apoptosis-inducing factor (AIF) in programmed nuclear death during conjug ation in Tetrahymena thermophila2010

    • Author(s)
      Akematsu T, Endoh H
    • Journal Title

      BMC Cell Biol. 11

      Pages: 13-27

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phylogenetic analyses of the dinoflagellate Noctiluca scintillans (based on beta-tubulin and Hsp90 genes)2008

    • Author(s)
      Fukuda Y, Endoh H
    • Journal Title

      Eur.J.Protistol. 42

      Pages: 209-219

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Differentially expressed genes during fruiting body development in the aggregative ciliate Sorogena stoianovitc hae (Ciliophora : Colpodea)2008

    • Author(s)
      Sugimoto H, Endoh H
    • Journal Title

      Eur.J.Protistol. 42

      Pages: 209-219

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 祖先的渦鞭毛虫 Oxyrrhis marina のミトコンドリアゲノム解析2009

    • Author(s)
      北田菜穂美, 遠藤浩
    • Organizer
      第42回日本原生動物学会
    • Place of Presentation
      石巻専修大学 (宮城県)
    • Year and Date
      2009-10-31
  • [Presentation] Theoretical consideration of early history of dinoflagellates : Haploid coredinoflagellates might have evolved from a zoospore of ancestral diploid dinoflagellates via neoteny2008

    • Author(s)
      Fukuda Y, Suzaki T, Endoh H.
    • Organizer
      Protist2008 (ISOP 59^<th> and ISEP17^<th> joint conference)
    • Place of Presentation
      Dalhousie University, Halifax (Canada)
    • Year and Date
      2008-07-23

URL: 

Published: 2011-06-18   Modified: 2016-04-21  

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