2008 Fiscal Year Annual Research Report
アレイCGHとトランスクリプトームによる腎癌の網羅的遺伝子解析
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19590355
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| Research Institution | Oita University |
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Principal Investigator |
松浦 恵子 Oita University, 医学部, 准教授 (00291542)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
守山 正胤 大分大学, 医学部, 教授 (90239707)
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| Keywords | アレイCGH / 腎癌 / トランスクリプトーム / 遺伝子解析 / 病型分類 |
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| Research Abstract |
本研究では、アレイCGHを用いて腎細胞癌(CCC)の発症にかかわる遺伝子異常を同定し、さらに病気の進行(悪性化)の過程で付加される遺伝子異常を同定することを目標としている。平成19年度までに、アレイCGH解析によって、14qのlossはhigh-grade CCCで付加されたゲノム異常であることがわかった。また、high-grade CCCでの14qでのコピー数低下は、この領域での遺伝子発現低下に関わっていることが示唆された。そこで、平成20年度では、
(1)平成19年度に絞り込んだ増幅領域と欠失領域データベースにより異常の見いだされた部分の遺伝子を検索し、候補遺伝子の絞り込みを試みた。候補遺伝子それぞれについて、症例毎の遺伝子発現の状態をReal-time PCRにより、実際に腎癌で遺伝子の発現が増強あるいは減弱、消失しているかどうかをReal-time PCR kitを用いて調べた。
(2)癌抑制遺伝子候補に関しては、腎癌細胞株のなかで候補遺伝子が存在するゲノム領域の欠失している細胞を用いて、それに候補遺伝子を強制発現させ、変化する表現形質(増殖抑制能、アポトーシス誘導能など)を解析した。
(3)発現亢進している遺伝子に関しては、候補遺伝子のSiRNAを発現亢進している腎癌細胞株に遺伝子導入し、変化する表現形質(増殖抑制能、アポトーシス誘導能など)を解析した。
以上の実験から、いくつかの候補遺伝子が、CCCの悪性化に関わる腫瘍関連遺伝子として示唆された。
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[Journal Article] Genome-wide microRNA expression profiling in renal cell carcinoma : significant downregulation of miR-141 and miR-200c.2008
Author(s)
Nakada C, Matsuura K., Tsukamoto Y., Tanigawa M., Yoshimoto T., Narimatsu T., Nguyen LT., Hijiya N., Uchida T., Sato F., Mimata H., Seto M., Morivama M.
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Journal Title
The Journal of Pathology 216
Pages: 418-427
Peer Reviewed
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[Journal Article] Genome-wide analysis of DNA copy number alterations and gene expression ingastric cancer.2008
Author(s)
Tsukamoto Y., Uchida T., Karnan s., Noguchi T., Nguyen LT., Tanigawa M., Takeuchi I., Matsuura K., Hijiya N., Nakada C., Kishlda T., Kawahara K., Ito H., Murakami K., Fujioka T., Seto M., Moriyama M.
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Journal Title
The Journal of Pathology 216
Pages: 471-482
Peer Reviewed
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[Journal Article] Phosphorylation status of epidermal growth factor receptor is closely associatedwith responsiveness to gefitinib in pulmonary adenocarcinoma.2008
Author(s)
Hijiya N., Miyawaki M., Kawahara K., Akamine S., Tsuji K., Kadota J., Akizuki S., Uchida T., Matsuura K., Tsukamoto Y., Moriyama M
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Journal Title
Human Pathology 39
Pages: 316-323
Peer Reviewed
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[Journal Article] Genotyping of the cagA gene of Helicobacter pylori on immunohistochemistry with East Asian CagA-specific antibody.2008
Author(s)
Kanada R., Uchida T., Tsukamoto Y., Nguyen LT., Hijiya N., Matsuura K., Kodama M., Okimoto T., Murakami K., Fujioka T., Yanagisawa S., Morivama M.
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Journal Title
Pathology International 58
Pages: 218-225
Peer Reviewed
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