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2009 Fiscal Year Annual Research Report

CLIP-RNAi法の開発と応用

Research Project

Project/Area Number 21686078
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

大槻 高史  Okayama University, 大学院・自然科学研究科, 准教授 (80321735)

KeywordsRNAi / shRNA / siRNA / CLIP-RNAi / 光誘導 / 遺伝子発現抑制 / RNA結合蛋白質 / 細胞膜透過性ペプチド
Research Abstract

近年,siRNAやshRNAにより配列依存に遺伝子発現抑制が起こる現象(RNAi)が注目され,遺伝子機能研究や創薬研究に幅広く利用されている.研究代表者らは最近,培養プレート上の動物細胞に対して光照射領域特異的にRNAiを誘導する技術を開発した.光で切り取る(=clip)ように遺伝子発現を抑える方法なので,この方法をCLIP-RNAi法と呼ぶことにした.本課題では,CLIP-RNAi法を最適化すると共に応用展開することを目的として、以下に取り組んだ.
1) CLIP-RNAi法で用いるRNAキャリアの最適化を目指し,本研究では元となるキャリア蛋白質(TatU1A)の改良を行った。キャリア蛋白質のN末やC末のアミノ酸配列を工夫した結果、C末に分解タグを融合させたときなどに、RNAi効果が高まることが分かってきた.
2) 本方法の汎用性を高めるため,様々な波長の光照射でRNAiを可能にする必要がある.そこで,Photosensitizer (PS)としてAlexa-Fluor 546以外にも,Alexa-FluorシリーズおよびCy-dyeシリーズで標識したTatU1Aを用い,350-680nm付近の光照射を行うことでRNAiの誘導が可能であるかを調べた.結果として、Alexa-Fluor 633やCy3などの蛍光色素をPSとしてCLIP-RNAi法に使えることがわかった.
3) CLIP-RNAi実験について,レーザー光を使うと,さらに精密に照射位置を限定できるはずである.共焦点レーザー顕微鏡のレーザー光を用いて,5x5~200x200μm程度の領域におけるCLIP-RNAiや,単一細胞(10~20μm)を狙ったCLIP-RNAiを試し、実際にこれらの微細領域におけるRNAiを引き起こせることを確認した.

  • Research Products

    (17 results)

All 2010 2009

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (7 results) Book (3 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Lactobacillus-mediated RNA interference in nematode.2010

    • Author(s)
      Kuwahara, A.
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering 109

      Pages: 189 192

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cellular siRNA delivery using cell-penetrating peptides modified for endosomal escape.2010

    • Author(s)
      Endoh, T.
    • Journal Title

      Advanced Drug Delivery Reviews 61

      Pages: 704 709

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spatial regulation of specific gene expression through photoactivation of RNAi2009

    • Author(s)
      Endoh, T.
    • Journal Title

      Journal of Controlled Release 137

      Pages: 241 245

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Carrier PNA for shRNA delivery into cells.2009

    • Author(s)
      Kitamatsu, M.
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 19

      Pages: 3410 3413

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A protease inhibitor discovery method using fluorescence correlation spectroscopy with position-specific labeled protein substrates.2009

    • Author(s)
      Nakata, H.
    • Journal Title

      Anal.Biochem. 390

      Pages: 121 125

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection of Bioactive Small Molecules by Fluorescent Resonance Energy Transfer in RNA-Protein Conjugate.2009

    • Author(s)
      Endoh, T.
    • Journal Title

      Bioconjugate Chemistry 20

      Pages: 2242 2246

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Development of nucleic acid delivery system for intestinal therapy using lactic acid bacteria2010

    • Author(s)
      Ryo Shintani
    • Organizer
      第3回高度医療都市を創出する未来技術国際シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2010-02-03
  • [Presentation] Photoinduced amber suppressor tRNA delivery into cytosol and amber suppression in mammalian cells2010

    • Author(s)
      Yoshio Doi
    • Organizer
      23rd tRNA workshop
    • Place of Presentation
      Aveiro, Portugal
    • Year and Date
      2010-02-01
  • [Presentation] siRNAデリバリーのためのCPP-RBP型RNAキャリアの開発2009

    • Author(s)
      桑原里奈, 遠藤玉樹, 宍戸昌彦, 大槻高史
    • Organizer
      第32回分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2009-12-12
  • [Presentation] 乳酸菌をキャリアとする核酸デリバリーシステムの開発2009

    • Author(s)
      新谷諒, 宍戸昌彦, 大槻高史
    • Organizer
      第32回分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2009-12-12
  • [Presentation] CLIP-RNAi法による光照射領城特異的な遺伝子発現抑制2009

    • Author(s)
      大槻高史
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2009-10-23
  • [Presentation] Applications of peptide nucleic acids for RNA purification, RNA detection, and intracellular RNA delivery2009

    • Author(s)
      Takashi Ohtsuki
    • Organizer
      The 6'th International Forum On Post-Genome Technologies
    • Place of Presentation
      北京
    • Year and Date
      2009-09-17
  • [Presentation] CLIP-RNAi法による1細胞RNAiの経時的観察2009

    • Author(s)
      大槻高史, 遠藤玉樹, 宍戸昌彦
    • Organizer
      第18回日本バイオイメージング学会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      2009-09-04
  • [Book] Cellular siRNA delivery using TatU1A and photo-induced RNA interference. In "Methods Mol.Biol.vol.623, RNA Interference : From Biology to Clinical ADDlications"2010

    • Author(s)
      Endoh, T.
    • Total Pages
      271-281
    • Publisher
      Springer
  • [Book] 人工核酸によるRNAの検出と精製。In「シングルセル解析の最前線」2010

    • Author(s)
      大槻高史
    • Total Pages
      258-264
    • Publisher
      シーエムシー出版
  • [Book] The central dogma : from DNA to RNA, and to protein. In "Automation in Proteomics and Genomics"2009

    • Author(s)
      Ohtsuki, T.
    • Total Pages
      3-20
    • Publisher
      Wiley
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 乳酸菌により二本鎖RNAを生成するキット及びその利用2009

    • Inventor(s)
      大槻高史、宍戸昌彦、公文裕巳、柏倉祐司、落合和彦
    • Industrial Property Rights Holder
      岡山大学
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2009/004465
    • Filing Date
      2009-09-09
    • Overseas

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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