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2009 Fiscal Year Annual Research Report

アンチセンスRNA発現系を用いた微生物代謝改変技術の最適化

Research Project

Project/Area Number 21780071
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

平沢 敬  Osaka University, 大学院・情報科学研究科, 助教 (20407125)

Keywordsコリネ型細菌 / グルタミン酸 / アンチセンスRNA / 2-オキソグルタル酸デヒドロゲナーゼ複合体 / OdhA
Research Abstract

微生物を用いた物質生産を行う際、目的とする物質の生産へと代謝の流れを向かわせるために、さまざまな代謝経路を遮断することが要求される。通常、代謝経路の遮断には、その反応を触媒する酵素をコードする遺伝子を破壊するという手法がとられる。しかしながら、代謝経路の遮断が、増殖や糖消費の低下などの悪影響をもたらす場合もある。そのため、当該代謝経路を完全には遮断せずに、流量を小さくするための遺伝子操作技術が必要となる。本研究では、グルタミン酸を著量生産することが知られているコリネ型細菌であるCorynebacterium glutamicumを材料に、C.glutamicumのTCAサイクルの酵素の1つである2-オキソグルタル酸デヒドロゲナーゼ複合体について、触媒サブユニットE1oをコードするodhA遺伝子に対するアンチセンスRNA(以降asRNAと記述する)を細胞内に発現させる系を例に、odhA asRNAの発現と代謝の変化特にグルタミン酸生産の変化について解析した。本年度は、odhA mRNAの2次構造を考慮したasRNAの設計と評価、OdhAタンパク質の精製およびそれを用いて作成した抗OdhA抗体によるウェスタンブロット解析系の構築を行った。
odhA mRNAの2次構造を、2次構造予測プログラムを用いて予測し、1本鎖として露出する領域をターゲット領域として決定して、asRNA発現系を構築した。その結果、asRNAの発現だけではグルタミン酸生産を誘導させることはできなかった。しかしながら、ペニシリンや界面活性剤を添加してグルタミン酸生産を誘発させた条件下でasRNAを発現させると、グルタミン酸生産量を増大させる効果があることを見いだした。また、大腸菌で生産させ精製したC.glutamicumのOdhAとHis_6タグの融合タンパク質を用いて抗OdhA抗体を作成し、抗OdhA抗体を用いたウェスタンブロットによるC.glutamicum細胞内のOdhAタンパク質量をモニターする系を構築した。

  • Research Products

    (11 results)

All 2010 2009

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Differential importance of trehalose accumulation in Saccharomyces cerevisiae in response to various environmental stresses2010

    • Author(s)
      Siraje Arif Mahmud
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering 109

      Pages: 262-266

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Requirement of de novo synthesis of the OdhI protein in penicillin-induced glutamate production by Corynebacterium glutamicum2010

    • Author(s)
      Jongpill Kim
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology (未定)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development and experimental verification of a genome-scale metabolic model for Corynebacterium glutamicum2009

    • Author(s)
      Yohei Shinfuku
    • Journal Title

      Microbial Cell Factories 8

      Pages: 43

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Analysis of adaptation to high ethanol concentration in Saccharomyces cerevisiae using DNA microarray2009

    • Author(s)
      Thai Nho Dinh
    • Journal Title

      Bioprocess and Biosystems Engineering 32

      Pages: 681-688

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Investigating the effectiveness of DNA microarray analysis for identifying the genes involved in L-lactate production by Saccharomyces cerevisiae2009

    • Author(s)
      Takashi Hirasawa
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology 84

      Pages: 1149-1159

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 大腸菌の中央代謝系酵素遺伝子発現調節株の構築-遺伝子摂動が代謝におよぼす影響の解析に向けて2010

    • Author(s)
      平沢敬
    • Organizer
      第4回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      九州大学
    • Year and Date
      2010-03-08
  • [Presentation] 酵母を用いたL-乳酸生産に関連する遺伝子のゲノムワイドな同定2009

    • Author(s)
      平沢敬
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] Flux balance analysis of Corynebacterium glutamicum using a genome-scale metabolic model2009

    • Author(s)
      Chikara Furusawa
    • Organizer
      Asia Pacific Biochemical Engineering Conference (APBioChEC' 09)
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場
    • Year and Date
      2009-11-26
  • [Presentation] ゲノムスケール代謝モデルを用いたCorynebacterium glutamicumの代謝解析とその実験的検証2009

    • Author(s)
      古澤力
    • Organizer
      第61回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2009-09-24
  • [Presentation] 異種タンパク質を分泌生産するコリネ型細菌の代謝解析2009

    • Author(s)
      馬越元基
    • Organizer
      第61回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2009-09-24
  • [Presentation] ゲノム情報を基盤とする代謝予測システムの開発と実験検証2009

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      化学工学会第41回秋季大会
    • Place of Presentation
      広島大学
    • Year and Date
      2009-09-16

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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