2013 Fiscal Year Annual Research Report
エイズパンデミック発生の謎をコンゴ盆地最奥部への探訪で解き明かす研究
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22256001
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| Section | 海外学術 |
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| Research Institution | Tokyo Medical and Dental University |
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Principal Investigator |
井戸 栄治 東京医科歯科大学, 医歯(薬)学総合研究科, 特任教授 (70183176)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
生田 和良 大阪大学, 微生物病研究所, 教授 (60127181)
中村 昇太 大阪大学, 微生物病研究所, 助教 (90432434)
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| Project Period (FY) |
2010-04-01 – 2014-03-31
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| Keywords | HIV / エイズ / 感染症 / 分子進化 / アフリカ / コンゴ盆地 / コンゴ民主 / コンゴ |
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| Research Abstract |
エイズウイルスが最初に人間社会に出現したのは、これまでの様々な研究から中央部アフリカ地域内の何処かであろうという説に研究者らの間で異論はない。しかし、具体的に何時、何処でなのかとなると、まだ明快な答えが出ている訳ではない。本研究では、この疑問に答えるべく、コンゴ盆地内に焦点を絞り、可能な限り多くの地域から集めた検体を分子疫学的に解析することにより、エイズパンデミックの謎を解き明かすことを目的としている。
今年度は、先ずコンゴ民主東方の北キヴ州から収集した50検体についてpol領域の一部をPCRし、得られた塩基配列から分子系統解析を行った。その結果、大半の約7割近くがサブタイプD(B)で、他にA、D、C、Gなどがわずかに見られる程度であった。これまでのコンゴ民主におけるサブタイプ分布状況は非常に多様性に富むことが特徴で、このように偏った分布を示したのは初めてである。サブタイプDと同Bは、元来非常に近隣であるため、これがDであるのか、あるいはBであるのか、これだけでは判定し難い。また今年度は新たに赤道州北辺の中央アフリカ共和国に近いGemenaという町周辺の調査を行った。コンゴ盆地の中央部は、これまでの調査によって最もHIVの遺伝的多様性が高いことが知られており、その北側か、あるいは南側か、今後の焦点を絞るために設定した調査地点である。まだ解析が完全には完了していないが、ここでも多様なサブタイプが得られており、エイズウイルスが出現した場所という意味では、このコンゴ盆地内であることはほぼ確実であろうと思われた。多様な型のHIVが同じ地域に流行していると、同一患者に異なった株が同時に感染する、いわゆる重感染という現象が起こることがある。本研究では、次世代型DNAシーケンサーが、そうした重感染の検体を迅速かつ定量的に解析する際に極めて効力を発揮することも明らかにした。
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| Current Status of Research Progress |
Reason
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
25年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(8 results)
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[Journal Article] Establishment of in-house quantitative real-time PCR assay for HIV-1 viral load measurement: application to evaluate efficacy of ART in Ghanaian patients in an urban setting.2014
Author(s)
Barnor JS, Yamamoto N, Brandufl JAM, Ampofo W, Bonney K, Bonney E, Odoom JK, Aidoo S, Alale M, Ntim NA, Amoah YO, Ofori SB, Ndzinu J, Addo NA, Nyarko A, Ido E, Ishikawa K, Yamaoka S.
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Journal Title
J AIDS Clin Res
Volume: 5
Pages: in press.
Peer Reviewed
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[Journal Article] Variables influencing anti-human immunodeficiency virus type 1 neutralizing human monoclonal antibody (NhMAb) production among infected Thais.2013
Author(s)
Akapirat S, Avihingsanon A, Ananworanich J, Schuetz A, Ramasoota P, Luplertlop N, Ono K, Ikuta K, Utachee P, Kameoka M, Leaungwutiwong, P.
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Journal Title
Southeast Asian J Trop Med Health
Volume: 44
Pages: 825-841
Peer Reviewed
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[Presentation] Molecular epidemiology of HIV in the Congo basin (Democratic Republic of Congo) analyzed by high-throughput DNA sequencing.2013
Author(s)
Ido E, Karhemere S, Nakamura S, Nakaya T, Barnor J, Brandful J, William Ampofo W, Ishmael Aziati I, Agbosu E, Ebengho M, Bakuba K, Ikuta K, Yamaoka S, Muyembe JJ.
Organizer
6ème Congres International de Pathogogie Infectieuse et Parasitaire (CIPIP)
Place of Presentation
Ｋｉｎｓｈａｓａ， DR Congo
Year and Date
20130613-20130615
Invited
