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2010 Fiscal Year Annual Research Report

消化器癌の網羅的DNAメチル化解析による癌症例層別化

Research Project

Project/Area Number 22390255
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

金田 篤志  東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任准教授 (10313024)

Keywords癌 / エピゲノム / エピジェネティクス / マイクロアレイ / 次世代シーケンサー / 情報工学
Research Abstract

DNAメチル化は最も重要なエピジェネティック変化の一つであり、DNAメチル化異常を詳細にゲノム上にマッピングし癌のエピゲノム異常を解明し消化器癌症例を層別化することは、癌の複雑な遺伝子制御異常を明らかにするために必須である。先行している大腸癌では前年度までにエピジェノタイピングを終了し3つの異なるメチル化エピジェノタイプを報告したが(Yagi et al. Clin Cancer Res 2010)、今年度は前癌病変として大腸腺腫50例、大腸異常腺窩12例、大腸正常粘膜26例について樹立したマーカーのメチル化を質量分析機MassARRAYを用いて定量解析を終えた。今後症例を増やしメチル化蓄積と発癌機序の関係を明らかにする。肝癌について、オリゴをプローブに用いたゲノムタイリングアレイによる我々のMeDIP-chip技術を用いてDNAメチル化を詳細にマッピングした。
HBV(+)肝癌、HCV(+)肝癌にそれぞれ特異的なメチル化候補部位を抽出、肝癌症例65例についてMassARRAYによる定量的メチル化解析を行った。その結果HCV(+)肝癌特異的にメチル化される15遺伝子を同定し、またそれらの遺伝子のメチル化が良好な予後と相関することを報告した(Deng et al. Cancer Sci 2010)。胃癌のメチル化解析はInfiniumビーズアレイを用いて行っている。階層的クラスタリングを行うと胃癌にもメチル化の程度により複数のエピジェノタイプの存在が示唆されており、今後50-80例に増やして胃癌症例を層別化し、その原因にせまるため臨床因子との相関を解析していく。

  • Research Products

    (17 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (10 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Two groups of DNA methylation markers to classify colorectal cancer into three epigenotypes.2011

    • Author(s)
      Kaneda A, Yagi K
    • Journal Title

      Cancer Sci

      Volume: 102 Pages: 18-24

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] HCCとエピゲノム2011

    • Author(s)
      金田篤志
    • Journal Title

      肝胆膵

      Volume: 62(In press掲載確定)

  • [Journal Article] Identification of genes preferentially methylated in hepatitis C virus-related hepatocellular carcinoma.2010

    • Author(s)
      Deng YB, Kaneda A, et al.
    • Journal Title

      Cancer Sci

      Volume: 101 Pages: 1501-1510

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNAメチローム解析技術の発展と最新テクノロジー2010

    • Author(s)
      金田篤志
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 28 Pages: 1765-1773

  • [Journal Article] 癌診断とエピゲノム2010

    • Author(s)
      金田篤志
    • Journal Title

      医学のあゆみ

      Volume: 235 Pages: 1038-1044

  • [Presentation] The role of inflammatory genes in cellular senescence2010

    • Author(s)
      Katayama Y, Kaneda A, et al.
    • Organizer
      第33回分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-08
  • [Presentation] 癌遺伝子変異と相関するエピジェノタイプと、癌遺伝子変異による早期細胞老化における重要因子のゲノム探索2010

    • Author(s)
      金田篤志, ら
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大坂
    • Year and Date
      2010-09-24
  • [Presentation] ゲノムワイドなプロモーターメチル化解析による肝癌の分子生物学的層別化2010

    • Author(s)
      永江玄太、金田篤志, ら
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大坂
    • Year and Date
      2010-09-24
  • [Presentation] 口腔癌におけるエピゲノム解析2010

    • Author(s)
      葭葉清香、金田篤志, ら
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大坂
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] 甲状腺腫瘍におけるDNAメチル化のプロファイリングおよび遺伝子変化について2010

    • Author(s)
      菊池弥寿子、金田篤志, ら
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大坂
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] 肺小細胞癌株のヒストン修飾異常に関する検討2010

    • Author(s)
      佐藤輝幸、金田篤志, ら
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大坂
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] 定量的メチル化解析による大腸癌・腺腫のエピジェノタイピング2010

    • Author(s)
      八木浩一、金田篤志, ら
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大坂
    • Year and Date
      2010-09-22
  • [Presentation] EBV関連胃癌におけるDNAメチル化の網羅的解析2010

    • Author(s)
      松坂恵介、金田篤志, ら
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大坂
    • Year and Date
      2010-09-22
  • [Presentation] Three epigenotypes of colorectal cancer revealed by epigenotyping through quantitative DNA methylation analysis2010

    • Author(s)
      Kaneda A
    • Organizer
      The 3^<rd> World Cancer Congress 2010
    • Place of Presentation
      Singapore, Republic of Singapore
    • Year and Date
      2010-06-23
  • [Presentation] DNAメチル化情報を用いた大腸癌の3つのエピジェノタイプの同定2010

    • Author(s)
      八木浩一、金田篤志, ら
    • Organizer
      第4回日本エピジェネティクス研究会年会
    • Place of Presentation
      米子
    • Year and Date
      2010-05-29
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.genome.reast.u-tokyo.ac.jp/

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 特許2010

    • Inventor(s)
      金田篤志, ら
    • Industrial Property Rights Holder
      東京大学など
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2010/061164
    • Filing Date
      2010-06-30
    • Overseas

URL: 

Published: 2012-07-19  

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