2014 Fiscal Year Annual Research Report
スギ木部形成関連遺伝子データベースの構築に向けたＥＳＴ単離と網羅的発現解析
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24380098
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| Research Institution | Forestry and Forest Products Research Institute |
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Principal Investigator |
藤原 健 独立行政法人森林総合研究所, 木材特性研究領域, 室長 (00353839)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
渡辺 敦史 九州大学, 農学研究科(研究院), 准教授 (10360471)
能勢 美峰 独立行政法人森林総合研究所, 林木育種センター, 研究員 (20582753)
栗田 学 独立行政法人森林総合研究所, 林木育種センター, 室長 (40370829)
井城 泰一 独立行政法人森林総合研究所, 林木育種センター, 主任研究員 (40370845)
織部 雄一朗 独立行政法人森林総合研究所, 東北育種場, 課長 (40370853)
山下 香菜 独立行政法人森林総合研究所, 木材特性研究領域, 主任研究員 (60353900)
黒田 克史 独立行政法人森林総合研究所, 木材特性研究領域, 主任研究員 (90399379)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | スギ / EST / 材形成 / マイクロアレイ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
4クローンのスギ精英樹から1年を通してサンプリングを行い構築したcDNAライブラリーをリファレンス配列とした上で、新たに数個体からリシーケンスすることよって、大量のSNP情報を蓄積した。得られたSNP情報及びマイクロアレイ解析によって明らかとなった発現情報を基にマーカーを作成し、複数家系の連鎖地図の作成を行い、約60の形質データを用いてQTL解析を試みた。その結果、高密度な連鎖地図が作成でき、ほぼすべての形質のQTLを検出できた。
収集したEST情報に対して、モデル植物において木部形成に関与することが示唆されているMYBやNAC等転写因子との相同性検索を行った。その結果、二次壁の肥厚に関与するNST1,2と相同性の高い遺伝子（Cj_NST）や導管要素の形成に関与するVND6と相同性の高い遺伝子（Cj_VND）、また、PAL遺伝子の発現調節に関与している可能性が示唆されたPtMYB1と相同性の高い遺伝子（Cj_MYB1）等が同定された。また、各遺伝子の機能解析を行うため、スギのカルスを用いたターゲット遺伝子の発現誘導系の確立を試みた。エストラジオール依存型発現誘導プロモーターにGFP遺伝子を連結してスギのカルスに遺伝子導入を行い、遺伝子組み換えカルスを作出した。作出した組換えカルスをエストラジオール添加液体培地、寒天培地でインキュベートし、GFPの蛍光を顕微鏡下で観察することによって、発現誘導システムのスギでの利用可能性について検討を行った。その結果、液体培地、寒天培地ともにGFP遺伝子の発現がエストラジオールの添加によって誘導されることが明らかになり、本システムを活用してESTライブラリーから単離した転写因子の機能をスギのカルスを用いて解析することが可能であることが明らかとなった。
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| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Causes of Carryover |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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