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2014 Fiscal Year Annual Research Report

植物アルカロイド生合成系の分子進化の解明と代謝工学

Research Project

Project/Area Number 26221201
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

佐藤 文彦  京都大学, 生命科学研究科, 教授 (10127087)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 南 博道  石川県立大学, 公私立大学の部局等, 准教授 (90433200)
Project Period (FY) 2014-05-30 – 2018-03-31
Keywords植物アルカロイド生合成系 / 生合成系の分子進化 / 代謝工学と代謝再構築 / 有用二次代謝産物生産 / 生理機能評価
Outline of Annual Research Achievements

植物二次代謝産物のなかで最も多様な構造と強い生理活性を示すアルカロイド、特に、最も研究が進んでいるイソキノリンアルカロイド生合成系の分子進化の解明、代謝再構築による植物細胞・微生物発酵生産系の確立と、イソキノリンアルカロイドの線虫・動物培養細胞系を用いた生理機能評価を行い、以下の成果を得た。
1) ケシ科ハナビシソウゲノムの次世代シークエンサー解析によって得られた約0.47Gb(N50;約800 kB、既報のRNA配列の95%を含む)の配列情報を元に、生合成遺伝子クラスターの解析を行うとともに、イソキノリンアルカロイド生合成に関わるCYP80, CYP82, CYP719ファミリー遺伝子の特徴的増幅を明らかにした。さらに、ハナビシソウのmacarpine生合成に関与すると推定されるP450遺伝子を特定した。
2) ハナビシソウのイソキノリンアルカロイド生合成系において非MYC2型のbHLHが転写調節に関わっていることを明らかにするとともに、植物種間による制御の多様性を明らかにした。また、さらなる比較ゲノム解析の材料として、ウマノスズクサ等の培養細胞系を確立した。
3) 微生物異種発現系によるイソキノリンアルカロイド生合成系の再構成を行い、レチクリンからstylopine、テトラハイドロベルベリンからdihydrochelerythrine、レチクリンからテバインの生合成系の再構築に成功した。
4) イソキノリンアルカロイドの生理活性評価を行い、線虫とマウス3T3-L1細胞の脂質代謝における効果の違いを明らかにするとともに、その分子機能解析を行った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ハナビシソウの解読できたゲノム配列長は、予定よりも少ないが、既知のRNA配列情報の大部分(95%以上)が含まれていること、また、論文によっては、より小さいゲノムサイズ(0.5 Gb)が報告されているものもあり、遺伝子重複(倍数性)の影響が大きいと推定している。また、得られた配列情報解析により、生合成遺伝子が複数存在するscaffoldや、イソキノリンアルカロイド生合成に関与するP450がクラスタ-形成しているscaffoldが見つかるとともに、配列の解析から、macarpine生合成に関与すると考えられる新規なP450遺伝子が特定されるなど、分子進化の解明につながる知見が集積しつつある。
さらに、比較ゲノムを行うための分子ツールとしての転写因子に関して、ハナビシソウにおけるイソキノリンアルカロイド生合成系においても、オウレンのイソキノリンアルカロイド生合成系と同様に、非MYC2タイプのbHLHが生合成系を制御していることが明らかになる等、転写因子を起点とした遺伝子ネットワーク解析が着実に進捗している。
なお、確立した培養細胞系の生育が遅いが、現在、細胞株の選抜を進めるとともに、植物体の確保も行っており、遺伝子解析に大きな支障はでないと考えている。
一方、微生物系における生合成系の再構築、特に、モルフィン生合成系の再構築は、テバインの産生が可能になるなど、想定以上に進捗している。また、生理活性評価の結果、線虫とマウス3T3-L1細胞の特性の違いが明らかになる一方、複数の特徴的な作用を示す化合物が検出されてきており、今後の分子機構解明によって、新たな創薬シーズとなると期待され、ほぼ着実に研究は進捗していると判断している。

Strategy for Future Research Activity

1) ケシ科アルカロイド生合成系の分子基盤解明を目的に、前年度得られたハナビシソウゲノム配列情報をもとに、イソキノリンアルカロイド生合成遺伝子のゲノム構造と発現ネットワークの解析を行う。特に、二次代謝系の多様性創出を制御するP450遺伝子を中心に遺伝子クラスターの解析とその遺伝子機能の同定を継続する。また、前年度、ハナビシソウにおいて明らかになった非MYC2型のbHLH転写因子とともに、オウレンで同定されているWRKY転写因子を用いた転写調節ネットワーク解析、ならびに、転写因子の転写後調節について解析を進める。
2) 比較ゲノム解析による新奇なイソキノリンアルカロイド生合成系遺伝子の単離同定のために、ウマノスズクサのトランスクリプトーム/メタボローム解析を行うとともに、生合成系再構築を試みる。また、レチクリン経路とは異なるイソキノリンアルカロイド生合成系としてトコンのエメチン生合成系のトランスクリプトーム/メタボローム解析を行い、イソキノリンアルカロイド生合成系の多様性の分子基盤の解明と再構築を行う。
3) 微生物異種発現系を用いたアルカロイド生合成系の再構築を考えるうえで、発現したタンパク質の高次の構造(メタボロン)を考慮する必要がある。同一菌体内での発現と遺伝子を個別発現した菌体の共培養による生合成の比較、あるいは、メタボロンの直接解析等、アルカロイド生合成系の最適化、ならびに、多様な生合成への展開を検討する。テバイン生合成系に関しては、微生物におけるアルカロイド生産系のさらなる最適化を検討する。
4) 線虫とマウスにおけるイソキノリンアルカロイドの生理活性の違いを起点として、個々の化合物の生理活性発現機構について、さらに詳細に解析を試みる。

  • Research Products

    (19 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (13 results) (of which Invited: 5 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] CjbHLH1 homologs regulate sanguinarine biosynthesis in Eschscholzia californica cells2015

    • Author(s)
      Yamada, Y., Motomura, Y., Sato, F.
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol.

      Volume: 56 Pages: p1-12

    • DOI

      Doi. 10.1093/pcp/pcv027

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] (R,S)-Tetrahydropapaveroline production by stepwise fermentation using engineered Escherichia coli.2014

    • Author(s)
      Nakagawa A, Matsuzaki C, Matsumura E, Koyanagi T, Katayama T, Yamamoto K, Sato F, Kumagai H, Minami H.
    • Journal Title

      Sci Rep.

      Volume: 4:6695 Pages: 1-8

    • DOI

      doi: 10.1038/srep06695

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Knockdown of the NHR-8 Nuclear Receptor Enhanced Sensitivity to the Lipid-Reducing Activity of Alkaloids in Caenorhabditis elegans.2014

    • Author(s)
      Chow, Y.-L., Kawasaki, Y., Sato, F.
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      Volume: 78 Pages: 2008-2013

    • DOI

      DOI: 10.1080/09168451.2014.940278

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Asymmetric Synthesis of Tetrahydro- isoquinolines by Enzymatic Pictet-Spengler Reaction2014

    • Author(s)
      Nishihachijo, M., Hirai, Y., Kawano, S., Nishiyama, A., Minami, H., Katayama, T., Yasohara, Y., Sato, F., Kumagai, H.
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      Volume: 78 Pages: 701-707

    • DOI

      doi: 10.1080/09168451.2014.890039

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ドラフトゲノムデータを用いたハナビシソウアルカロイド生合成 P450 遺伝子の探索2015

    • Author(s)
      堀 健太郎、山田 泰之、佐藤 文彦
    • Organizer
      2015年度日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      岡山大学農学部(岡山)
    • Year and Date
      2015-03-28
  • [Presentation] ベルベリン生合成系の転写因子 CjWRKY1 の翻訳後制御機構の解析2015

    • Author(s)
      山田 泰之、佐藤 文彦
    • Organizer
      2015年度日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      岡山大学農学部(岡山)
    • Year and Date
      2015-03-28
  • [Presentation] 微生物発酵法による植物アルカロイド生産と生薬生理活性物質の創製2015

    • Author(s)
      南 博道
    • Organizer
      2015年度日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      岡山大学農学部(岡山)
    • Year and Date
      2015-03-28
    • Invited
  • [Presentation] 大腸菌を利用した医薬中間体候補化合物であるメチル化ノルラウダノソリンコレクションの作成2015

    • Author(s)
      中川明、杉本美菜世、松村栄太郎、小柳喬、片山高嶺、山本憲二、佐藤文彦、南博道
    • Organizer
      2015年度日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      岡山大学農学部(岡山)
    • Year and Date
      2015-03-28
  • [Presentation] 微生物を用いたイソキノリンアルカロイドstylopine生産系の構築2015

    • Author(s)
      岡野峻祐、堀健太郎、佐藤文彦
    • Organizer
      日本農芸化学会関西支部第488回講演会
    • Place of Presentation
      楽友会館(京都)
    • Year and Date
      2015-01-31
  • [Presentation] イソキノリンアルカロイド生合成マシナリー構築2014

    • Author(s)
      佐藤文彦
    • Organizer
      新学術領域研究 生合成マシナリー 第8回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学大学院薬学研究科総合研究棟薬学部講堂
    • Year and Date
      2014-12-06
    • Invited
  • [Presentation] 微生物発酵法による植物アルカロイド生産2014

    • Author(s)
      南 博道
    • Organizer
      第32回バイオ技術シーズ公開会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2014-09-25
    • Invited
  • [Presentation] P450s and plant isoquinoline alkaloid biosynthesis2014

    • Author(s)
      Fumihiko Sato
    • Organizer
      12th International symposium on cytochrome P450: Biodiversity and biotechnology
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      2014-09-24 – 2014-09-28
    • Invited
  • [Presentation] Reconstruction of benzylisoquinoline alkaloid biosynthetic pathway in methylotrophic yeast with heterologous expression of cytochrome P450s2014

    • Author(s)
      K. Hori, S. Okano, F. Sato
    • Organizer
      12th International symposium on cytochrome P450: Biodiversity and biotechnology
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      2014-09-24 – 2014-09-28
  • [Presentation] 微生物発酵法による植物アルカロイド生産と創薬展開2014

    • Author(s)
      中川明、小柳喬、片山高嶺、山本憲二、佐藤文彦、熊谷英彦、南博道
    • Organizer
      第26回微生物シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2014-09-19 – 2014-09-20
  • [Presentation] 微生物を用いたイソキノリンアルカロイド生合成経路の再構築2014

    • Author(s)
      堀健太郎、岡野峻祐、佐藤文彦
    • Organizer
      第32回日本植物細胞分子生物学会(盛岡)大会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      いわて県民情報交流センター(盛岡)
    • Year and Date
      2014-08-22
  • [Presentation] イソキノリンアルカロイド生合成系の転写因子CjWRKY1の転写後制御に関する解析2014

    • Author(s)
      山田泰之、佐藤文彦
    • Organizer
      第32回日本植物細胞分子生物学会(盛岡)大会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      いわて県民情報交流センター(盛岡)
    • Year and Date
      2014-08-22
  • [Presentation] 植物二次代謝産物、特にイソキノリンアルカロイドとその生理活性、2014

    • Author(s)
      佐藤文彦
    • Organizer
      京都大学生命科学研究科シンポジウム
    • Place of Presentation
      芝蘭会館(京都)
    • Year and Date
      2014-07-02
    • Invited
  • [Book] Plant Secondary Metabolism. In: eLS 20142014

    • Author(s)
      Sato, Fumihiko
    • Total Pages
      p13
    • Publisher
      John Wiley & Sons Ltd
  • [Remarks] 京都大学アカデミックデイ 植物の薬用成分を効率的に作る

    • URL

      http://research.kyoto-u.ac.jp/academic-day/2014/07/

URL: 

Published: 2016-06-01  

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