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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Molecular mechanism and application of structural elements that govern carbohydrase-catalyzed transfer reaction

Research Project

Project/Area Number 26292049
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

木村 淳夫  北海道大学, (連合)農学研究科(研究院), 教授 (90186312)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 奥山 正幸  北海道大学, (連合)農学研究科(研究院), 講師 (00344490)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords糖質酵素 / 糖転移反応 / 構造因子
Outline of Annual Research Achievements

糖質酵素が示すオリゴ糖の合成反応を支配・向上できる4つの新現象を見出した。すなわち、α-1,3-グルコシド転移酵素、触媒残基の変異酵素、触媒水の供給機構および多糖合成酵素のC末端削除体である。本研究の目的は、これらの現象を解析し、糖転移反応の分子機構を知り、応用研究に結びつけることにある。
1. α-1,3-グルコシド転移酵素:昨年度に見出された複数候補(芳香族残基と酸性残基)を解析した。両者の置換は、α-1,3-グルコシド基質への親和性を親酵素より高めたが、前者の転移能は低下した。一方、後者は親酵素より高い転移活性を与えたので、当該アミノ酸が構造因子と推定した。酵素結晶は得られなかったが、類縁酵素の構造情報から両残基は糖転移の受容体サイトに存在した。
2. 触媒残基の変異酵素:昨年度に本手法を産業用の糖質酵素に活用し、触媒残基の変異体を構築した。弱い転移力を示したので、受容体基質を検討した。特定の受容体に対し転移活性が認められたが、充分な転移量が得られなかった。この理由は、置換した触媒残基が糖転移の受容体サイトを形成するためと考えられた。
3. 触媒水の供給機構:触媒水の供給孔を構築する疎水性残基(第3の候補である芳香族アミノ酸)の変異で細孔遮断を試みた。作製した置換酵素を解析すると、昨年度に行った疎水性残基(第2の候補)の変異とほぼ同等の加水分解力低下と転移能上昇を示し、かつ第1候補の塩基性残基(初年度結果)より高い転移活性を与えた。変異酵素の結晶は作製できたが、構造解析に不向きであった。しかし、親酵素の構造から上述の3アミノ酸は細孔内に存在する。
4. 多糖合成酵素のC末端削除体:ようやく得られた候補領域に残基置換を導入し、2アミノ酸からなる構造因子の存在を確認できた。さらに、末端部分にさらに最低1箇所以上の構造因子の存在を示唆する結果を得た。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (14 results)

All 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 6 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] ソウル大学/全南大学(韓国)

    • Country Name
      KOREA (REP. OF KOREA)
    • Counterpart Institution
      ソウル大学/全南大学
  • [Journal Article] Heterologous production and characterization of catalytic subunit of glucosidase II in Schizosaccharomyces pombe2017

    • Author(s)
      Masayuki Okuyama, Masashi Miyamoto, Takayoshi Tagami, Ichiro Matsuo, Ma Min, Ryo Serizawa, Masanari Tanuma, Haruhide Mori, Atsuo Kimura
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 長鎖阻害剤の利用による植物α-グルコシダーゼの機能構造相関の解明2016

    • Author(s)
      田上貴祥, 山下恵太郎, 奥山正幸, 森 春英, 姚 閔, 木村淳夫
    • Journal Title

      応用糖質科学

      Volume: 6 Pages: 103-108

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] α-Glucosidases and α-1,4-glucan lyases: structures, functions, and physiological actions2016

    • Author(s)
      Masayuki Okuyama, Wataru Saburi, Haruhide Mori, Atsuo Kimura
    • Journal Title

      Cellular and Molecular Life Sciences

      Volume: 73 Pages: 2727-2751

    • DOI

      DOI:10.1007/s00018-016-2247-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Two novel glycoside hydrolases responsible for the catabolism of cyclobis-(1→6)-α-nigerosyl2016

    • Author(s)
      Takayoshi Tagami, Eri Miyano, Juri Sadahiro, Masayuki Okuyama, Tomohito Iwasaki, Atsuo Kimura
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 291 Pages: 16438-16447

    • DOI

      DOI:10.1074/jbc.M116.727305

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Kinetic properties and substrate inhibition of α-galactosidase from Aspergillus niger2016

    • Author(s)
      Julan Liao, Masayuki Okuyama, Keigo Ishihara, Yoshinori Yamori, Shigeo Iki, Takayoshi Tagami, Haruhide Mori, Seiya Chiaba, Atsuo Kimura
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 80 Pages: 1747-1752

    • DOI

      DOI:10.1080/09168451.2015.1136884

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Efficient synthesis of α-galactosyl oligosaccharides using a mutant Bacteroides thetaiotaomicron retaining α-galactosidase (BtGH97b)2016

    • Author(s)
      Masayuki Okuyama, Kana Matsunaga, Ken-ichi Watanabe, Keitaro Yamashita, Takayoshi Tagami, Asako Kikuchi, Min Ma, Patcharapa Klahan, Haruhide Mori, Min Yao, Atsuo Kimura
    • Journal Title

      FEBS Journal

      Volume: 284 Pages: 766-783

    • DOI

      DOI:10.1111/febs.14018

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] GH97α-galactosidase求核触媒変異酵素が触媒する糖転移反応の反応機構2016

    • Author(s)
      松永夏奈,奥山正幸,渡辺健一,田上貴祥,山下恵太郎,姚閔,森春英,木村淳夫
    • Organizer
      日本応用糖質科学会平成28年度大会
    • Place of Presentation
      福山大学宮地茂記念館(広島県・福山市)
    • Year and Date
      2016-09-14 – 2016-09-16
  • [Presentation] Structure element to regulate transglucosidation specificity of Aspergillus niger α-glucosidase2016

    • Author(s)
      Min Ma, Masayuki Okuyama, Megumi Sato, Takayoshi Tagami, Haruhide Mori, Atsuo Kimura
    • Organizer
      The Sixth Symposium on the Alpha-Amylase Family
    • Place of Presentation
      Smolenice Castle (スモーレニス・スロバキア)
    • Year and Date
      2016-09-11 – 2016-09-15
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Novel single- and double-anchor-type isomaltomegalosaccharides: production and function2016

    • Author(s)
      Weeranuch Lang, Yuya Kumagai, Juri Sadahiro, Masayuki Okuyama, Haruhide Mori, Hiroshi Hara, Atsuo Kimura
    • Organizer
      The Sixth Symposium on the Alpha-Amylase Family
    • Place of Presentation
      Smolenice Castle (スモーレニス・スロバキア)
    • Year and Date
      2016-09-11 – 2016-09-15
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Novel single- or double-anchor-type isomaltomegalosaccharide, which enables to solubilize BCS-II compounds2016

    • Author(s)
      Atsuo Kimura
    • Organizer
      International Symposium: Current Issues in Food Chemistry and Biotechnology
    • Place of Presentation
      Seoul National University (平昌・韓国)
    • Year and Date
      2016-08-01 – 2016-08-01
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Purification and characterization of α-1,3-glucosidase from Aspergillus niger2016

    • Author(s)
      Min Ma, Takayoshi Tagami, Masayuki Okuyama, Atsuo Kimura
    • Organizer
      2016 International Carbohydrate Symposium
    • Place of Presentation
      Marriott New Orleans (ニューオーリンズ・米国)
    • Year and Date
      2016-07-17 – 2016-07-22
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Reaction mechanism of glycosidases by studying 1,5-anhydro-D-fructose (AF) production2016

    • Author(s)
      Janjira Maneesan, Hideyuki Matsuura, Takayoshi Tagami, Haruhide Mori, Atsuo Kimura
    • Organizer
      2016 International Carbohydrate Symposium
    • Place of Presentation
      Marriott New Orleans (ニューオーリンズ・米国)
    • Year and Date
      2016-07-17 – 2016-07-22
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 分子酵素学研究室

    • URL

      http://www.agr.hokudai.ac.jp/rfoa/abs/abs2-3.html

URL: 

Published: 2018-01-16  

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