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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Development of biomarkers and novel therapeutic targets for malignant bone and soft tissue tumors using the methods of global expression analysis

Research Project

Project/Area Number 26293342
Research InstitutionNational Cancer Center Japan

Principal Investigator

川井 章  国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 科長 (90252965)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 近藤 格  国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (30284061)
落谷 孝広  国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 主任分野長 (60192530)
市川 仁  国立研究開発法人国立がん研究センター, 先端医療開発センター, ユニット長 (30201924)
吉田 朗彦  国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医員 (80574780)
細野 亜古  国立研究開発法人国立がん研究センター, 東病院, 医長 (00602947)
小倉 浩一  国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医員 (20583115)
Project Period (FY) 2014-04-01 – 2017-03-31
Keywords骨軟部腫瘍 / 肉腫 / 粘液線維肉腫 / 粘液型脂肪肉腫 / ゲノム解析 / エピゲノム解析 / プロテオーム解析 / PDXモデル
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、多彩な生物学的特徴を有する悪性骨軟部腫瘍(肉腫)の分子生物学的異常を遺伝子からタンパク質まで重層的に解析し、臨床上重要な表現型に関与する因子を明らかにすること、分子背景に基づく診断精度の向上、治療法選択の根拠、特異的な分子生物学的異常を標的とした新たな治療法の開発を促進することを目的とした。
1.遺伝子解析:軟骨肉腫、粘液線維肉腫、骨巨細胞腫の全エクソン解読ならびに全トランスクリプトーム解読を行い、体細胞ゲノム異常の包括的な同定、融合遺伝子の検出を試み、いずれの組織型においても新規ドライバー変異、融合遺伝子を同定した。さらに粘液線維肉腫については約45万箇所のCpGメチル化を包括的に解析し、エピゲノムに見られる異常から粘液線維肉腫は予後と関連する3群に分類されることを見出した。また粘液型脂肪肉腫において転移や予後不良と関係するround cell領域に高発現するmicroRNA135bを同定した。microRNA135b高値の患者群は低い患者群と比較して予後不良であること、さらに動物モデルを使った実験からmiR-135bの抑制が肺転移を抑制すること、新たな治療標的となりうることを示した。
2.タンパク質解析:肉腫に対する新規チロシンキナーゼ阻害剤パゾパニブに対して耐性を示す細胞株において特徴的なチロシンリン酸化酵素の発現および活性を同定し、培地中に放出されるタンパク質を同定した。また粘液線維肉腫において浸潤に関わるタンパク質を同定した。
3.病理学的研究:肉腫特異的な遺伝子異常等をFISHや免疫染色にて検出し、病理診断バイオマーカーとして活用するため、様々な抗体やFISHプローブの有用性について、複数症例を用いて妥当性検証を行った。具体的には、TFE3免疫染色、WT1遺伝子のFISH検索、FGF23免疫染色、USP6遺伝子のFISH検索等につき、その有用性を確認した。

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (43 results)

All 2017 2016

All Journal Article (19 results) (of which Peer Reviewed: 19 results,  Open Access: 18 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (19 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 7 results) Book (5 results)

  • [Journal Article] Cross-cultural adaptation and validation of the Japanese version of the Toronto Extremity Salvage Score (TESS) for patients with malignant musculoskeletal tumors in the upper extremities.2017

    • Author(s)
      Akiyama T, Uehara K, Ogura K, Shinoda Y, Iwata S, Saita K, Tanzawa Y, Nakatani F, Yonemoto T, Kawano H, Davis AM, Kawai A.
    • Journal Title

      J Orthop Sci.

      Volume: 22(1) Pages: 127-132

    • DOI

      10.1016/j.jos.2016.09.012

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Phase 2 study of eribulin in patients with previously treated advanced or metastatic soft tissue sarcoma.2017

    • Author(s)
      Kawai A, Araki N, Naito Y, Ozaki T, Sugiura H, Yazawa Y, Morioka H, Matsumine A, Saito K, Asami S, Isu K.
    • Journal Title

      Jpn J Clin Oncol.

      Volume: 47(2) Pages: 137-144

    • DOI

      10.1093/jjco/hyw175

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Proteomic study of hepatocellular carcinoma using a novel modified aptamer-based array (SOMAscanTM) platform.2017

    • Author(s)
      Qiao Z, Pan X, Parlayan C, Ojima H, Kondo T.
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta.

      Volume: 4 Pages: 434-443

    • DOI

      10.1016/j.bbapap.2016.09.011.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] requent amplification of receptor tyrosine kinase genes in well-differentiated/dedifferentiated liposarcoma.2017

    • Author(s)
      Asano N, Yoshida A, Mitani S, Kobayashi E, Shiotani B, Komiyama M, Fujimoto H, Chuman H, Morioka H, Matsumoto M, Nakamura M, Kubo T, Kato M, Kohno T, Kawai A, Kondo T, Ichikawa H.
    • Journal Title

      Oncotarget.

      Volume: 8 Pages: 12941-12952

    • DOI

      10.18632/oncotarget.14652

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] H3K27me3 Immunohistochemistry in the Diagnosis of Malignant Peripheral Nerve Sheath Tumors.2017

    • Author(s)
      Asano N, Yoshida A, Ichikawa H, Mori T, Nakamura M, Kawai A, Hiraoka N.
    • Journal Title

      Histopathology.

      Volume: 70 Pages: 385-393

    • DOI

      10.1111/his.13072

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Highly recurrent H3F3A mutations with additional epigenetic regulator alterations in giant cell tumor of bone.2017

    • Author(s)
      Ogura K, Hosoda F, Nakamura H, Hama N, Totoki Y, Yoshida A, Ohashi S, Rokutan H, Takai E, Yachida S, Kawai A, Tanaka S, Shibata T.
    • Journal Title

      Genes Chromosomes Cancer.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Reduced argininosuccinate synthetase expression in refractory sarcomas: Impacts on therapeutic potential and drug resistance.2016

    • Author(s)
      Kim Y, Kobayashi E, Kubota D, Suehara Y, Mukaihara K, Akaike K, Ito A, Kaneko K, Chuman H, Kawai A, Kitano S.
    • Journal Title

      Oncotarget.

      Volume: 7(43) Pages: 70832-70844

    • DOI

      10.18632/oncotarget.12225

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Results of sub-analysis of a phase 2 study on trabectedin treatment for extraskeletal myxoid chondrosarcoma and mesenchymal chondrosarcoma.2016

    • Author(s)
      Morioka H, Takahashi S, Araki N, Sugiura H, Ueda T, Takahashi M, Yonemoto T, Hiraga H, Hiruma T, Kunisada T, Matsumine A, Susa M, Nakayama R, Nishimoto K, Kikuta K, Horiuchi K, Kawai A.
    • Journal Title

      BMC Cancer.

      Volume: 16 Pages: 479

    • DOI

      10.1186/s12885-016-2511-y

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Reliability and Validity of a Japanese-language and Culturally Adapted Version of the Musculoskeletal Tumor Society Scoring System for the Lower Extremity.2016

    • Author(s)
      Iwata S, Uehara K, Ogura K, Akiyama T, Shinoda Y, Yonemoto T, Kawai A.
    • Journal Title

      Clin Orthop Relat Res.

      Volume: 474(9) Pages: 2044-2052

    • DOI

      10.1007/s11999-016-4880-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The clinical outcome of pazopanib treatment in Japanese patients with relapsed soft tissue sarcoma: A Japanese Musculoskeletal Oncology Group (JMOG) study.2016

    • Author(s)
      Nakamura T, Matsumine A, Kawai A, Araki N, Goto T, Yonemoto T, Sugiura H, Nishida Y, Hiraga H, Honoki K, Yasuda T, Boku S, Sudo A, Ueda T.
    • Journal Title

      Cancer.

      Volume: 122(9) Pages: 1408-1416

    • DOI

      10.1002/cncr.29961

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A randomized, double-blind, placebo-controlled, Phase III study of pazopanib in patients with soft tissue sarcoma: results from the Japanese subgroup.2016

    • Author(s)
      Kawai A, Araki N, Hiraga H, Sugiura H, Matsumine A, Ozaki T, Ueda T, Ishii T, Esaki T, Machida M, Fukasawa N.
    • Journal Title

      Jpn J Clin Oncol.

      Volume: 46(3) Pages: 248-253

    • DOI

      10.1093/jjco/hyv184

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Retrospective inter- and intra-patient evaluation of trabectedin after best supportive care for patients with advanced translocation-related sarcoma after failure of standard chemotherapy.2016

    • Author(s)
      Araki N, Takahashi S, Sugiura H, Ueda T, Yonemoto T, Takahashi M, Morioka H, Hiraga H, Hiruma T, Kunisada T, Matsumine A, Kawai A.
    • Journal Title

      Eur J Cancer.

      Volume: 56 Pages: 122-130

    • DOI

      10.1016/j.ejca.2015.12.014

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] miR-125b and miR-100 Are Predictive Biomarkers of Response to Induction Chemotherapy in Osteosarcoma.2016

    • Author(s)
      Kubota D, Kosaka N, Fujiwara T, Yoshida A, Arai Y, Qiao Z, Takeshita F, Ochiya T, Kawai A, Kondo T.
    • Journal Title

      Sarcoma.

      Volume: 2016 Pages: 1390571

    • DOI

      10.1155/2016/1390571.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Synovial sarcoma cell lines showed reduced DNA repair activity and sensitivity to a PARP inhibitor.2016

    • Author(s)
      Yamasaki H, Miyamoto M, Yamamoto Y, Kondo T, Watanabe T, Ohta T.
    • Journal Title

      Genes Cells.

      Volume: 21(8) Pages: 852-860

    • DOI

      10.1111/gtc.12387.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Proteogenomics for the Study of Gastrointestinal Stromal Tumors.2016

    • Author(s)
      Kondo T.
    • Journal Title

      Adv Exp Med Biol.

      Volume: 926 Pages: 139-151

    • DOI

      10.1007/978-3-319-42316-6_9

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Novel p53 target gene FUCA1 encodes a fucosidase and regulates growth and survival of cancer cells.2016

    • Author(s)
      Ezawa I, Sawai Y, Kawase T, Okabe A, Tsutsumi S, Ichikawa H, Kobayashi Y, Tashiro F, Namiki H, Kondo T, Semba K, Aburatani H, Taya Y, Nakagama H, Ohki R.
    • Journal Title

      Cancer Sci.

      Volume: 107(6) Pages: 734-745

    • DOI

      10.1111/cas.12933.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] PAI-1, a target gene of miR-143, regulates invasion and metastasis by upregulating MMP-13 expression of human osteosarcoma.2016

    • Author(s)
      Hirahata M, Osaki M, Kanda Y, Sugimoto Y, Yoshioka Y, Kosaka N, Takeshita F, Fujiwara T, Kawai A, Ito H, Ochiya T, Okada F.
    • Journal Title

      Cancer Med.

      Volume: 5 Pages: 892-902

    • DOI

      10.1002/cam4.651

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] miR-135b, a key regulator of malignancy, is linked to poor prognosis in human myxoid liposarcoma.2016

    • Author(s)
      Nezu Y, Hagiwara K, Yamamoto Y, Fujiwara T, Matsuo K, Yoshida A, Kawai A, Saito T, Ochiya T.
    • Journal Title

      Oncogene.

      Volume: 35 Pages: 6177-6188

    • DOI

      10.1038/onc.2016.157

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Follicular dendritic cell sarcoma treated with a variety of chemotherapy.2016

    • Author(s)
      Sasaki M, Izumi H, Yokoyama T, Kojima M, Hosono A.
    • Journal Title

      Hematol Oncol.

      Volume: 8 Pages: 725-728

    • DOI

      10.1002/ajh.20852

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] miR-135b is a key regulator of malignancy of human myxoid liposarcoma2017

    • Author(s)
      Nezu Y, Kawai A, Saito T, Ochiya T.
    • Organizer
      Orthopaedic Research Society (ORS) Annual Meeting
    • Place of Presentation
      San Diego(USA)
    • Year and Date
      2017-03-19 – 2017-03-22
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Challenges and resource stratified management of soft tissue sarcoma treatment in Asia, Introduction2016

    • Author(s)
      Akira Kawai
    • Organizer
      ESMO Asia 2016
    • Place of Presentation
      Singapore
    • Year and Date
      2016-12-16 – 2016-12-19
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 難治性小児固形腫瘍に対するGPC3ペプチドワクチン療法の第I相試験2016

    • Author(s)
      細野亜古、金田英秀、原純一、木下義晶、孝橋賢一、真部敦、中面哲也
    • Organizer
      第58回小児血液・がん学会
    • Place of Presentation
      品川プリンスホテル(東京都港区)
    • Year and Date
      2016-12-15 – 2016-12-15
  • [Presentation] Evolving Treatment of Sarcomas ;The role of multi-institutional and international collaboration2016

    • Author(s)
      Akira Kawai
    • Organizer
      4th Singapore Sarcoma Symposium
    • Place of Presentation
      Singapore
    • Year and Date
      2016-11-05 – 2016-11-06
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Recent Advances of Sarcoma Treatment in Japan2016

    • Author(s)
      川井 章
    • Organizer
      第54回日本癌治療学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-10-20 – 2016-10-22
  • [Presentation] Recent Advances of Sarcoma Treatment in Japan2016

    • Author(s)
      Akira Kawai
    • Organizer
      60th Korean Orthopaedic Association
    • Place of Presentation
      Incheon(Korea)
    • Year and Date
      2016-10-19 – 2016-10-22
    • Invited
  • [Presentation] Biomarker development by cancer proteomics,2016

    • Author(s)
      Tadashi Kondo
    • Organizer
      10th Central and Eastern European Proteome Conference
    • Place of Presentation
      Budapest( Hungary)
    • Year and Date
      2016-10-11 – 2016-10-14
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 次世代シークエンサーを用いた高分化/脱分化脂肪肉腫の治療標的探索2016

    • Author(s)
      浅野尚文、他
    • Organizer
      第75回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-10-06 – 2016-10-08
  • [Presentation] ゲノム解析による軟部肉腫の治療奏効性バイオマーカー探索2016

    • Author(s)
      三谷幸代、他
    • Organizer
      第75回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-10-06 – 2016-10-08
  • [Presentation] Proteomics approach to sarcoma research toward clinical application.2016

    • Author(s)
      Tadashi Kondo
    • Organizer
      Annual Meeting of Asia Oceania Human Proteome Organization.
    • Place of Presentation
      Taiwan
    • Year and Date
      2016-09-22 – 2016-09-23
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] がんのプロテオーム解析の考え方2016

    • Author(s)
      近藤格
    • Organizer
      第67回日本電気泳動学会総会
    • Place of Presentation
      釧路市観光国際交流センター(北海道釧路市)
    • Year and Date
      2016-08-26 – 2016-08-27
  • [Presentation] 患者由来ゼノグラフトパネルの整備とがん基礎研究への応用の可能性2016

    • Author(s)
      高橋真美,石ヶ守里加子,河野隆志,市村幸一、吉田朗彦、川井章、近藤格,今井俊夫
    • Organizer
      第31回発癌病理研究会
    • Place of Presentation
      信州松代ロイヤルホテル(長野県長野市)
    • Year and Date
      2016-08-23 – 2016-08-25
  • [Presentation] Systemic Treatment for Soft Tissue Sarcomas Current concepts and the latest findings2016

    • Author(s)
      川井 章
    • Organizer
      第14回日本臨床腫瘍学会
    • Place of Presentation
      神戸国際展示場(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2016-07-28 – 2016-07-30
    • Invited
  • [Presentation] Treatment strategy for sarcoma in pediatric patients Past,Present and Future2016

    • Author(s)
      細野亜古
    • Organizer
      第49回日本整形外科学会骨軟部腫瘍学術集会
    • Place of Presentation
      東京ドームホテル(東京都文京区)
    • Year and Date
      2016-07-15 – 2016-07-15
  • [Presentation] Sarcoma cell lines: Current status and perspectives.2016

    • Author(s)
      Xiaoqing Pan, Akihiko Yoshida, Akira Kawai, Tadashi Kondo.
    • Organizer
      第89回 日本組織培養学会年会
    • Place of Presentation
      千里ライフサイエンスセンター ( 大阪府豊中市)
    • Year and Date
      2016-05-25 – 2016-05-26
  • [Presentation] 骨・軟部肉腫に対する新規治療薬開発2016

    • Author(s)
      川井 章
    • Organizer
      第89回日本整形外科学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-05-12 – 2016-05-15
    • Invited
  • [Presentation] 肉腫のプロテオーム解析2016

    • Author(s)
      近藤格
    • Organizer
      第89回日本整形外科学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-05-12 – 2016-05-15
    • Invited
  • [Presentation] H3K27me3免疫染色は悪性末梢神経鞘腫瘍の診断に有用である2016

    • Author(s)
      吉田 朗彦、浅野尚文、森泰昌、川井章、平岡伸介
    • Organizer
      第105回日本病理学会総会
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2016-05-12 – 2016-05-12
  • [Presentation] Novel patient-derived xenograft and primary tissue culture cell for pre-clinical study in sarcoma.2016

    • Author(s)
      Xiaoqing Pan, Mami Takahashi, Hitoshi Ichikawa, Akihiko Yoshida, Akira Kawai, Toshio Imai, Tadashi Kondo.
    • Organizer
      Annual Meeting of American Association of Cancer Research
    • Place of Presentation
      New Orleans(USA)
    • Year and Date
      2016-04-16 – 2016-04-20
    • Int'l Joint Research
  • [Book] 希少がんを研究するということ2016

    • Author(s)
      近藤格
    • Total Pages
      67(30-31)
    • Publisher
      Clinic Magazin
  • [Book] プロテオーム解析によるがんバイオマーカー開発2016

    • Author(s)
      近藤格
    • Total Pages
      187(169-175)
    • Publisher
      生物試料分析
  • [Book] プロテオーム解析によるがんのバイオマーカー開発2016

    • Author(s)
      近藤格
    • Total Pages
      863(520-523)
    • Publisher
      血液内科
  • [Book] 悪性胸膜中皮腫のプロテオーム解析2016

    • Author(s)
      近藤格
    • Total Pages
      775(145-149)
    • Publisher
      医学のあゆみ
  • [Book] こどものがんと治療2016

    • Author(s)
      細野亜古
    • Total Pages
      112
    • Publisher
      メディカ出版

URL: 

Published: 2018-01-16  

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