2015 Fiscal Year Annual Research Report

シングルセル発現解析と核膜変異体ライブラリを用いた転写サイクル始動機構の解明

Publicly Offered Research

Project Area	Integral understanding of the mechanism of transcription cycle through quantitative, high-resolution approaches
Project/Area Number	15H01359
Research Institution	Waseda University
Principal Investigator	佐藤政充早稲田大学, 理工学術院, 准教授 (50447356)
Project Period (FY)	2015-04-01 – 2017-03-31
Keywords	遺伝子発現 / トランスクリプトーム / RNA / 細胞周期 / 分裂酵母 / シングルセル解析
Outline of Annual Research Achievements	本研究は分裂酵母の１細胞（シングルセル）から発現しているRNAを単離して、そのtranscriptomeを作成することを目標としている。本年度はまず、栄養培地にて増殖状態にある分裂酵母S. pombeの１細胞を単離し、RNA-seq法でtranscriptomeを作成することを試みた。分裂酵母１細胞からRNAを抽出する試みはこれまで例がなかったため、シングルセル単離を専門とする竹山春子早大教授らのグループとの共同研究を通してその手法を確立し、既存の細胞集団から採取したRNAに基づくtranscriptomeと非常に良く相関したシングルセルtranscriptomeを作成することができた。
Current Status of Research Progress	Current Status of Research Progress 1: Research has progressed more than it was originally planned. Reason 分裂酵母シングルセルのtranscriptomeの作成は成功し、既存の細胞集団の発現プロファイルに非常に良く相関したプロファイルを作成することができているため。
Strategy for Future Research Activity	今後は、栄養増殖状態の１細胞ではなく、栄養源飢餓状態の１細胞からRNAを単離してtranscriptomeを作成する。栄養源飢餓下では遺伝子発現状態が大きく異なることが既に（細胞集団のRNA解析から）明らかになっており、まずシングルセル解析でも類似した特徴的な遺伝子発現が検出できることを確認する。また、これまでの細胞集団RNAでは明確に検出できなかったような遺伝子発現を検出できるのではないかという期待もかけられる。