Evolutionary studies on the sequence specific integration of LTR-retrotoransposons

2023 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21K06284
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 45010:Genetics-related
• Research Institution: Kyoto Sangyo University
• Principal Investigator: KAWABE Akira 京都産業大学, 生命科学部, 教授 (10582405)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2024-03-31
• Keywords: トランスポゾン / 動原体 / アブラナ科 / シロイヌナズナ

Outline of Final Research Achievements

Transposon families targeting the centromere region were characterized and their evolutionary mode was analyzed in Brassicaceae species. In the genus Capsella, we found different types of subgroups that distribute to centromere regions but other to non-centromre regions. This family in even a relatively distantly related species of Arabidopsis was shown to localize to the centromere region, confirming that this group in the Brassicaceae has integrated targetting to the centromere regions. However, in many species, groups distributed outside the centromere have emerged, and some may target to the high-copy regions.

Free Research Field

分子集団遺伝学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

トランスポゾンはゲノムの構造の詳細や変化パターン、進化機構を考えるうえで非常に重要なファクターである。トランスポゾンはゲノム中にランダムに分布するわけではなく動原体やヘテロクロマチンに多く局在することがわかっていたがその詳細な機構は不明であった。本研究ではCopia93/20ファミリーについて、その進化様式をアブラナ科全体で調査し、動原体をターゲットとする挿入特異性が広くみられること、動原体特異性は幾つかの種や種の中でも特定のサブグループで失われていることを明らかにした。これらのパターンはトランスポゾンの局在する機構やその変化を理解するうえで重要である。