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X線結晶構造解析による酸素呼吸の分子機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 08408026
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関大阪大学

研究代表者

月原 冨武  大阪大学, たんぱく質研究所, 教授 (00032277)

研究分担者 酒井 宏明  大阪大学, たんぱく質研究所, 助手 (00272162)
山口 宏  大阪大学, 蛋白質研究所, 助手 (10252719)
佐藤 衛  横浜市立大学, 総合理学研究科, 教授 (60170784)
研究期間 (年度) 1996 – 1997
研究課題ステータス 完了 (1997年度)
配分額 *注記
31,700千円 (直接経費: 31,700千円)
1997年度: 8,200千円 (直接経費: 8,200千円)
1996年度: 23,500千円 (直接経費: 23,500千円)
キーワード結晶構造解析 / チトクロムC酸化酵素 / 酸化型チトクロムC酸化酵素 / 還元型チトクロムC酸化酵素 / CO結合型チトクラムC酸化酵素 / アジド結合型チクトロムC酸化酵素 / 膜蛋白質 / 呼吸酵素 / 分子機構 / タンパク質 / 酸素呼吸 / 膜タンパク質 / チトクロム酸化酵素
研究概要

この2年間の研究では研究では、ウシ心筋のチトクロムc酸化酵素の完全酸化型の2.3A分解能、還元型の2.36A分解能、酸素結合型モデルであるCO化型の2.8A分解能、アジド化型の2.9A分解能の結晶構造解析に成功し、以下のことが明らかになった。
酸化型酵素の2.3A分解能の結晶構造解析では、(1)酸素還元活性中心への配位子はパーオキシドである。(2)CuBの配位子であるHis240はTyr244と共有結合している。(3)分子内部に電子伝達、プロトン輸送に関与する水がある。(4)Ca或いはNaと思われる金属イオンが分子内部に存在する。(5)2量体で存在し、リン脂質であるカルジオリピンは2量体を安定化している。(6)膜貫通領域のαヘリックスにはグリシン残基が7%含まれており、膜貫通領域ではグリシン残基はαヘリックスを壊すアミノ酸として働いていない。
還元型酵素の2.35A分解能の結晶構造解析では、(1)酸素還元活性中心のFea3とCuBの間には配位子は存在しない。(2)サブユニットIのGly49からAsn55付近の構造が酸化型と大きく異なっている。
CO化還元型酵素の2.8A分解能の結晶構造解析では、(1)COは酸素還元中心に配位している。(2)サブユニットIのGly49からAsn55付近の構造は還元型と同じである。
アジド化酸化型酵素の2.9A分解能の結晶構造解析では、(1)アジドは酸素還元中心と蛋白質表面に結合している。(2)細菌の酵素で示されたCuBに配位したHisの構造の揺らぎは見られなかった。

報告書

(3件)
  • 1997 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1996 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (10件)

  • [文献書誌] T.TSukihara et al.: "The whole Structure of The B-Subunit oxidiged cytochromec oxidase at 2.8Å" Science. 272. 1136-1144 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] E.Wallin et al.: "Architecture of helix bundle membrane proteins:An analysis of Cytochrome coxidase from dovine mitochondria" Protein Science. 6. 808-815 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Tomigaki et al.: "Crystal Structure Analysis of Bovine Heart Cytochromec oxidase at 2.8Å Resolution" Acta Crystallographica D. (in press). (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Tsukihara, H.Aoyama, E.Yamashita, T.Tomizaki, H.Yamaguchi, K.Shinzawa-Itoh, R.Nakashima, R.Yaono and S.Yoshikawa: "The Whole Structure of the 13-Subinit Oxidized Cytochrome c Oxidase at 2.8 A." science. 272. 1136-1144 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Wallin, E., Tsukihara, T., Yoshikawa, S., Von Heijine, G., and Elofsson, A.: "Architecture of helix bundle membrane proteins : An analysis of cytochrome c oxidase from bovine mitochondria." Protein Science. 6. 808-815 (1987)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Tomizaki, E.Yamashita, H.Yamaguchi, H.Aoyama, T.Tsukihara, K,Shinzawa-Itoh, R.Nakashima, R.Yaono and S.Yoshikawa: "Crystal Structure Analysis of Bovine Heart Cytochrome c Oxidase at 2.8 A Resolution." Acta Crystallographica D. (in presse). (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Tsukinara, et al: "The Whote structure of the 13-Subinit Oxldized Cytochremec Oxidase at 2.8Å." Science.

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] T.Tsukinara, et al: "Architecture of helix bundle membrane proteins:Ananalysis of cytochrcme c oxidase from hovine mitochandrio" Protein Science.

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] T.Tsukihara, et al: "Crystal Structure Analysis of Bovine Heart Crtochrome c Oxidase at 2.8 A Resolution" Acta Crystollography D.

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] T.Tsukihara et al.: "The Whole Structure of the 13-Subunit Oxidized Cytochrome c Oxidase at 2.3A" Science. 272. 1136-1144 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書

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公開日: 1996-04-01   更新日: 2016-04-21  

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