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トリチウム被曝の第三要素「壊変効果」の分子シミュレーションによる解明

研究課題

研究課題/領域番号 21K19845
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分63:環境解析評価およびその関連分野
研究機関京都工芸繊維大学

研究代表者

藤原 進  京都工芸繊維大学, 材料化学系, 教授 (30280598)

研究分担者 中村 浩章  核融合科学研究所, ヘリカル研究部, 教授 (30311210)
阿蘇 司  富山高等専門学校, その他部局等, 教授 (30290737)
米谷 佳晃  国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構, 関西光科学研究所 光量子科学研究部, 主幹研究員 (80399419)
研究期間 (年度) 2021-07-09 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2022年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
2021年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
キーワード分子動力学シミュレーション / 反応力場 / トリチウムの壊変効果 / DNAの水和構造 / OHラジカル / Geant4-DNA
研究開始時の研究の概要

福島での原発事故において、トリチウム汚染水の処理が社会的関心を集めている。トリチウム被曝では、従来の研究で考慮されてきた直接作用と間接作用に加えて壊変効果が存在するにも関わらず、これまで見落とされてきた。本研究では、トリチウム被曝の第三要素「壊変効果」に着目し、置換トリチウムのβ壊変によるDNA損傷の分子機構を分子シミュレーションにより解明する。具体的には、トリチウムの置換部位を特定するための分子動力学(MD)計算とDNAの壊変効果を解析するための反応力場MD計算の組合せにより、置換トリチウムの壊変効果を解き明かす。さらに、置換トリチウムの壊変効果も含めたGeant4-DNAの開発を進める。

研究成果の概要

トリチウム被曝の第三要素「壊変効果」に着目し、置換トリチウムのβ壊変によるDNA損傷の分子機構を分子シミュレーションにより解き明かすことを目指して、トリチウムの置換部位を特定するための分子動力学(MD)計算を行った。その結果、水分子とOHラジカルとでは、DNAの糖水素へのアクセシビリティが大きく異なることが明らかになった。また、MD計算で得られたトリチウムの置換部位に関するデータをGeant4-DNAに実装することにより、間接作用による鎖切断の判定条件の妥当性を検討できることを明らかにした。

研究成果の学術的意義や社会的意義

福島での原発事故において、トリチウムを含む大量の汚染水の処理が社会的関心を集めている。トリチウム被曝においては、第三の要素「壊変効果」が存在するにも関わらず、これまで見落とされてきた。従来見落とされていた壊変効果の分子メカニズムを分子シミュレーションにより解き明かすことを目的とした本研究の成果は、生体の放射線被曝に関する理解の新展開に繋がるという学術的意義だけでなく、生体への放射線影響解析の今後の方向性を大きく変革し得るという社会的な意義も有する。

報告書

(3件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて 2023 2022 2021

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 4件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (14件) (うち国際学会 5件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] トリチウムによるDNA損傷のメカニズム――二本鎖切断の蛍光顕微鏡観察およびシミュレーション2022

    • 著者名/発表者名
      藤原 進、波多野 雄治、中村 浩章
    • 雑誌名

      日本物理学会誌

      巻: 77 号: 1 ページ: 35-41

    • DOI

      10.11316/butsuri.77.1_35

    • NAID

      130008139662

    • ISSN
      0029-0181, 2423-8872
    • 年月日
      2022-01-05
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] Damages of DNA in tritiated water2022

    • 著者名/発表者名
      Y. Hatano, H. Nakamura, S. Fujiwara, S. Seiki, T. Kenmotsu
    • 雑誌名

      The Enzimes: DNA Damage and Double Strand Breaks Part A

      巻: Vol. 5, Chap. 9 ページ: 131-152

    • DOI

      10.1016/bs.enz.2022.08.009

    • ISBN
      9780323993975
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [雑誌論文] Molecular dynamics study of microscopic mechanism of OH radical-induced DNA damage2022

    • 著者名/発表者名
      Ryuta Kawanami, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Yoshiteru Yonetani, Hiroaki Nakamura
    • 雑誌名

      Conference Proceedings of the 41st JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST 2022)

      巻: - ページ: 270-273

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Evaluation tolerance of DNA damaged by tritium beta decay using MD simulation2022

    • 著者名/発表者名
      Kento Ishiguro, Hiroaki Nakamura, Shunsuke Usami, Susumu Fujiwara, Seiki Saito
    • 雑誌名

      Conference Proceedings of the 41st JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST 2022)

      巻: - ページ: 135-138

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Atomistic analysis of strand breaks of DNA in tritiated water using Geant4-DNA simulation2022

    • 著者名/発表者名
      Tsukasa Aso, Masahara Hara, Yoshiyuki Hirano, Yoshiteru Yonetani, Susumu Fujiwara
    • 雑誌名

      Conference Proceedings of the 41st JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST 2022)

      巻: - ページ: 131-134

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of tritium beta decay in deoxy-D-ribose on duplex of telomeric DNA2021

    • 著者名/発表者名
      K. Ishiguro, H. Nakamura, T. Yasunaga, S. Fujiwara, T. Mizuguchi, A. Nakata, T. Miyazaki, T. Kenmotsu, Y. Hatano, S. Saito and Y. Yonetani
    • 雑誌名

      Conference Proceedings of the 40th JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST 2021)

      巻: - ページ: 352-355

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 分子動力学法を用いた生体高分子のトリチウム誘起壊変シミュレーションと精度評価のための実験系の構築2021

    • 著者名/発表者名
      中村浩章、藤原進、波多野雄治
    • 雑誌名

      プラズマ・核融合学会誌

      巻: 97 ページ: 561-567

    • NAID

      40022741100

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [雑誌論文] 置換トリチウムのβ崩壊に伴う高分子・DNA構造変化の分子シミュレーション2021

    • 著者名/発表者名
      藤原進
    • 雑誌名

      分子研レターズ

      巻: 84 ページ: 36-37

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • オープンアクセス
  • [学会発表] トリチウムβ崩壊を模擬したDNAテロメア構造の二重鎖切断の分子動力学シミュレーション2023

    • 著者名/発表者名
      中村 浩章, 石黒 健人, 藤原 進, 中田 彩子, 波多野 雄治, 齋藤 誠紀, 安永 卓生, 米谷 佳晃
    • 学会等名
      日本物理学会2023年春季大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] トリチウム壊変効果による損傷がもたらすDNA鎖結合強度変化のMDシミュレーション2023

    • 著者名/発表者名
      石黒 健人, 中村 浩章, 宇佐見 俊介, 藤原 進, 齋藤 誠紀, 米谷 佳晃, 安永 卓生, 中田 彩子
    • 学会等名
      2022年度核融合科学研究所一般共同研究(研究会)「医工連携を目指した生体分子・医療データの数値解析に関する研究会」
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] OHラジカルによるDNAの水素引き抜きの分子論的メカニズム2023

    • 著者名/発表者名
      川波 竜太, 藤原 進, 水口 朋子, 米谷 佳晃, 阿蘇 司, 中村 浩章
    • 学会等名
      2022年度核融合科学研究所一般共同研究(研究会)「医工連携を目指した生体分子・医療データの数値解析に関する研究会」
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] Evaluation of the effect of tritium decay on the tolerance of DNA structure by MD simulation2022

    • 著者名/発表者名
      Kento Ishiguro, Hiroaki Nakamura, Shunsuke Usami, Susumu Fujiwara, Yuji Hatano
    • 学会等名
      The 31st International Toki Conference on Plasma and Fusion Research (ITC-31)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Study of damaged DNA sites by hydroxyl radical on the accessibility of deoxyribose hydrogen by using the Geant4-DNA based simulation2022

    • 著者名/発表者名
      Tsukasa Aso, Yoshiyuki Hirano, Masanori Hara, Yoshiteru Yonetani, Susumu Fujiwara
    • 学会等名
      2022 IEEE Nuclear Science Symposium, Medical Imaging Conference and Room Temperature Semiconductor Detector Conference (2022 IEEE NSS-MIC-RTSD)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Molecular dynamics study of microscopic mechanism of OH radical-induced DNA damage2022

    • 著者名/発表者名
      Ryuta Kawanami, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Yoshiteru Yonetani, Tsukasa Aso and Hiroaki Nakamura
    • 学会等名
      The 41st JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2022)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Evaluation tolerance of DNA damaged by tritium beta decay using MD simulation2022

    • 著者名/発表者名
      Kento Ishiguro, Hiroaki Nakamura, Shunsuke Usami, Susumu Fujiwara and Seiki Saito
    • 学会等名
      The 41st JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2022)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] トリチウム崩壊がDNA構造の耐性に与える影響のMDシミュレーションによる評価2022

    • 著者名/発表者名
      中村 浩章, 石黒 健人, 宇佐見 俊介, 藤原 進, 波多野 雄治
    • 学会等名
      第39回プラズマ・核融合学会 年会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] DNAへのトリチウム壊変効果影響評価についての分子動力学シミュレーション2022

    • 著者名/発表者名
      中村 浩章, 石黒 健人, 藤原 進, 齋藤 誠紀, 波多野 雄治
    • 学会等名
      第14回核融合エネルギー連合講演会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] トリチウム壊変がもたらすDNA損傷のMDシミュレーション2022

    • 著者名/発表者名
      石黒 健人, 中村 浩章, 宇佐見 俊介, 藤原 進, 齋藤 誠紀, 米谷 佳晃
    • 学会等名
      光・量子ビーム科学合同シンポジウム2022(OPTO2022)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] OHラジカルによるDNA損傷メカニズムの分子動力学シミュレーション研究2022

    • 著者名/発表者名
      川波 竜太, 藤原 進, 水口 朋子, 米谷 佳晃, 中村 浩章
    • 学会等名
      光・量子ビーム科学合同シンポジウム2022(OPTO2022)
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] OHラジカルによるDNA損傷メカニズムの分子動力学シミュレーション研究2022

    • 著者名/発表者名
      川波 竜太, 藤原 進, 水口 朋子, 米谷 佳晃, 中村 浩章
    • 学会等名
      量子生命科学会第4回大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] DNAテロメア壊変のReaxFF を用いたMD シミュレーション2022

    • 著者名/発表者名
      石黒 健人, 中村 浩章, 安永 卓生, 藤原 進, 水口 朋子, 中田 彩子, 宮崎 剛, 剣持 貴弘, 波多野 雄治, 斉藤 真司, 米谷 佳晃
    • 学会等名
      2021年度核融合科学研究所一般共同研究(研究会)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [学会発表] Effect of tritium beta decay in deoxy-D-ribose on duplex of telomeric DNA2021

    • 著者名/発表者名
      Kento Ishiguro, Hiroaki Nakamura, Takuo Yasunaga, Susumu Fujiwara, Tomoko Mizuguchi, Ayako Nakata, Tsuyoshi Miyazaki, Takahiro Kenmotsu, Yuji Hatano, Shinji Saito, Yoshiteru Yonetani
    • 学会等名
      The 40th JSST Annual International Conference on Simulation Technology (JSST2021)
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2021-07-13   更新日: 2024-01-30  

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