エクソーム解析による小児喘息発症の個別化医療と創薬のための分子標的遺伝子の探索

• 研究課題/領域番号: 24390251
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 一部基金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 膠原病・アレルギー内科学
• 研究機関: 筑波大学
• 研究代表者: 野口 恵美子 筑波大学, 医学医療系, 教授 (40344882)
• 研究分担者: 岡村 浩司 国立成育医療研究センター, システム発生再生医学研究部, 室長 (80456194)
• 研究期間 (年度): 2012-04-01 – 2016-03-31
• 研究課題ステータス: 完了 (2015年度)
• 配分額: 18,200千円 (直接経費: 14,000千円、間接経費: 4,200千円); 2014年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2013年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円); 2012年度: 9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円)
• キーワード: エクソーム / アレルギー / 気管支喘息

研究成果の概要

本研究では次世代シークエンサーを使用した気管支喘息のエクソーム解析により疾患発症に影響を与えるアレアバリアントの同定をおこなうことを目的とした。喘息患者67名のDNAを使用してエクソーム解析を行い、 Human Genetic Variation Databaseから得られた日本人集団のアレル頻度と比較した。過去の全ゲノム関連解析で検出されている喘息関連領域に存在するバリアントについて検討したところ、IL1RL1とGSDMBのミスセンス変異が喘息と関連している可能性が示唆された。また、喘息関連遺伝子変異候補となる複数のレアバリアントが同定された。

研究成果

• [雑誌論文] Variants near the HLA complex group 22 gene (HCG22) confer increased susceptibility to late-onset asthma in Japanese populations. (2016)
  • 著者名/発表者名: Yatagai Y, Hirota T, Sakamoto T, Yamada H, Masuko H, Kaneko Y, Iijima H, Naito T, Noguchi E, Tamari M, Kubo M, Takahashi A, Konno S, Makita H, Nishimura M, Hijikata M, Keicho N, Homma S, Taguchi Y, Azuma A, Kudoh S, Hizawa N.
  • 雑誌名: J Allergy Clin Immunol 巻: 印刷中 号: 1 ページ: 281-283
  • DOI: 10.1016/j.jaci.2015.11.023
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Role of Lung Function Genes in the Development of Asthma (2015)
  • 著者名/発表者名: Yamada H, Masuko H, Yatagai Y, Sakamoto T, Kaneko Y, Iijima H, Naito T, Noguchi E, Konno S, Nishimura M, Hirota T, Tamari M, Hizawa N
  • 雑誌名: PLoS One 巻: － 号: 1 ページ: e0145832-e0145832
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0145832
  • NAID: 120007129828
  • 査読あり / オープンアクセス / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Identification and Characterization of CD300H, a New Member of the Human CD300 Immunoreceptor Family (2015)
  • 著者名/発表者名: Niizuma K, Tahara-Hanaoka S, Noguchi E, Shibuya A.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem, 290(36):22298-22308, 2015 巻: 290 号: 36 ページ: 22298-22308
  • DOI: 10.1074/jbc.m115.643361
  • NAID: 120007136146
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] T-cell-restricted T-bet overexpression induces aberrant hematopoiesis of myeloid cells and impairs function of macrophages in the lung (2015)
  • 著者名/発表者名: Iriguchi S, Kikuchi N, Kaneko S, Noguchi E, Morishima Y, Matsuyama M, Yoh K, Takahashi S, Nakauchi H, Ishii Y
  • 雑誌名: Blood 巻: 125 号: 2 ページ: 370-82
  • DOI: 10.1182/blood-2014-05-575225
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Influence of MILR1 promoter polymorphism on expression levels and the phenotype of atopy. (2014)
  • 著者名/発表者名: Nanatsue K, Ninomiya T, Tsuchiya M, Tahara-Hanaoka S, Shibuya A, Masuko H, Sakamoto T, Hizawa N, Arinami T, Noguchi E.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 59(9) 号: 9 ページ: 480-483
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.57
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomewide association study identifies HAS2 as a novel susceptibility gene for adult asthma in a Japanese population (2014)
  • 著者名/発表者名: Yatagai Y, Sakamoto T, Yamada H, Masuko H, Kaneko Y, Iijima H, Naito T, Noguchi E, Hirota T, Tamari M, Konno S, Nishimura M, Hizawa N
  • 雑誌名: Clin Exp Allergy 巻: 44 号: 11 ページ: 1327-1334
  • DOI: 10.1111/cea.12415
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide association study for levels of total serum IgE identifies HLA-C in a Japanese population (2013)
  • 著者名/発表者名: Yatagai Y, Sakamoto T, Masuko H, et al
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 8(12) 号: 12 ページ: 1-9
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0080941
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genetic polymorphisms in the IL22 gene are associated with psoriasis vulgaris in a Japanese population. (2013)
  • 著者名/発表者名: Saeki H, Hirota T, Nakagawa H, Tsunemi Y, Kato T, Shibata S, Sato S, Doi S, Miyatake A, Ebe K, Noguchi E, Ebihara T, Amagaii M, Esaki H, Takeuchi S, Furue M, Nakamura Y, Tamari M.
  • 雑誌名: J Dermatol Sci. 巻: 71 号: 2 ページ: 148-150
  • DOI: 10.1016/j.jdermsci.2013.04.002
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional analysis of BRCA1 missense variants of uncertain significance in Japanese breast cancer families (2013)
  • 著者名/発表者名: Kawaku S1, Sato R, Song H, Bando Y, Arinami T, Noguchi E.
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 58(9) 号: 9 ページ: 648-621
  • DOI: 10.1038/jhg.2013.71
  • NAID: 10031195299
  • 査読あり
• [雑誌論文] Asthma Phenotypes in Japanese Adults - Their Associations with the <i>CCL5</i> and <i>ADRB2</i> Genotypes (2013)
  • 著者名/発表者名: Kaneko Y
  • 雑誌名: Allergology International 巻: 62 号: 1 ページ: 113-121
  • DOI: 10.2332/allergolint.12-OA-0467
  • NAID: 130004477174
  • ISSN: 1323-8930, 1440-1592
  • 査読あり
• [雑誌論文] Prevalence of atopic dermatitis in Japanese infants treated with moisturizer since birth and its relation to FLG mutations (2013)
  • 著者名/発表者名: Inoue Y, Nakagawara R, Kambara T, Tanaka K, Seki K, Enomoto H, Noguchi E, Aihara M, Ikezawa Z
  • 雑誌名: Eur J Dermatol 巻: 23(2) 号: 2 ページ: 288-289
  • DOI: 10.1684/ejd.2013.1960
  • 査読あり
• [雑誌論文] Cystatin SN upregulation in patients with seasonal allergic rhinitis (2013)
  • 著者名/発表者名: Imoto Y, Tokunaga T, Matsumoto Y, et al
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 8(8) 号: 8 ページ: e67057-e67057
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0067057
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Distinct Sensitization Pattern Associated with Asthma and the Thymic Stromal Lymphopoietin (<i>TSLP</i>) Genotype (2013)
  • 著者名/発表者名: Iijima H
  • 雑誌名: Allergology International 巻: 62 号: 1 ページ: 123-130
  • DOI: 10.2332/allergolint.12-OA-0488
  • NAID: 130004477178
  • ISSN: 1323-8930, 1440-1592
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Distinct Sensitization Pattern Associated with Asthma and the Thymic Stromal Lymphopoietin (TSLP) Genotype (2013)
  • 著者名/発表者名: Iijima H, Kaneko Y; Yamada H, Yatagai Y, Masuko H, Sakamoto T, Naito T, Hirota T, Tamari M, Konno S, Nishimura M, Noeuchi E, Hizawa N
  • 雑誌名: Allergol Int 巻: 62 ページ: 123-130
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide association study identifies eight new susceptibility loci for atopic dermatitis in the Japanese population. (2012)
  • 著者名/発表者名: Hirota T
  • 雑誌名: Nat Genet 巻: 44 号: 11 ページ: 1222-6
  • DOI: 10.1038/ng.2438
  • 査読あり
• [雑誌論文] Generation of induced pluripotent stem cells from human nasal epithelial cells using a Sendai virus vector (2012)
  • 著者名/発表者名: Ono M, Hamada Y, Horiuchi Y, Matsuo-Takasaki M, Imoto Y, Satomi K, Arinami T, Hasegawa M, Fujioka T, Nakamura Y, Noguchi E
  • 雑誌名: PLoS One 巻: 7 号: 8 ページ: e42855-e42855
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0042855
  • 査読あり
• [雑誌論文] Association of adiponectin polymorphism with cord blood adiponectin concentrations and intrauterine growth (2012)
  • 著者名/発表者名: Saito M, Kamoda T, Nishimura K, Miyazono Y, Kanai Y, Kato Y, Iwabuchi A, Fukushima H, Hamada H, Arinami T, Sumazaki R, Noeuchi E
  • 雑誌名: J Hum Genet 巻: 57 ページ: 109-114
  • 査読あり
• [学会発表] 次世代シークエンサーを用いたゲノム解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 野口恵美子
  • 学会等名: 第64回日本アレルギー学会学術大会
  • 発表場所: 東京 グランドプリンスホテル新高輪
  • 年月日: 2015-05-27
  • 招待講演
• [学会発表] 次世代シークエンサーとアレルギー疾患：どのように使えるのか？ (2014)
  • 著者名/発表者名: 野口恵美子
  • 学会等名: 第26回日本アレルギー学会春季臨床大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-05-09
  • 招待講演
• [学会発表] 中高年発症喘息（late onset asthma：LOA）を対象とした網羅的遺伝子解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 谷田貝洋平 山田英恵 金子美子 増子裕典 坂本 透 野口恵美子 飯島弘晃 内藤隆志 広田朝光 玉利真由美 檜澤伸之
  • 学会等名: 第26回日本アレルギー学会春季臨床大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-05-09
• [学会発表] 健常人における吸入抗原のアレルギー感作に対するゲノム網羅的関連解析 (2014)
  • 著者名/発表者名: 山田英恵 谷田貝洋平 増子裕典 飯島弘晃 内藤隆志 坂本 透 野口恵美子 広田朝光 玉利真由美 檜澤伸之
  • 学会等名: 第26回日本アレルギー学会春季臨床大会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2014-05-09
• [学会発表] アトピー性疾患の感受遺伝子探索：次世代シークエンサーの管理と今後課題 (2013)
  • 著者名/発表者名: 野口恵美子
  • 学会等名: 東京女子医科大学第９回 テニュアトラック教員支援セミナー
  • 発表場所: 東京
  • 招待講演
• [学会発表] アトピー素因ってなんだろう」～アレルギーは遺伝するの？ (2013)
  • 著者名/発表者名: 野口恵美子
  • 学会等名: 第30回日本難治性喘息・アレルギー疾患学会
  • 発表場所: 茨城県つくば市
  • 招待講演
• [学会発表] 次世代シークエンサのアレルギー疾患研究への応用 (2012)
  • 著者名/発表者名: 野口 恵美子
  • 学会等名: 第24回アレルギー学会春季臨床大会
  • 発表場所: 大阪国際会議場
  • 年月日: 2012-05-12