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ヒト幹細胞培養系に出現する異質細胞の非侵襲的検出法の開発とその出現機構の解明

公募研究

研究領域シンギュラリティ生物学
研究課題/領域番号 19H05418
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

配分区分補助金
審査区分 複合領域
研究機関東京医科歯科大学

研究代表者

難波 大輔  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 准教授 (10380255)

研究期間 (年度) 2019-04-01 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
8,580千円 (直接経費: 6,600千円、間接経費: 1,980千円)
2020年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
2019年度: 4,290千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 990千円)
キーワード表皮幹細胞 / 機械学習 / 表皮角化幹細胞
研究開始時の研究の概要

重度熱傷などへの再生医療に用いられている培養ヒト表皮幹細胞は、自己複製を繰り返しながら、幹細胞コロニーを形成する。しかしながら、突如として幹細胞コロニー内に自己複製能を消失した異質な細胞が生まれ、この均一な幹細胞集団内に生まれた一つの異質な細胞=シンギュラリティ細胞が、幹細胞集団そのものを消失させる。本研究では、ヒト表皮幹細胞コロニーに突如現れる異質細胞を、非侵襲的に細胞運動速度の変化から検出する手法を開発し、異質細胞の出現時の環境を明らかにすることで、異質細胞出現機構を解明し、またヒト表皮幹細胞培養の品質管理法として応用することを目指す。

研究実績の概要

重度熱傷などへの再生医療に用いられている培養ヒト表皮幹細胞は、自己複製を繰り返しながら、幹細胞コロニーを形成する。しかしながら、突如として幹細胞コロニー内に自己複製能を消失した異質な細胞が生まれる。このような異質細胞が出現した幹細胞コロニーでは、連鎖的に他の多くの幹細胞が分裂停止し、分化した分裂停止コロニーへと形質転換する。すなわち、均一な幹細胞集団内に生まれた一つの異質な細胞=シンギュラリティ細胞が、幹細胞集団そのものを消失させる。この異質細胞の出現は、再生医療の大きなリスクとなっている。異質細胞出現の機構は不明であるが、申請者らの研究から、異質細胞は細胞運動能が低下していることが明らかとなっている(Nanba et al., EMBO Mol. Med. 2013: Nanba et al., J. Cell Biol. 2015など)。

本研究では、深層学習による画像認識と、状態空間モデルによる物体追跡を組み合わせた新しい自動細胞追跡システム (Deep learning-based automated cell tracking: DeepACT)を開発することに成功した。このDeepACTを用いて、ヒト表皮細胞コロニーの個々の細胞の運動解析から、幹細胞コロニーに特徴的な細胞の運動パターンを同定した。さらに、速度の低下した異質細胞を非侵襲的に識別し、分裂停止に至るコロニーを事前に予測することに成功した。以上の成果を応用することで、異質細胞=シンギュラリティ細胞の出現機構の解明が期待される。

現在までの達成度 (段落)

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

今後の研究の推進方策

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

報告書

(2件)
  • 2020 実績報告書
  • 2019 実績報告書
  • 研究成果

    (10件)

すべて 2021 2019

すべて 雑誌論文 (8件) (うち国際共著 3件、 査読あり 8件、 オープンアクセス 5件) 学会発表 (2件) (うち国際学会 2件、 招待講演 1件)

  • [雑誌論文] Label-free quality control and identification of human keratinocyte stem cells by deep learning-based automated cell tracking2021

    • 著者名/発表者名
      Hirose T, Kotoku J, Toki F, Nishimura EK, Nanba D
    • 雑誌名

      Stem Cells

      巻: 39 号: 8 ページ: 1091

    • DOI

      10.1002/stem.3371

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Stem cell competition orchestrates skin homeostasis and ageing2019

    • 著者名/発表者名
      Liu N, Matsumura H, Kato T, Ichinose S, Takada A, Namiki T, Asakawa K, Morinaga H, Mohri Y, De Arcangelis A, Geroges-Labouesse E, Nanba D, Nishimura EK
    • 雑誌名

      Nature

      巻: 568(7752) 号: 7752 ページ: 344-350

    • DOI

      10.1038/s41586-019-1085-7

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] IGF-1R Deficiency in Human Keratinocytes Disrupts Epidermal Homeostasis and Stem Cell Maintenance2019

    • 著者名/発表者名
      Muraguchi T, Nanba D, Nishimura EK, Tashiro T.
    • 雑誌名

      J Dermatol Sci

      巻: 94 号: 2 ページ: 298-305

    • DOI

      10.1016/j.jdermsci.2019.05.001

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Noninvasive Measurement of Cell/Colony Motion Using Image Analysis Methods to Evaluate the Proliferative Capacity of Oral Keratinocytes as a Tool for Quality Control in Regenerative Medicine2019

    • 著者名/発表者名
      Hoshikawa E, Sato T, Kimori Y, Suzuki A, Haga K, Kato H, Tabeta K,?Nanba D, Izumi K.
    • 雑誌名

      J Tissue Eng

      巻: 10 ページ: 204173141988152-204173141988152

    • DOI

      10.1177/2041731419881528

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Human keratinocyte stem cells: From cell biology to cell therapy.2019

    • 著者名/発表者名
      Nanba D.
    • 雑誌名

      J Dermatol Sci

      巻: 96 号: 2 ページ: 66-72

    • DOI

      10.1016/j.jdermsci.2019.10.002

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Valve Interstitial Cell-Specific Cyclooxygenase-1 Associated With Calcification of Aortic Valves.2019

    • 著者名/発表者名
      Sakaue T, Hamaguchi M, Aono J, Nakashiro KI, Shikata F, Kawakami N, Oshima Y, Kurata M,?Nanba D, Masumoto J, Yamaguchi O, Higashiyama S, Izutani H.
    • 雑誌名

      Ann Thorac Surg

      巻: S0003-4975 号: 1 ページ: 31717-5

    • DOI

      10.1016/j.athoracsur.2019.09.085

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Automated collective motion analysis validates human keratinocyte stem cell cultures.2019

    • 著者名/発表者名
      Kinoshita K, Munesue T, Toki F, Isshiki M, Higashiyama S, Barrandon Y, Nishimura EK, Yanagihara Y,?Nanba D.
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 9 号: 1 ページ: 18725-18725

    • DOI

      10.1038/s41598-019-55279-4

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Evaluation of the proliferative potential of skin keratinocytes and fibroblasts isolated from critical limb ischemia patients.2019

    • 著者名/発表者名
      Toki F,?Nanba D, Nishimura EK, Matsuzaki K.
    • 雑誌名

      Regen Ther

      巻: 14 ページ: 222-226

    • DOI

      10.1016/j.reth.2020.03.016

    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] Tracing stem cell motion in human keratinocyte colonies using deep learning-based object tracking2019

    • 著者名/発表者名
      Nanba D
    • 学会等名
      1st Japan-Singapore International Skin Conference
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Label-free identification of human keratinocyte stem cells by deep learning-based quantitative cell motion analysis.2019

    • 著者名/発表者名
      Nanba D, Hirose T, Toki F, Nishimura EK, Kotoku J.
    • 学会等名
      49th Annual European Society for Dermatological Research (ESDR) Meeting
    • 関連する報告書
      2019 実績報告書
    • 国際学会

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公開日: 2019-04-18   更新日: 2021-12-27  

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