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微量組織検体における不適正率をゼロにするデジタル細胞診

研究課題

研究課題/領域番号 20K16947
研究種目

若手研究

配分区分基金
審査区分 小区分53010:消化器内科学関連
研究機関旭川医科大学

研究代表者

林 明宏  旭川医科大学, 医学部, 客員助教 (30459573)

研究期間 (年度) 2020-04-01 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2021年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2020年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワード膵癌 / 低侵襲診断 / デジタルPCR / ドライバー遺伝子 / digital PCR / digital 細胞診 / リキッドバイオプシー / 膵腫瘍 / ゲノム診断
研究開始時の研究の概要

本研究では、微量核酸の絶対定量に威力を発揮するデジタルPCRを用いて、少量の細胞・組織検体でもドライバー変異を確実に検出することで、腫瘍の存在診断を可能にする検出系を確立する。実地臨床において迅速かつ安価に運用可能なシステムを提供する具体的方法として、「ナノ液滴への細胞・核酸封入」によるシングルセル解析を提案する。特に、消化器癌において高頻度にみられるKRASなどの遺伝子変異を複数同時に検出できれば、形態学に基づく画像・病理診断を補填し、がん診療に大きく貢献できる。

研究成果の概要

膵癌の確定診断のため行われる組織診は、試料の採取料不足のため検体不適と判定される場合が多い。本研究では微量検体から、癌細胞のもつ遺伝子異常を正確に判定する技術開発を目指した。膵腫瘍患者から提供された針生検等の残余検体を試料に、微量核酸の絶対定量が可能なデジタルPCR装置を用いて、「液滴への核酸封入」によりドライバー変異を検出する方法を開発した(Water-burst法)。本法では生検等の生体試料から核酸抽出をスキップし、KRAS変異を有無を迅速に検出できる利点がある。さらに各種変異型KRASに対する特異的プローブの混合比を調整することにより、特定の変異タイプを特定することが可能となった。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本法の実用化により、検体不良(insufficient material)に起因する再生検を減少させることができ、このことは患者への侵襲低減と医療費削減の双方に貢献できる。超微小検体から確実に癌の存在・質的情報が得られれば、再発や薬剤耐性が疑われる場合に、細径穿刺針を用いて少量の組織サンプルを採取し、仮に病理学的な判定ができずとも、遺伝子異常プロファイルを得ることも可能となる。

報告書

(3件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2022 2021 2020

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件、 オープンアクセス 3件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] Mutant GNAS limits tumor aggressiveness in established pancreatic cancer via antagonizing the KRAS-pathway2022

    • 著者名/発表者名
      Kawabata Hidemasa、Ono Yusuke、Tamamura Nobue、Oyama Kyohei、Ueda Jun、Sato Hiroki、Takahashi Kenji、Taniue Kenzui、Okada Tetsuhiro、Fujibayashi Syugo、Hayashi Akihiro、ほか
    • 雑誌名

      Journal of Gastroenterology

      巻: 57 号: 3 ページ: 208-220

    • DOI

      10.1007/s00535-021-01846-4

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Prognostic significance of skeletal muscle decrease in unresectable pancreatic cancer: Survival analysis using the Weibull exponential distribution model2021

    • 著者名/発表者名
      Sato Hiroki、Goto Takuma、Hayashi Akihiro、Kawabata Hidemasa、Okada Tetsuhiro、Takauji Shuhei、Sasajima Junpei、Enomoto Katsuro、Fujiya Mikihiro、Oyama Kyohei、Ono Yusuke、Sugitani Ayumu、Mizukami Yusuke、Okumura Toshikatsu
    • 雑誌名

      Pancreatology

      巻: 21 号: 5 ページ: 892-902

    • DOI

      10.1016/j.pan.2021.03.002

    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Time-saving method for directly amplifying and capturing a minimal amount of pancreatic tumor-derived mutations from fine-needle aspirates using digital PCR2020

    • 著者名/発表者名
      Ono Y, Hayashi A, Maeda C, Suzuki M, Wada R, Sato H, Kawabata H, Okada T, Goto T, Karasaki H, Mizukami Y, Okumura T
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 10

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] 十二指腸液由来遊離核酸を用いた膵癌リキッドバイオプシーの有用性.2022

    • 著者名/発表者名
      高橋賢治、林 明宏、水上裕輔.
    • 学会等名
      第108回日本消化器病学会総会 ワークショップ16:胆膵疾患の遺伝子解析による病態解明・臨床展開
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 膵多発SPN(solid-pseudopapillary neoplasm)の1例.2021

    • 著者名/発表者名
      林 明宏、佐藤裕基、藤林周吾、河端秀賢、岩本英孝、高橋賢治、後藤拓磨、山北圭介、北野陽平、水上裕輔、奥村利勝.
    • 学会等名
      第52回日本膵臓学会大会 一般演題(ポスター)P10-3
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 切除不能膵癌化学療法例において骨格筋量低下は予後不良因子である.2021

    • 著者名/発表者名
      佐藤裕基、岡田哲弘、河端秀賢、林明宏、藤林周吾1、後藤拓磨、小野裕介、杉谷 歩、水上裕輔、藤谷幹浩、奥村利勝.
    • 学会等名
      第107回日本消化器病学会総会 口演:膵3
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] EUS-FNA検体と血清を用いた膵癌診断における長鎖ノンコーディングRNAの有用性.2021

    • 著者名/発表者名
      高橋賢治、小山一也、川尻はるな、佐藤裕基、藤林周吾、林 明宏、河端秀賢、岩本英孝、後藤拓磨、山北圭介、北野陽平、水上裕輔、奥村利勝.
    • 学会等名
      第52回日本膵臓学会大会 ワークショップ5:リキッドバイオプシー、内視鏡下採取検体による分子プロファイリング
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] FNB微量検体を用いたデジタルPCRによる膵癌の新規診断技術の開発:Water-burst 遺伝子解析法2021

    • 著者名/発表者名
      林 明宏、水上裕輔、佐藤裕基、岡田哲弘、河端秀賢、後藤拓磨、唐崎秀則、奥村利勝
    • 学会等名
      第51回日本膵臓学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書

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公開日: 2020-04-28   更新日: 2023-01-30  

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