研究課題
基盤研究(C)
RNA-seqによる解析結果から、Ensemblに登録されている48種類のABCトランスポーター全502種類のスプライスバリアントについて、正常組織と癌組織・大腸癌細胞株の発現量を比較したところ、大腸癌特異的なバリアントの候補として71種類が抽出された。これらの中で、ABCA12のスプライスバリアントであるENST00000513511はRNA-seqの結果をRT-qPCRで再現することができた。このことからENST00000513511は大腸癌特異的なスプライスバリアントの可能性が高いと考えられた。
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